Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R420

Protein Details
Accession C4R420    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-279LANHRKRPIKSKLKHSTTPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-271KRPIKSK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG ppa:PAS_chr3_0267  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSSTPDGSTPVDSGKRTSDQIDVGEYKRVKVERGNRSETVDSGLIDMSNSVGASLDIPTPDQLNPTNTGVQTPSLHQPGESISAHSLSLPGETSVGGSTGISRENTPQVRPDVSVSQSSSQLHQRNESFPGLSVSKSTTSLNKDTMFDNRKRLLGNNGANPNGQKSSDPEKLSDALTAAGVDLKEEESLLSQSTVIQQSRRQLSTLSSFLHPVHLATFMRRVMENNGLRNYVDHDTELLSYMSSACEGFMAGILTDSVILANHRKRPIKSKLKHSTTPRSDVSKVLRDIATKQKEREEQRVQKRVTLDIEGQEDDGKSKQDNEEVLHRAANATAMMMTSKSKKKKYSWMNADSGAQGGKTNSVLARGDSGIRYRDAREEPGLVLRDLLGALEGRRMCVANTVVKGYARMND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.33
4 0.34
5 0.32
6 0.3
7 0.31
8 0.34
9 0.33
10 0.31
11 0.37
12 0.35
13 0.32
14 0.36
15 0.35
16 0.32
17 0.37
18 0.45
19 0.48
20 0.56
21 0.61
22 0.57
23 0.62
24 0.61
25 0.52
26 0.47
27 0.38
28 0.29
29 0.23
30 0.21
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.12
47 0.12
48 0.15
49 0.16
50 0.18
51 0.21
52 0.24
53 0.27
54 0.25
55 0.27
56 0.25
57 0.24
58 0.23
59 0.22
60 0.26
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.22
65 0.21
66 0.25
67 0.22
68 0.18
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.16
73 0.15
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.13
91 0.21
92 0.23
93 0.24
94 0.27
95 0.28
96 0.29
97 0.29
98 0.3
99 0.27
100 0.26
101 0.29
102 0.27
103 0.25
104 0.26
105 0.26
106 0.25
107 0.29
108 0.32
109 0.3
110 0.33
111 0.34
112 0.34
113 0.37
114 0.36
115 0.28
116 0.23
117 0.25
118 0.21
119 0.18
120 0.17
121 0.15
122 0.14
123 0.15
124 0.16
125 0.17
126 0.21
127 0.24
128 0.27
129 0.26
130 0.26
131 0.26
132 0.34
133 0.36
134 0.34
135 0.38
136 0.37
137 0.37
138 0.37
139 0.38
140 0.35
141 0.37
142 0.38
143 0.38
144 0.39
145 0.38
146 0.38
147 0.36
148 0.32
149 0.25
150 0.2
151 0.14
152 0.15
153 0.22
154 0.28
155 0.28
156 0.27
157 0.28
158 0.28
159 0.28
160 0.24
161 0.17
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.08
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.15
185 0.2
186 0.25
187 0.25
188 0.23
189 0.2
190 0.22
191 0.24
192 0.24
193 0.2
194 0.17
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.16
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.22
211 0.24
212 0.25
213 0.26
214 0.26
215 0.26
216 0.25
217 0.25
218 0.18
219 0.16
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.1
248 0.14
249 0.2
250 0.27
251 0.32
252 0.35
253 0.44
254 0.54
255 0.59
256 0.63
257 0.68
258 0.73
259 0.75
260 0.8
261 0.79
262 0.8
263 0.74
264 0.73
265 0.66
266 0.61
267 0.55
268 0.53
269 0.5
270 0.46
271 0.41
272 0.39
273 0.36
274 0.32
275 0.35
276 0.4
277 0.43
278 0.4
279 0.41
280 0.45
281 0.52
282 0.56
283 0.61
284 0.61
285 0.62
286 0.69
287 0.76
288 0.69
289 0.66
290 0.62
291 0.57
292 0.49
293 0.42
294 0.34
295 0.28
296 0.3
297 0.26
298 0.25
299 0.22
300 0.19
301 0.17
302 0.15
303 0.14
304 0.12
305 0.14
306 0.16
307 0.18
308 0.21
309 0.22
310 0.28
311 0.31
312 0.31
313 0.29
314 0.27
315 0.24
316 0.21
317 0.19
318 0.12
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.1
325 0.16
326 0.25
327 0.33
328 0.4
329 0.47
330 0.54
331 0.64
332 0.72
333 0.76
334 0.78
335 0.78
336 0.76
337 0.7
338 0.65
339 0.55
340 0.46
341 0.35
342 0.24
343 0.18
344 0.13
345 0.13
346 0.11
347 0.13
348 0.12
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.18
353 0.17
354 0.19
355 0.19
356 0.22
357 0.22
358 0.23
359 0.25
360 0.24
361 0.3
362 0.32
363 0.35
364 0.35
365 0.34
366 0.34
367 0.38
368 0.38
369 0.3
370 0.27
371 0.22
372 0.19
373 0.17
374 0.15
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.14
379 0.14
380 0.15
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.21
385 0.25
386 0.25
387 0.28
388 0.3
389 0.31
390 0.31
391 0.33