Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UPF3

Protein Details
Accession Q0UPF3    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162EVRDRLRYLKRKRDEDKFQEBasic
178-204EEEAEERRRKRNEKRRAKKNGDSTAMEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-57KKARERETKERDEAKERYEAKAAGKSYRR
184-196RRRKRNEKRRAKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pno:SNOG_06361  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
Amino Acid Sequences MSGKAGAYGTQGGGDTDFRKTWDRDEMAKKARERETKERDEAKERYEAKAAGKSYRRRASTPEDLKQTEARSERIDWSQMIGKQTLTSAAAGVGKRGKGAGAYCQACDLTFKDNIQYVEHLNSKQHLVATGQSGEVRRATLEEVRDRLRYLKRKRDEDKFQEVADLDTRLELNRTKMEEEAEERRRKRNEKRRAKKNGDSTAMEWKVEGDGVIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.15
4 0.16
5 0.18
6 0.23
7 0.24
8 0.27
9 0.33
10 0.36
11 0.41
12 0.48
13 0.55
14 0.58
15 0.63
16 0.62
17 0.61
18 0.66
19 0.66
20 0.67
21 0.69
22 0.7
23 0.72
24 0.76
25 0.76
26 0.72
27 0.72
28 0.66
29 0.58
30 0.57
31 0.51
32 0.45
33 0.41
34 0.38
35 0.33
36 0.36
37 0.35
38 0.33
39 0.4
40 0.44
41 0.5
42 0.56
43 0.56
44 0.52
45 0.56
46 0.57
47 0.6
48 0.6
49 0.57
50 0.56
51 0.53
52 0.54
53 0.51
54 0.44
55 0.39
56 0.33
57 0.29
58 0.25
59 0.26
60 0.27
61 0.26
62 0.26
63 0.2
64 0.2
65 0.22
66 0.22
67 0.22
68 0.19
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.14
73 0.1
74 0.08
75 0.06
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.09
87 0.12
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.16
94 0.17
95 0.13
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.13
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.12
128 0.16
129 0.18
130 0.21
131 0.24
132 0.25
133 0.25
134 0.29
135 0.35
136 0.41
137 0.47
138 0.54
139 0.6
140 0.69
141 0.76
142 0.79
143 0.81
144 0.79
145 0.79
146 0.71
147 0.63
148 0.55
149 0.48
150 0.4
151 0.32
152 0.24
153 0.15
154 0.13
155 0.13
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.19
161 0.21
162 0.22
163 0.23
164 0.24
165 0.25
166 0.29
167 0.35
168 0.39
169 0.46
170 0.47
171 0.55
172 0.61
173 0.68
174 0.74
175 0.75
176 0.77
177 0.79
178 0.88
179 0.9
180 0.93
181 0.93
182 0.91
183 0.91
184 0.9
185 0.85
186 0.79
187 0.71
188 0.7
189 0.62
190 0.52
191 0.42
192 0.33
193 0.27
194 0.22