FuNGI

H6CB35

Protein Details

Accession

H6CB35

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-48	ANRPPGPPPAVRRKKPQSDPFFKGPRKNPNPTGIKQ	Hydrophilic
137-156	AEFPKPARLHRRDPRAPPPG	Basic
538-559	GTDASTRKKKLKSRHVSSAQPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-39	NRPPGPPPAVRRKKPQSDPFFKGPRK
421-440	KEEEARKKNFRELRKALEKR
501-504	KEKK
545-548	KKKL

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNPGTVPGGGPGANRPPGPPPAVRRKKPQSDPFFKGPRKNPNPTGIKQVNGSATPLANGQPPAKRIPVPNPLRPSKPESAIPENERVSGFSDPRVAAEGIPYQDYKLVTSKKELLNGLRYHLLQLAGEKVIDIRNEAEFPKPARLHRRDPRAPPPGHQQQQQQPKEEDQPPEPKDGLTATEREEVNKRKEARQREREANLAQIAPSQGAGRKINFKKKTQQVFRPDYSAEEKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDGKHCLIGHHQMGSMGTTVAFVYEPGQDKGKYRMIPIEKVYQFKPKRELAQQMSIEEVEAAMKKRGTDPEWLIRQREARIAEASKELAARKSKGLFSGAAPTETYAGRTGEEADLDFEDDFADDEEGDLFADKDEDEKFAEKRIKEDQLQANFFDLKDLKEYDEAEERERKEEEARKKNFRELRKALEKRERNFNHATDSEDVSTTDSEEERERLERERIANLKKEEEEAEADGKKSALSSSGANTPSGRKEKKGGSFASDREDGLKKSASSKSLKRPGSPNLSDASGTDASTRKKKLKSRHVSSAQPTPGQSRPMSPADLSTLEPSAALKMRRRGGAGSDTDTVMSDRDGGAMSDASRAQRLKLKVSVSPPGTGRSTPQPGSRVGSPAPGGPRPAAGPGTPQGSEPSTAFPSVQDVRNAIPPQGIGIKDLIKAVEHPRERRNDFINLVKEVARIDKDRGVLVLR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.3
4	0.35
5	0.39
6	0.41
7	0.44
8	0.51
9	0.62
10	0.67
11	0.72
12	0.77
13	0.83
14	0.87
15	0.88
16	0.88
17	0.86
18	0.87
19	0.86
20	0.86
21	0.83
22	0.82
23	0.8
24	0.8
25	0.8
26	0.82
27	0.79
28	0.79
29	0.8
30	0.73
31	0.75
32	0.68
33	0.61
34	0.53
35	0.51
36	0.44
37	0.37
38	0.36
39	0.28
40	0.24
41	0.22
42	0.21
43	0.18
44	0.18
45	0.2
46	0.22
47	0.25
48	0.27
49	0.31
50	0.34
51	0.37
52	0.39
53	0.45
54	0.51
55	0.54
56	0.6
57	0.65
58	0.67
59	0.68
60	0.67
61	0.67
62	0.63
63	0.59
64	0.57
65	0.55
66	0.57
67	0.59
68	0.59
69	0.58
70	0.52
71	0.5
72	0.43
73	0.37
74	0.32
75	0.29
76	0.26
77	0.21
78	0.25
79	0.23
80	0.23
81	0.26
82	0.23
83	0.18
84	0.19
85	0.21
86	0.18
87	0.2
88	0.2
89	0.17
90	0.19
91	0.2
92	0.19
93	0.23
94	0.26
95	0.26
96	0.31
97	0.38
98	0.38
99	0.43
100	0.45
101	0.42
102	0.46
103	0.45
104	0.43
105	0.39
106	0.37
107	0.33
108	0.31
109	0.26
110	0.18
111	0.18
112	0.18
113	0.14
114	0.14
115	0.12
116	0.12
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.12
121	0.13
122	0.15
123	0.16
124	0.18
125	0.2
126	0.22
127	0.29
128	0.31
129	0.36
130	0.45
131	0.51
132	0.58
133	0.64
134	0.72
135	0.72
136	0.77
137	0.8
138	0.79
139	0.74
140	0.69
141	0.7
142	0.69
143	0.67
144	0.64
145	0.62
146	0.61
147	0.7
148	0.7
149	0.66
150	0.58
151	0.56
