FuNGI

Q0V0S1

Protein Details

Accession

Q0V0S1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
39-84	DRLRSNRDRYPDRRDRSRERNHEDRDRTRRNDSRDRHFRGGRRGGR	Basic
91-130	YYSGGGRQRSRSPRRDRDRDSKYRERNRSRDRRGGRDERS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
41-135	LRSNRDRYPDRRDRSRERNHEDRDRTRRNDSRDRHFRGGRRGGRGDGGGDYYSGGGRQRSRSPRRDRDRDSKYRERNRSRDRRGGRDERSAPRHG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 14.5, nucl 13.5, cyto 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:1990446 F:U1 snRNP binding GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	pno:SNOG_02393 -
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MAVSNPQDVDAFLEDVAQDVLKTKENERRASIDEREKEDRLRSNRDRYPDRRDRSRERNHEDRDRTRRNDSRDRHFRGGRRGGRGDGGGDYYSGGGRQRSRSPRRDRDRDSKYRERNRSRDRRGGRDERSAPRHGKTVSPEVTEDDRDKRTIFVQQISQRALTHHLLAFFETVGPVIEAQIVKDRVTGRSKGVGYVEFKDEESVAKALELTGQKLKGVPIIAQLTEAEKNRAARPSEGGAAPGANGAPFHRLYVGNIHFSVTEQDLHTIFAPFGELEQVTLQRDETNPARSKGYGFVQFVDPTKAKEALAEMNGFELAGRQIRVGLGNDKFTPESTASLLRTFNQQAQSYQGSAFSGAGGRGAYAGGTGGVFDRTHSKDDRGVSGASALDDSDVAGVNFKTYDRSKLMNALARRDGPEAAAQIARPVVSKPRDPIVDKPMASKCIKIENAFDADQELQQFGPSWVKDLEGEVKLECDKKYGKVVHIAVEPNSEGDVYVKFDSVTGGEKALRGLNGRNFNHRVIRASYVVDKIYNSLWGAAASKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.13
3	0.13
4	0.1
5	0.07
6	0.09
7	0.11
8	0.17
9	0.19
10	0.25
11	0.33
12	0.41
13	0.47
14	0.49
15	0.52
16	0.52
17	0.56
18	0.58
19	0.6
20	0.59
21	0.6
22	0.61
23	0.59
24	0.58
25	0.58
26	0.59
27	0.56
28	0.6
29	0.62
30	0.66
31	0.69
32	0.74
33	0.77
34	0.75
35	0.78
36	0.78
37	0.78
38	0.79
39	0.82
40	0.83
41	0.84
42	0.88
43	0.87
44	0.86
45	0.87
46	0.86
47	0.87
48	0.86
49	0.86
50	0.85
51	0.84
52	0.81
53	0.81
54	0.8
55	0.78
56	0.79
57	0.77
58	0.78
59	0.78
60	0.81
61	0.8
62	0.8
63	0.78
64	0.78
65	0.8
66	0.76
67	0.74
68	0.69
69	0.62
70	0.58
71	0.52
72	0.43
73	0.33
74	0.28
75	0.2
76	0.17
77	0.15
78	0.12
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.13
83	0.17
84	0.22
85	0.31
86	0.41
87	0.51
88	0.6
89	0.69
90	0.76
91	0.82
92	0.88
93	0.88
94	0.88
95	0.88
96	0.89
97	0.87
98	0.87
99	0.87
100	0.87
101	0.89
102	0.89
103	0.89
104	0.9
105	0.91
106	0.9
107	0.89
108	0.86
109	0.86
110	0.85
111	0.85
112	0.79
113	0.78
114	0.77
115	0.75
116	0.74
117	0.71
118	0.65
119	0.57
120	0.57
121	0.48
122	0.45
123	0.41
124	0.44
125	0.41
126	0.39
127	0.38
128	0.35
129	0.37
130	0.35
131	0.33
132	0.29
133	0.27
134	0.26
135	0.26
136	0.24
137	0.23
138	0.26
139	0.27
140	0.25
141	0.31
142	0.35
143	0.39
144	0.4
145	0.39
146	0.33
147	0.31
148	0.32
149	0.26
150	0.23
151	0.2
152	0.19
153	0.18
154	0.18
155	0.17
156	0.12
157	0.11
158	0.08
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.04
164	0.07
165	0.06
166	0.07
167	0.13
168	0.14
169	0.14
170	0.17
171	0.18
172	0.21
173	0.25
174	0.27
175	0.23
176	0.29
177	0.29
178	0.28
179	0.28
180	0.27
181	0.25
182	0.26
183	0.26
