Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0V5C3

Protein Details
Accession Q0V5C3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32PRGYERDRSRSPRGERRDVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-175KARRARPRTPTPGKYYGPPKREFGGRGGGGPRGG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048026  P:positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pno:SNOG_00791  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MINAATMRRADEPRGYERDRSRSPRGERRDVDSSRARSASPGGGRDDRYVFSRNEEDDDPGSRNSGSNLFVTGIHPSLTEEEVTRLFEKYGEVEQCNIMRDPHTKDSRGFGFVKMVTAEQADAAKEGLQGEVHQGRTLSIEKARRARPRTPTPGKYYGPPKREFGGRGGGGPRGGGSRYGDRYSDDRRGGYGRRDDYGSRSSRYDDRGYGGGGGGGGGGGYGSRRDDYGPRGVDRYASDRGYSGRDSGREDRRGGGGGGGGGYYDRPPPPAAGAGSYDSAPPPREAYSGGRSYDGDYDRSHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.52
4 0.57
5 0.62
6 0.65
7 0.67
8 0.69
9 0.7
10 0.76
11 0.78
12 0.79
13 0.81
14 0.75
15 0.75
16 0.75
17 0.68
18 0.66
19 0.64
20 0.6
21 0.55
22 0.52
23 0.45
24 0.37
25 0.38
26 0.38
27 0.33
28 0.32
29 0.32
30 0.35
31 0.37
32 0.39
33 0.38
34 0.32
35 0.31
36 0.32
37 0.27
38 0.28
39 0.3
40 0.28
41 0.3
42 0.3
43 0.29
44 0.27
45 0.29
46 0.27
47 0.22
48 0.22
49 0.18
50 0.18
51 0.16
52 0.17
53 0.16
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.18
81 0.2
82 0.21
83 0.22
84 0.21
85 0.16
86 0.16
87 0.19
88 0.24
89 0.3
90 0.34
91 0.34
92 0.35
93 0.39
94 0.38
95 0.39
96 0.33
97 0.25
98 0.25
99 0.23
100 0.23
101 0.18
102 0.16
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.09
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.14
127 0.19
128 0.22
129 0.29
130 0.36
131 0.41
132 0.46
133 0.5
134 0.55
135 0.6
136 0.66
137 0.68
138 0.67
139 0.66
140 0.68
141 0.62
142 0.58
143 0.59
144 0.56
145 0.54
146 0.51
147 0.46
148 0.41
149 0.43
150 0.39
151 0.32
152 0.31
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.23
157 0.2
158 0.18
159 0.15
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.14
165 0.17
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.23
170 0.27
171 0.31
172 0.28
173 0.26
174 0.26
175 0.29
176 0.3
177 0.32
178 0.34
179 0.29
180 0.29
181 0.31
182 0.31
183 0.32
184 0.36
185 0.33
186 0.28
187 0.28
188 0.29
189 0.31
190 0.35
191 0.33
192 0.27
193 0.26
194 0.25
195 0.25
196 0.22
197 0.18
198 0.13
199 0.1
200 0.08
201 0.05
202 0.04
203 0.03
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.03
208 0.03
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.08
213 0.12
214 0.16
215 0.24
216 0.27
217 0.28
218 0.29
219 0.29
220 0.3
221 0.29
222 0.3
223 0.27
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.24
228 0.25
229 0.24
230 0.22
231 0.21
232 0.22
233 0.28
234 0.35
235 0.43
236 0.44
237 0.44
238 0.43
239 0.41
240 0.41
241 0.35
242 0.27
243 0.19
244 0.15
245 0.13
246 0.11
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.16
256 0.18
257 0.21
258 0.21
259 0.19
260 0.21
261 0.22
262 0.22
263 0.21
264 0.19
265 0.17
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.18
270 0.19
271 0.2
272 0.23
273 0.27
274 0.32
275 0.35
276 0.35
277 0.34
278 0.33
279 0.34
280 0.38
281 0.34
282 0.29