Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C301

Protein Details
Accession H6C301    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
465-484PCTNLRCPFKHEPGQQKVNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-153GRPSGRG
287-301GRGRGGMRGRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.333, cyto 6, cyto_mito 5.665, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040366  Nab2/ZC3H14  
IPR043094  Nab2/ZC3H14_N_sf  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:1900364  P:negative regulation of mRNA polyadenylation  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
Pfam View protein in Pfam  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSTIALETPLAETLSNAVHSKIVEEGWTQEDDTSLAEYIVLMLANGKTQDQIASELAGELLQDAKGTTEFAQWLFDQVNSLSGGTTGSAPAETSESTAQQNQTVASESAPAESTENTTSAIPAAYDQDMADNAPENAPRGPKNLHGGRPSGRGGRGGANNKTGDSVLHRVRGNDRINTHSRGTPKGPRNVQNRDIRPGMQKALNNMAMGGPPQGMQNPMLMNGGQPGQPVMQMTPQQQMEFMAMMEQQTRMLAQMTGMMPGSVNTFPQGGNQQNGQGRSLFDRVEPGRGRGGMRGRGRGRGGHDQNGHIKGASKSNDQESPAMEVDASNSEAGASSAMDVENAPSTERKPHDPSNTMCHFNLRCTNKDCPYVHQSPAAPEGTVVDMNDTCSFGAACKNVKCAGKHPSPAQVRAFQGQELCKFFPNCTKPNCPFKHPTMPVCKFGANCKTSNCQYTHLQTPCRYNPCTNLRCPFKHEPGQQKVNNFADYTWTPDKQADANAGKEHVSDRKFVDDQAGEEELIRPGEATADTNGAGMRHEVST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.19
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.15
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.05
29 0.07
30 0.07
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.06
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.07
52 0.07
53 0.09
54 0.1
55 0.12
56 0.13
57 0.14
58 0.16
59 0.15
60 0.17
61 0.16
62 0.15
63 0.14
64 0.13
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.13
83 0.15
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.2
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.17
92 0.13
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.12
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.08
109 0.07
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.13
124 0.16
125 0.17
126 0.2
127 0.22
128 0.24
129 0.33
130 0.38
131 0.42
132 0.42
133 0.45
134 0.44
135 0.47
136 0.46
137 0.41
138 0.35
139 0.31
140 0.29
141 0.31
142 0.35
143 0.36
144 0.36
145 0.37
146 0.36
147 0.35
148 0.34
149 0.27
150 0.21
151 0.19
152 0.23
153 0.21
154 0.26
155 0.26
156 0.27
157 0.31
158 0.39
159 0.38
160 0.37
161 0.36
162 0.38
163 0.42
164 0.44
165 0.42
166 0.37
167 0.37
168 0.36
169 0.39
170 0.41
171 0.44
172 0.49
173 0.54
174 0.58
175 0.64
176 0.67
177 0.7
178 0.7
179 0.66
180 0.63
181 0.58
182 0.52
183 0.48
184 0.44
185 0.39
186 0.33
187 0.31
188 0.29
189 0.32
190 0.31
191 0.26
192 0.23
193 0.2
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.09
219 0.12
220 0.14
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.17
225 0.17
226 0.15
227 0.12
228 0.1
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.1
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.17
260 0.19
261 0.2
262 0.19
263 0.16
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.14
268 0.11
269 0.16
270 0.16
271 0.22
272 0.22
273 0.21
274 0.21
275 0.22
276 0.23
277 0.22
278 0.25
279 0.26
280 0.28
281 0.34
282 0.34
283 0.37
284 0.38
285 0.36
286 0.37
287 0.4
288 0.4
289 0.39
290 0.4
291 0.38
292 0.42
293 0.41
294 0.36
295 0.26
296 0.26
297 0.2
298 0.24
299 0.23
300 0.21
301 0.21
302 0.24
303 0.26
304 0.25
305 0.25
306 0.2
307 0.21
308 0.19
309 0.17
310 0.14
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.04
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.15
334 0.18
335 0.23
336 0.28
337 0.35
338 0.41
339 0.46
340 0.48
341 0.5
342 0.52
343 0.5
344 0.44
345 0.43
346 0.36
347 0.35
348 0.41
349 0.36
350 0.37
351 0.38
352 0.45
353 0.43
354 0.5
355 0.47
356 0.45
357 0.49
358 0.48
359 0.45
360 0.43
361 0.4
362 0.34
363 0.37
364 0.32
365 0.23
366 0.19
367 0.18
368 0.15
369 0.15
370 0.12
371 0.1
372 0.09
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.12
381 0.12
382 0.17
383 0.18
384 0.21
385 0.26
386 0.3
387 0.31
388 0.33
389 0.39
390 0.41
391 0.46
392 0.46
393 0.5
394 0.51
395 0.55
396 0.53
397 0.5
398 0.45
399 0.44
400 0.42
401 0.34
402 0.33
403 0.31
404 0.32
405 0.31
406 0.29
407 0.3
408 0.3
409 0.3
410 0.36
411 0.39
412 0.41
413 0.43
414 0.51
415 0.54
416 0.64
417 0.67
418 0.65
419 0.65
420 0.66
421 0.7
422 0.67
423 0.68
424 0.68
425 0.68
426 0.65
427 0.6
428 0.56
429 0.46
430 0.48
431 0.49
432 0.41
433 0.4
434 0.39
435 0.44
436 0.45
437 0.5
438 0.44
439 0.39
440 0.41
441 0.44
442 0.49
443 0.48
444 0.51
445 0.49
446 0.56
447 0.59
448 0.6
449 0.59
450 0.53
451 0.57
452 0.61
453 0.63
454 0.61
455 0.63
456 0.65
457 0.64
458 0.69
459 0.69
460 0.67
461 0.7
462 0.72
463 0.73
464 0.74
465 0.81
466 0.76
467 0.71
468 0.7
469 0.65
470 0.58
471 0.48
472 0.39
473 0.35
474 0.32
475 0.36
476 0.33
477 0.3
478 0.29
479 0.3
480 0.32
481 0.28
482 0.3
483 0.31
484 0.29
485 0.32
486 0.32
487 0.32
488 0.3
489 0.29
490 0.3
491 0.29
492 0.27
493 0.27
494 0.27
495 0.33
496 0.34
497 0.33
498 0.37
499 0.31
500 0.31
501 0.33
502 0.32
503 0.24
504 0.24
505 0.25
506 0.19
507 0.18
508 0.16
509 0.11
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.13
516 0.14
517 0.14
518 0.15
519 0.13
520 0.13
521 0.12