Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0USD1

Protein Details
Accession Q0USD1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-74LFALRPEWQARQKKKHGRQLRILSIDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-276TKKIPRSKAEKKAK
Subcellular Location(s) mito 22, cyto_mito 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039197  Mrs1/Cce1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR015242  Ydc2_cat  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0000402  F:crossed form four-way junction DNA binding  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0070336  F:flap-structured DNA binding  
GO:0000403  F:Y-form DNA binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
KEGG pno:SNOG_05333  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09159  Ydc2-catalyt  
CDD cd16963  CCE1  
Amino Acid Sequences MPPKLPPKPRPVTAKALQALLTRIGSASSGTKDVLHERFQRDVAHSRLFALRPEWQARQKKKHGRQLRILSIDMGIKNLAFCDVSVDYKNGNATNPTMDIMRWDKINLVDATRDLRRPGLQAKDHAKDAEDVDPYSLPVLSRTAYWFIKQEVLAVAPDIILIESQRWRSAGSAAILQWTVRVNTLEAMLWAVLETLRTERLTSPSKIKNEESCKLDFEVYGVDPKRVGQFWLAQHARARAEDLDQAVEALALEDTPPTTKAATKKIPRSKAEKKAKIALLRSWLSIEPASTASSTPDSSPVISINIGPAAVMAREALRLPAPGKEEKTKNTKSSEEGKDIKKLDDITDCCLQAAAWIAWESNRLQLYNVWDAKRGKDKNLTELDDGILRDMVEVAGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.65
3 0.59
4 0.54
5 0.46
6 0.42
7 0.36
8 0.3
9 0.21
10 0.18
11 0.16
12 0.14
13 0.13
14 0.14
15 0.13
16 0.14
17 0.15
18 0.16
19 0.18
20 0.25
21 0.27
22 0.32
23 0.37
24 0.39
25 0.43
26 0.44
27 0.45
28 0.43
29 0.47
30 0.45
31 0.43
32 0.39
33 0.38
34 0.41
35 0.38
36 0.35
37 0.31
38 0.32
39 0.34
40 0.39
41 0.43
42 0.47
43 0.57
44 0.65
45 0.72
46 0.76
47 0.8
48 0.84
49 0.88
50 0.89
51 0.88
52 0.89
53 0.88
54 0.87
55 0.8
56 0.71
57 0.61
58 0.53
59 0.47
60 0.37
61 0.28
62 0.18
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.07
68 0.07
69 0.1
70 0.11
71 0.14
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.2
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.16
87 0.18
88 0.18
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.17
93 0.23
94 0.2
95 0.18
96 0.17
97 0.18
98 0.22
99 0.22
100 0.23
101 0.18
102 0.2
103 0.2
104 0.23
105 0.28
106 0.32
107 0.32
108 0.39
109 0.45
110 0.45
111 0.46
112 0.42
113 0.37
114 0.31
115 0.3
116 0.26
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.1
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.18
137 0.18
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.05
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.13
188 0.17
189 0.19
190 0.25
191 0.3
192 0.33
193 0.36
194 0.37
195 0.4
196 0.42
197 0.45
198 0.42
199 0.37
200 0.36
201 0.33
202 0.31
203 0.23
204 0.17
205 0.14
206 0.11
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.11
216 0.16
217 0.17
218 0.27
219 0.26
220 0.25
221 0.27
222 0.29
223 0.28
224 0.23
225 0.24
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.11
247 0.15
248 0.23
249 0.32
250 0.39
251 0.49
252 0.57
253 0.65
254 0.66
255 0.72
256 0.74
257 0.76
258 0.79
259 0.77
260 0.73
261 0.73
262 0.73
263 0.7
264 0.63
265 0.56
266 0.52
267 0.45
268 0.41
269 0.34
270 0.29
271 0.25
272 0.22
273 0.18
274 0.13
275 0.12
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.11
306 0.11
307 0.15
308 0.19
309 0.23
310 0.28
311 0.35
312 0.4
313 0.45
314 0.54
315 0.57
316 0.59
317 0.59
318 0.58
319 0.55
320 0.6
321 0.59
322 0.58
323 0.58
324 0.56
325 0.58
326 0.56
327 0.52
328 0.46
329 0.41
330 0.36
331 0.37
332 0.36
333 0.33
334 0.36
335 0.35
336 0.31
337 0.29
338 0.25
339 0.17
340 0.2
341 0.15
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.19
350 0.17
351 0.18
352 0.21
353 0.27
354 0.34
355 0.39
356 0.35
357 0.4
358 0.42
359 0.47
360 0.54
361 0.52
362 0.5
363 0.54
364 0.56
365 0.59
366 0.66
367 0.64
368 0.56
369 0.53
370 0.47
371 0.41
372 0.37
373 0.29
374 0.21
375 0.16
376 0.14
377 0.13