FuNGI

G2Q989

Protein Details

Accession

G2Q989

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-44	AVTESSQKHEKKHKKAKSDHKKKRAREDDDAAV	Basic
46-65	EETPRKSKKTKGTDAEERAE	Basic
71-97	ELGSDELTKKKKKKQKAQEEDEERQNG	Hydrophilic
134-164	APVEEERKSDKKRKQKKSKKHKSEEAEEMPK	Basic
170-192	ADGEGKEKKKRKSKQSSTTNATT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-37	KHEKKHKKAKSDHKKKRAR
79-86	KKKKKKQK
107-108	HR
140-165	RKSDKKRKQKKSKKHKSEEAEEMPKK
171-183	DGEGKEKKKRKSK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	mtm:MYCTH_2303031 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSANAGESSHDAVTESSQKHEKKHKKAKSDHKKKRAREDDDAAVVEETPRKSKKTKGTDAEERAEQPASLELGSDELTKKKKKKQKAQEEDEERQNGPTVSEEPKKHRKTSGKHVKDAEQPEPEAMEVDTPETAPVEEERKSDKKRKQKKSKKHKSEEAEEMPKKDLDEADGEGKEKKKRKSKQSSTTNATTLQEATSGSAAEMPADADFPFFTQTISLYVPFFPVGFDKPLTNVAAQHLDPLLNHYSPLLRGVLLGYSNLNLSDRPAKASLTHPPTDETPALLHSIDEYAVGFGWLTFDAQLFVPSRGKWMEGVVQLQSEGHIGVVCWNKFNASIEAKRLPKGWKWVDLAKGGVKSNASPAPDQEGEPEDQSDILDGEELQVVEQIHTTGYWVDQKGKKVSGKLRFRIKNFDVGLAGDYGYLSIEGTCLDDEAERTLAAQEREAERARRAKQNPGGLLRPLSRRVPEFSMTKFGREDEEEDGGQRTVLYKGSRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.22
3	0.25
4	0.33
5	0.36
6	0.44
7	0.54
8	0.61
9	0.65
10	0.74
11	0.78
12	0.81
13	0.89
14	0.92
15	0.92
16	0.93
17	0.93
18	0.93
19	0.94
20	0.92
21	0.93
22	0.92
23	0.89
24	0.87
25	0.83
26	0.79
27	0.74
28	0.66
29	0.55
30	0.45
31	0.36
32	0.29
33	0.26
34	0.21
35	0.24
36	0.26
37	0.3
38	0.34
39	0.43
40	0.51
41	0.57
42	0.65
43	0.67
44	0.73
45	0.79
46	0.81
47	0.78
48	0.71
49	0.62
50	0.54
51	0.45
52	0.35
53	0.26
54	0.21
55	0.17
56	0.13
57	0.12
58	0.09
59	0.1
60	0.11
61	0.12
62	0.11
63	0.16
64	0.23
65	0.32
66	0.4
67	0.49
68	0.57
69	0.66
70	0.76
71	0.82
72	0.86
73	0.89
74	0.9
75	0.91
76	0.91
77	0.86
78	0.83
79	0.75
80	0.64
81	0.54
82	0.46
83	0.35
84	0.27
85	0.22
86	0.18
87	0.21
88	0.28
89	0.32
90	0.38
91	0.49
92	0.54
93	0.56
94	0.62
95	0.65
96	0.66
97	0.73
98	0.76
99	0.73
100	0.74
101	0.75
102	0.72
103	0.7
104	0.68
105	0.63
106	0.55
107	0.47
108	0.41
109	0.37
110	0.3
111	0.23
112	0.17
113	0.12
114	0.08
115	0.08
116	0.08
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.08
123	0.11
124	0.12
125	0.14
126	0.21
127	0.28
128	0.36
129	0.44
130	0.51
131	0.59
132	0.68
133	0.78
134	0.83
135	0.86
136	0.9
137	0.92
138	0.95
139	0.96
140	0.95
141	0.93
142	0.9
143	0.86
144	0.84
145	0.81
146	0.79
147	0.7
148	0.62
149	0.54
150	0.47
151	0.39
152	0.31
153	0.23
154	0.15
155	0.15
156	0.15
157	0.17
158	0.16
159	0.17
160	0.19
161	0.23
162	0.28
163	0.33
164	0.4
165	0.46
166	0.55
167	0.65
168	0.73
169	0.8
170	0.83
171	0.87
172	0.88
173	0.84
174	0.79
175	0.69
176	0.6
177	0.5
178	0.4
179	0.3
180	0.21
181	0.15
182	0.11
183	0.1
184	0.08
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.1
216	0.09
217	0.1
218	0.12
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.13
224	0.13
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.12
230	0.13
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.1
235	0.1
236	0.11
237	0.08
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.11
252	0.12
253	0.14
254	0.14
255	0.15
256	0.16
257	0.19
258	0.25
259	0.25
260	0.26
261	0.25
262	0.26
263	0.26
264	0.28
265	0.26
266	0.19
267	0.13
268	0.13
269	0.13
270	0.12
271	0.1
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.03
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.08
290	0.08
291	0.1
292	0.12
293	0.12
294	0.14
295	0.14
296	0.15
297	0.13
298	0.13
299	0.16
300	0.16
301	0.18
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.14
306	0.12
307	0.08
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.09
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.15
317	0.16
318	0.17
319	0.19
320	0.19
321	0.2
322	0.22
323	0.26
324	0.33
325	0.34
326	0.35
327	0.36
328	0.35
329	0.34
330	0.41
331	0.4
332	0.41
333	0.43
334	0.46
335	0.46
336	0.44
337	0.42
338	0.36
339	0.35
340	0.28
341	0.26
342	0.22
343	0.19
344	0.22
345	0.22
346	0.21
347	0.18
348	0.18
349	0.23
350	0.24
351	0.23
352	0.21
353	0.21
354	0.2
355	0.2
356	0.2
357	0.14
358	0.13
359	0.12
360	0.11
361	0.08
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.08
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.06
378	0.08
379	0.13
380	0.14
381	0.22
382	0.26
383	0.32
384	0.36
385	0.42
386	0.44
387	0.47
388	0.55
389	0.57
390	0.63
391	0.65
392	0.71
393	0.72
394	0.72
395	0.74
396	0.68
397	0.66
398	0.58
399	0.53
400	0.43
401	0.36
402	0.33
403	0.24
404	0.21
405	0.12
406	0.1
407	0.08
408	0.07
409	0.06
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.07
419	0.08
420	0.1
421	0.11
422	0.09
423	0.1
424	0.12
425	0.16
426	0.16
427	0.17
428	0.2
429	0.22
430	0.27
431	0.31
432	0.32
433	0.35
434	0.43
435	0.46
436	0.51
437	0.53
438	0.58
439	0.62
440	0.67
441	0.68
442	0.66
443	0.64
444	0.58
445	0.59
446	0.55
447	0.52
448	0.48
449	0.46
450	0.44
451	0.44
452	0.46
453	0.46
454	0.46
455	0.44
456	0.43
457	0.48
458	0.44
459	0.44
460	0.4
461	0.36
462	0.35
463	0.34
464	0.33
465	0.28
466	0.31
467	0.28
468	0.28
469	0.3
470	0.25
471	0.21
472	0.19
473	0.15
474	0.13
475	0.17
476	0.19
477	0.21
478	0.29
479	0.33
480	0.35

G2Q989

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer