Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UU35

Protein Details
Accession Q0UU35    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-354AEENRLKREKEERKRRLAALEKKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-224KILTKKERLALRAEASAVAKGKKPVAGAPQRPTDAKGAPVPEKKK
335-360RLKREKEERKRRLAALEKKAAAKRKY
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG pno:SNOG_04729  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSIVDPNAPKTTPAPKPAVPAAAPKPAPRPTGGANGVAQSPQLKRKASGPVESSQVKLQRKDGSGQPAQGNVAGRPMATPGAGRPNPPPALTTVPYRGTAAPAGTRVASPVVKKPISQANTPSGPPKAAAPAPKPAPPAAASSAAASAAPKKGYLALLQKAKEKDATKPPAPPVQNGPTKILTKKERLALRAEASAVAKGKKPVAGAPQRPTDAKGAPVPEKKKPLDVGYQGTARPTKQPVPVGYKGTARPTSAPASTSRNGTPAARSKPQPAKGRYDGYADWSDLDDMDDEEEDYASDGSSDMEGGVWDLQEEEQMALKVAKKEDAEALAEENRLKREKEERKRRLAALEKKAAAKRKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.5
4 0.52
5 0.53
6 0.45
7 0.46
8 0.44
9 0.47
10 0.46
11 0.44
12 0.47
13 0.48
14 0.49
15 0.43
16 0.42
17 0.37
18 0.45
19 0.44
20 0.39
21 0.34
22 0.33
23 0.32
24 0.27
25 0.24
26 0.19
27 0.21
28 0.25
29 0.3
30 0.3
31 0.31
32 0.37
33 0.46
34 0.47
35 0.5
36 0.47
37 0.44
38 0.48
39 0.48
40 0.44
41 0.4
42 0.42
43 0.4
44 0.39
45 0.42
46 0.43
47 0.44
48 0.46
49 0.47
50 0.48
51 0.46
52 0.48
53 0.45
54 0.39
55 0.37
56 0.35
57 0.3
58 0.21
59 0.2
60 0.16
61 0.14
62 0.12
63 0.13
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.2
69 0.21
70 0.23
71 0.24
72 0.31
73 0.32
74 0.32
75 0.3
76 0.24
77 0.29
78 0.29
79 0.31
80 0.28
81 0.28
82 0.29
83 0.3
84 0.26
85 0.22
86 0.22
87 0.19
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.19
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.29
102 0.35
103 0.36
104 0.37
105 0.35
106 0.34
107 0.36
108 0.37
109 0.36
110 0.28
111 0.25
112 0.23
113 0.2
114 0.18
115 0.18
116 0.22
117 0.22
118 0.28
119 0.3
120 0.32
121 0.33
122 0.29
123 0.28
124 0.24
125 0.25
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.13
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.14
142 0.17
143 0.21
144 0.25
145 0.26
146 0.31
147 0.31
148 0.31
149 0.32
150 0.28
151 0.3
152 0.35
153 0.4
154 0.37
155 0.41
156 0.43
157 0.45
158 0.44
159 0.4
160 0.36
161 0.36
162 0.38
163 0.36
164 0.36
165 0.32
166 0.33
167 0.33
168 0.34
169 0.31
170 0.31
171 0.33
172 0.36
173 0.36
174 0.35
175 0.38
176 0.34
177 0.32
178 0.28
179 0.25
180 0.2
181 0.17
182 0.17
183 0.14
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.23
192 0.31
193 0.35
194 0.38
195 0.41
196 0.41
197 0.41
198 0.4
199 0.34
200 0.26
201 0.23
202 0.21
203 0.21
204 0.26
205 0.32
206 0.34
207 0.36
208 0.43
209 0.41
210 0.43
211 0.42
212 0.39
213 0.39
214 0.4
215 0.38
216 0.34
217 0.35
218 0.31
219 0.31
220 0.29
221 0.23
222 0.23
223 0.23
224 0.24
225 0.27
226 0.32
227 0.35
228 0.41
229 0.44
230 0.44
231 0.42
232 0.42
233 0.39
234 0.41
235 0.38
236 0.31
237 0.29
238 0.29
239 0.3
240 0.27
241 0.26
242 0.22
243 0.27
244 0.27
245 0.29
246 0.25
247 0.24
248 0.24
249 0.24
250 0.27
251 0.29
252 0.34
253 0.36
254 0.38
255 0.45
256 0.53
257 0.6
258 0.64
259 0.6
260 0.62
261 0.63
262 0.65
263 0.58
264 0.54
265 0.46
266 0.42
267 0.4
268 0.31
269 0.26
270 0.22
271 0.2
272 0.15
273 0.16
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.12
306 0.16
307 0.2
308 0.21
309 0.25
310 0.23
311 0.26
312 0.28
313 0.28
314 0.26
315 0.23
316 0.25
317 0.23
318 0.24
319 0.24
320 0.23
321 0.26
322 0.28
323 0.28
324 0.31
325 0.4
326 0.49
327 0.58
328 0.66
329 0.71
330 0.78
331 0.84
332 0.82
333 0.82
334 0.81
335 0.8
336 0.79
337 0.79
338 0.72
339 0.73
340 0.75