Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BKH9

Protein Details
Accession H6BKH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-412YTTSNPSQPQPQPRPRPPFRVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
520-551GSKGKGKGNGRGRGGGGAGRGGKRLPGQTRGG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9, pero 5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MADADEDAIPRTMPSGAEDLEDETQDFRFLAQLTSASSSTSGQAIIPKRGTKDFEPNPTRSQASALDAARLAMHTALSAVRVHSGRSHLVGQYLADPKDWRWEETVSGGRHGRCVVVPKFKSTHLKVMGQADRNNWVWLLPEEALFLLERGSLDIRWPDIPEDEEAEGTDKEETSGTTAAQDQPQASQDEAEGEADNRKSDVVTAPEDQAIEHGDQRETETNTDESTSQQQPAQVNSRKISDGASEPRIGQLPMSLQGAYASFIGKDGLTLERYSVYAGLKRAGYIVQRAPTWHDTDVDEVNGNGSIDGPQHTQPHSNGQSPTTSQPLSFLASPASLIHRLVSWLFRPRQGASCPSLGPLVAPGLYRNYADIFRALALIPYHDSSSVNNRYTTSNPSQPQPQPRPRPPFRVHFHVWKPNVSHSYRKTAPPPPDYRIAVIDARTTSLPTLTQIGDLLDSQPEDVLSKEKDGAGARLEARIKHGRRNVLLAVVDMGVTSYLRLSDACFGAEKLFEEKTSGAGSKGKGKGNGRGRGGGGAGRGGKRLPGQTRGGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.15
4 0.16
5 0.17
6 0.19
7 0.19
8 0.19
9 0.17
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.12
14 0.09
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.15
21 0.18
22 0.18
23 0.16
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.13
29 0.11
30 0.17
31 0.21
32 0.27
33 0.31
34 0.34
35 0.37
36 0.42
37 0.46
38 0.45
39 0.51
40 0.52
41 0.58
42 0.61
43 0.61
44 0.61
45 0.6
46 0.57
47 0.46
48 0.42
49 0.34
50 0.32
51 0.34
52 0.3
53 0.27
54 0.25
55 0.25
56 0.22
57 0.19
58 0.15
59 0.09
60 0.09
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.13
68 0.13
69 0.15
70 0.17
71 0.2
72 0.21
73 0.23
74 0.26
75 0.22
76 0.23
77 0.23
78 0.2
79 0.23
80 0.26
81 0.23
82 0.22
83 0.22
84 0.21
85 0.31
86 0.32
87 0.28
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.31
92 0.38
93 0.29
94 0.32
95 0.34
96 0.31
97 0.32
98 0.31
99 0.26
100 0.21
101 0.28
102 0.3
103 0.36
104 0.37
105 0.4
106 0.42
107 0.46
108 0.54
109 0.49
110 0.53
111 0.47
112 0.5
113 0.48
114 0.54
115 0.55
116 0.51
117 0.5
118 0.42
119 0.42
120 0.4
121 0.36
122 0.27
123 0.21
124 0.18
125 0.16
126 0.17
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.09
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.14
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.11
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.14
197 0.12
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.13
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.15
212 0.12
213 0.16
214 0.17
215 0.15
216 0.16
217 0.19
218 0.19
219 0.23
220 0.3
221 0.3
222 0.32
223 0.32
224 0.33
225 0.3
226 0.29
227 0.27
228 0.2
229 0.19
230 0.2
231 0.21
232 0.2
233 0.19
234 0.2
235 0.2
236 0.18
237 0.13
238 0.1
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.19
278 0.2
279 0.21
280 0.19
281 0.17
282 0.16
283 0.18
284 0.18
285 0.14
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.07
296 0.08
297 0.1
298 0.12
299 0.14
300 0.16
301 0.17
302 0.25
303 0.26
304 0.29
305 0.28
306 0.26
307 0.27
308 0.27
309 0.28
310 0.22
311 0.19
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.14
317 0.13
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.12
330 0.12
331 0.19
332 0.21
333 0.23
334 0.26
335 0.27
336 0.31
337 0.32
338 0.34
339 0.29
340 0.3
341 0.27
342 0.25
343 0.24
344 0.18
345 0.15
346 0.12
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.2
373 0.25
374 0.26
375 0.26
376 0.27
377 0.29
378 0.31
379 0.37
380 0.34
381 0.35
382 0.35
383 0.37
384 0.44
385 0.47
386 0.56
387 0.58
388 0.63
389 0.66
390 0.73
391 0.81
392 0.79
393 0.83
394 0.78
395 0.78
396 0.74
397 0.72
398 0.68
399 0.67
400 0.69
401 0.68
402 0.65
403 0.6
404 0.56
405 0.55
406 0.57
407 0.51
408 0.51
409 0.46
410 0.52
411 0.51
412 0.54
413 0.53
414 0.53
415 0.58
416 0.59
417 0.61
418 0.56
419 0.6
420 0.56
421 0.52
422 0.46
423 0.41
424 0.34
425 0.29
426 0.28
427 0.21
428 0.21
429 0.19
430 0.18
431 0.15
432 0.13
433 0.13
434 0.11
435 0.14
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.11
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.12
451 0.12
452 0.14
453 0.16
454 0.16
455 0.19
456 0.2
457 0.22
458 0.2
459 0.23
460 0.22
461 0.26
462 0.28
463 0.25
464 0.3
465 0.38
466 0.38
467 0.43
468 0.49
469 0.51
470 0.52
471 0.57
472 0.52
473 0.47
474 0.45
475 0.36
476 0.31
477 0.23
478 0.2
479 0.14
480 0.12
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.08
489 0.12
490 0.13
491 0.14
492 0.15
493 0.16
494 0.16
495 0.18
496 0.17
497 0.16
498 0.17
499 0.16
500 0.17
501 0.17
502 0.18
503 0.2
504 0.19
505 0.18
506 0.21
507 0.24
508 0.31
509 0.37
510 0.39
511 0.43
512 0.47
513 0.54
514 0.6
515 0.66
516 0.61
517 0.59
518 0.55
519 0.5
520 0.47
521 0.4
522 0.31
523 0.28
524 0.29
525 0.26
526 0.26
527 0.24
528 0.26
529 0.29
530 0.36
531 0.37
532 0.39