Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UGR2

Protein Details
Accession Q0UGR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSDPEKKRKRKSDSGVRPKKKVAIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-21KKRKRKSDSGVRPKKK
400-415LPLKFPRVGGPRKSRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.333, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0001188  P:RNA polymerase I preinitiation complex assembly  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
KEGG pno:SNOG_09052  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSDPEKKRKRKSDSGVRPKKKVAIAPQGTVKVELHENKETLGPLLEGASEQLLLQSSEHSRLDYTAQEEFDGSSESQLKDYVGVFDPATKKLQLVPVKRVTLRSTLRSETEEMREQKEKTEAQQQTMMAKRNALASEFGSKKSRKALDDMTMNAIRSGKPDDPASARNDAVAENILQNMAGATGAMPTKQEMEAAVDSSKPRPTPNLQAEYPGDVYPIESIVGSELMTMIEVKDWVDAAAAGQNINVTSKFVAKRIVKLARNKQIQKLKVLRFILFCINFSQALQSSKGGKKIPPKGKLEAIMGEDVPQSCIMAIRRKFAREGWNVDNLHTHIAAAALIVDDFEVDVNDLRDDLKIDNKEIQAYFAELGCKVSAPTAADLTKFKLSKAESNNHWVAKLKLPLKFPRVGGPRKSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.94
3 0.92
4 0.89
5 0.84
6 0.81
7 0.75
8 0.72
9 0.7
10 0.7
11 0.67
12 0.65
13 0.65
14 0.62
15 0.57
16 0.51
17 0.41
18 0.33
19 0.35
20 0.35
21 0.35
22 0.35
23 0.35
24 0.33
25 0.35
26 0.33
27 0.26
28 0.22
29 0.17
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.11
43 0.13
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.18
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.16
59 0.13
60 0.13
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.15
71 0.14
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.24
76 0.21
77 0.2
78 0.22
79 0.3
80 0.32
81 0.36
82 0.42
83 0.47
84 0.51
85 0.53
86 0.53
87 0.47
88 0.48
89 0.48
90 0.45
91 0.43
92 0.41
93 0.41
94 0.4
95 0.41
96 0.36
97 0.36
98 0.38
99 0.35
100 0.37
101 0.4
102 0.38
103 0.38
104 0.4
105 0.36
106 0.32
107 0.39
108 0.37
109 0.35
110 0.38
111 0.37
112 0.37
113 0.4
114 0.41
115 0.31
116 0.3
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.21
121 0.18
122 0.15
123 0.22
124 0.23
125 0.24
126 0.27
127 0.27
128 0.28
129 0.35
130 0.38
131 0.32
132 0.35
133 0.38
134 0.38
135 0.41
136 0.4
137 0.38
138 0.34
139 0.33
140 0.29
141 0.24
142 0.18
143 0.16
144 0.19
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.21
150 0.24
151 0.25
152 0.24
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.18
157 0.15
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.03
168 0.02
169 0.02
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.12
188 0.12
189 0.15
190 0.19
191 0.27
192 0.33
193 0.37
194 0.35
195 0.38
196 0.38
197 0.35
198 0.33
199 0.24
200 0.17
201 0.11
202 0.11
203 0.08
204 0.07
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.05
235 0.06
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.21
240 0.22
241 0.26
242 0.33
243 0.41
244 0.42
245 0.5
246 0.58
247 0.6
248 0.68
249 0.67
250 0.67
251 0.68
252 0.65
253 0.65
254 0.64
255 0.59
256 0.58
257 0.57
258 0.51
259 0.44
260 0.43
261 0.41
262 0.33
263 0.29
264 0.23
265 0.22
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.21
274 0.24
275 0.29
276 0.29
277 0.31
278 0.38
279 0.47
280 0.54
281 0.56
282 0.59
283 0.59
284 0.61
285 0.6
286 0.53
287 0.45
288 0.39
289 0.32
290 0.27
291 0.23
292 0.2
293 0.16
294 0.15
295 0.11
296 0.09
297 0.07
298 0.11
299 0.13
300 0.2
301 0.22
302 0.28
303 0.32
304 0.34
305 0.36
306 0.39
307 0.45
308 0.43
309 0.49
310 0.46
311 0.5
312 0.49
313 0.47
314 0.46
315 0.37
316 0.32
317 0.25
318 0.21
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.07
323 0.06
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.11
341 0.18
342 0.19
343 0.22
344 0.28
345 0.28
346 0.32
347 0.31
348 0.31
349 0.25
350 0.24
351 0.23
352 0.18
353 0.19
354 0.14
355 0.16
356 0.14
357 0.13
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.15
363 0.18
364 0.18
365 0.21
366 0.22
367 0.25
368 0.3
369 0.28
370 0.27
371 0.29
372 0.32
373 0.39
374 0.45
375 0.5
376 0.47
377 0.56
378 0.62
379 0.56
380 0.54
381 0.49
382 0.44
383 0.43
384 0.46
385 0.43
386 0.42
387 0.49
388 0.56
389 0.59
390 0.61
391 0.55
392 0.56
393 0.6
394 0.64
395 0.66