184	0.2
185	0.2
186	0.18
187	0.17
188	0.14
189	0.13
190	0.11
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.14
199	0.14
200	0.14
201	0.15
202	0.16
203	0.13
204	0.13
205	0.11
206	0.13
207	0.14
208	0.14
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.16
213	0.16
214	0.14
215	0.14
216	0.16
217	0.18
218	0.22
219	0.22
220	0.2
221	0.22
222	0.22
223	0.23
224	0.21
225	0.19
226	0.15
227	0.13
228	0.12
229	0.09
230	0.07
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.17
241	0.18
242	0.18
243	0.18
244	0.18
245	0.16
246	0.16
247	0.17
248	0.1
249	0.1
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.11
272	0.13
273	0.19
274	0.21
275	0.23
276	0.24
277	0.23
278	0.24
279	0.24
280	0.25
281	0.23
282	0.21
283	0.21
284	0.22
285	0.22
286	0.22
287	0.23
288	0.2
289	0.15
290	0.17
291	0.17
292	0.15
293	0.14
294	0.15
295	0.13
296	0.15
297	0.14
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.1
302	0.08
303	0.06
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.09
311	0.09
312	0.14
313	0.14
314	0.16
315	0.16
316	0.18
317	0.18
318	0.16
319	0.18
320	0.13
321	0.13
322	0.12
323	0.15
324	0.15
325	0.16
326	0.17
327	0.15
328	0.18
329	0.19
330	0.21
331	0.23
332	0.23
333	0.22
334	0.26
335	0.27
336	0.23
337	0.22
338	0.18
339	0.14
340	0.13
341	0.12
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.12
361	0.14
362	0.18
363	0.19
364	0.21
365	0.25
366	0.27
367	0.29
368	0.26
369	0.24
370	0.21
371	0.21
372	0.19
373	0.14
374	0.12
375	0.09
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.11
388	0.13
389	0.18
390	0.2
391	0.23
392	0.24
393	0.3
394	0.35
395	0.36
396	0.37
397	0.37
398	0.38
399	0.37
400	0.38
401	0.33
402	0.29
403	0.24
404	0.24
405	0.19
406	0.18
407	0.16
408	0.14
409	0.14
410	0.14
411	0.13
412	0.11
413	0.11
414	0.18
415	0.21
416	0.25
417	0.27
418	0.32
419	0.38
420	0.4
421	0.45
422	0.45
423	0.49
424	0.46
425	0.49
426	0.47
427	0.48
428	0.45
429	0.41
430	0.36
431	0.37
432	0.4
433	0.35
434	0.35
435	0.33
436	0.37
437	0.34
438	0.32
439	0.25
440	0.23
441	0.23
442	0.2
443	0.16
444	0.11
445	0.11
446	0.13
447	0.11
448	0.16
449	0.15
450	0.17
451	0.17
452	0.18
453	0.18
454	0.2
455	0.24
456	0.2
457	0.22
458	0.19
459	0.21
460	0.23
461	0.26
462	0.23
463	0.22
464	0.23
465	0.25
466	0.34
467	0.37
468	0.37
469	0.43
470	0.45
471	0.45
472	0.47
473	0.46
474	0.39
475	0.37
476	0.33
477	0.25
478	0.23
479	0.18
480	0.13
481	0.11
482	0.12
483	0.13
484	0.13
485	0.13
486	0.12
487	0.13
488	0.13
489	0.13
490	0.16
491	0.13
492	0.14
493	0.15
494	0.15
495	0.17
496	0.19
497	0.2
498	0.19
499	0.25
500	0.31
501	0.4
502	0.42
503	0.49
504	0.5
505	0.54
506	0.59
507	0.55
508	0.52
509	0.46
510	0.48
511	0.42
512	0.42
513	0.41
514	0.37
515	0.36
516	0.32
517	0.29
518	0.26
519	0.25
520	0.24
521	0.2
522	0.17
523	0.16
524	0.15

Q0V0S1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer