Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0TX52

Protein Details
Accession Q0TX52    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-88SDEDRRYRKRSYSHSSPRSRSGSRSSRRRSHSPGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-90RRYRKRSYSHSSPRSRSGSRSSRRRSHSPGST
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR001632  Gprotein_B  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0051568  P:histone H3-K4 methylation  
KEGG pno:SNOG_15874  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MDGTRSISPKRPREEEDGYGDEPPRKRSASRTPPGASPTYRIAERPARRYSRDESDEDRRYRKRSYSHSSPRSRSGSRSSRRRSHSPGSTPPPPKPTSLNYKPTLILRGHKKPISIIRFSPDGRYIASGSSDCTIKLWNSTTGTLEHSLEGHLAGISALTWSPDSRILASGSDDKSIRLWDTQKGLAHPTPLLGHHNYVYSLCFSPKGNMLVSGSYDEAVFLWDVRAARVMRSLPAHSDPVSSVDFVRDGTLIVSCSHDGLIRVWDTATGQCLRTIVHEDNAPVTCVRFSPNGKYILAWTLDSCIRLWNYIEGKGKCVKTYQGHVNKTYSLSGAFGTYGAGREHAFVASGDEDGVVVLWDVSSKNVLQRLEGHEGAVMSVDTHPSEELMASAGLDRTVRIWRAGNDRVNGVREAEVKQEHETNGSDPETLPPTPFVET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.68
3 0.66
4 0.62
5 0.55
6 0.51
7 0.49
8 0.46
9 0.43
10 0.41
11 0.39
12 0.37
13 0.38
14 0.43
15 0.51
16 0.56
17 0.61
18 0.65
19 0.63
20 0.65
21 0.67
22 0.64
23 0.55
24 0.48
25 0.45
26 0.41
27 0.39
28 0.35
29 0.37
30 0.41
31 0.47
32 0.51
33 0.55
34 0.57
35 0.6
36 0.65
37 0.65
38 0.65
39 0.63
40 0.6
41 0.57
42 0.6
43 0.65
44 0.65
45 0.67
46 0.63
47 0.62
48 0.63
49 0.64
50 0.62
51 0.63
52 0.67
53 0.7
54 0.74
55 0.8
56 0.83
57 0.81
58 0.81
59 0.78
60 0.72
61 0.66
62 0.65
63 0.65
64 0.65
65 0.71
66 0.72
67 0.74
68 0.78
69 0.81
70 0.79
71 0.78
72 0.78
73 0.75
74 0.76
75 0.74
76 0.76
77 0.73
78 0.7
79 0.68
80 0.6
81 0.54
82 0.5
83 0.48
84 0.49
85 0.53
86 0.57
87 0.52
88 0.53
89 0.52
90 0.49
91 0.48
92 0.4
93 0.38
94 0.39
95 0.45
96 0.49
97 0.49
98 0.48
99 0.48
100 0.55
101 0.54
102 0.49
103 0.43
104 0.39
105 0.42
106 0.42
107 0.4
108 0.34
109 0.28
110 0.24
111 0.24
112 0.21
113 0.17
114 0.18
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.13
124 0.14
125 0.16
126 0.18
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.21
131 0.2
132 0.18
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.08
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.04
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.06
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.13
157 0.17
158 0.16
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.2
169 0.22
170 0.23
171 0.23
172 0.27
173 0.24
174 0.23
175 0.2
176 0.17
177 0.15
178 0.15
179 0.17
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.14
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.1
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.18
224 0.15
225 0.16
226 0.14
227 0.15
228 0.15
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.18
268 0.19
269 0.18
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.12
275 0.14
276 0.16
277 0.22
278 0.27
279 0.29
280 0.29
281 0.29
282 0.28
283 0.27
284 0.26
285 0.2
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.18
296 0.19
297 0.25
298 0.33
299 0.3
300 0.34
301 0.39
302 0.39
303 0.34
304 0.34
305 0.34
306 0.31
307 0.37
308 0.44
309 0.47
310 0.51
311 0.53
312 0.53
313 0.49
314 0.46
315 0.4
316 0.3
317 0.21
318 0.17
319 0.14
320 0.12
321 0.1
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.04
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.07
350 0.08
351 0.12
352 0.17
353 0.17
354 0.18
355 0.24
356 0.3
357 0.34
358 0.34
359 0.3
360 0.27
361 0.27
362 0.25
363 0.2
364 0.13
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.15
385 0.16
386 0.18
387 0.22
388 0.27
389 0.35
390 0.44
391 0.48
392 0.45
393 0.49
394 0.5
395 0.48
396 0.44
397 0.38
398 0.33
399 0.3
400 0.29
401 0.3
402 0.3
403 0.3
404 0.32
405 0.35
406 0.32
407 0.32
408 0.32
409 0.27
410 0.29
411 0.27
412 0.25
413 0.21
414 0.24
415 0.25
416 0.24
417 0.23
418 0.21