152	0.59
153	0.57
154	0.52
155	0.48
156	0.52
157	0.48
158	0.5
159	0.46
160	0.37
161	0.33
162	0.29
163	0.26
164	0.19
165	0.19
166	0.18
167	0.23
168	0.23
169	0.24
170	0.31
171	0.34
172	0.38
173	0.43
174	0.44
175	0.46
176	0.54
177	0.63
178	0.66
179	0.7
180	0.72
181	0.74
182	0.74
183	0.71
184	0.65
185	0.58
186	0.49
187	0.39
188	0.31
189	0.23
190	0.21
191	0.15
192	0.14
193	0.1
194	0.11
195	0.15
196	0.17
197	0.18
198	0.27
199	0.34
200	0.44
201	0.49
202	0.53
203	0.58
204	0.65
205	0.74
206	0.73
207	0.75
208	0.75
209	0.77
210	0.73
211	0.67
212	0.58
213	0.51
214	0.49
215	0.47
216	0.41
217	0.4
218	0.41
219	0.42
220	0.48
221	0.46
222	0.42
223	0.44
224	0.5
225	0.47
226	0.48
227	0.45
228	0.39
229	0.44
230	0.42
231	0.33
232	0.25
233	0.21
234	0.18
235	0.22
236	0.24
237	0.2
238	0.21
239	0.2
240	0.19
241	0.18
242	0.18
243	0.15
244	0.19
245	0.17
246	0.16
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.14
252	0.08
253	0.07
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.05
260	0.08
261	0.11
262	0.11
263	0.14
264	0.15
265	0.17
266	0.22
267	0.26
268	0.24
269	0.23
270	0.3
271	0.31
272	0.34
273	0.35
274	0.39
275	0.36
276	0.38
277	0.38
278	0.41
279	0.41
280	0.41
281	0.44
282	0.39
283	0.42
284	0.44
285	0.51
286	0.46
287	0.51
288	0.48
289	0.42
290	0.39
291	0.34
292	0.28
293	0.19
294	0.14
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.12
302	0.16
303	0.17
304	0.21
305	0.24
306	0.31
307	0.38
308	0.39
309	0.38
310	0.37
311	0.38
312	0.33
313	0.34
314	0.27
315	0.21
316	0.23
317	0.22
318	0.21
319	0.19
320	0.18
321	0.14
322	0.14
323	0.13
324	0.14
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.2
329	0.2
330	0.2
331	0.21
332	0.18
333	0.16
334	0.21
335	0.19
336	0.17
337	0.16
338	0.15
339	0.15
340	0.14
341	0.14
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.03
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.09
375	0.1
376	0.15
377	0.2
378	0.19
379	0.22
380	0.26
381	0.3
382	0.3
383	0.37
384	0.39
385	0.4
386	0.41
387	0.38
388	0.35
389	0.31
390	0.28
391	0.23
392	0.17
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.12
397	0.13
398	0.14
399	0.14
400	0.19
401	0.2
402	0.21
403	0.26
404	0.25
405	0.26
406	0.26
407	0.25
408	0.26
409	0.33
410	0.4
411	0.45
412	0.5
413	0.57
414	0.58
415	0.66
416	0.66
417	0.65
418	0.65
419	0.59
420	0.62
421	0.64
422	0.67
423	0.67
424	0.7
425	0.7
426	0.63
427	0.7
428	0.63
429	0.58
430	0.58
431	0.51
432	0.47
433	0.4
434	0.4
435	0.31
436	0.31
437	0.26
438	0.21
439	0.2
440	0.15
441	0.14
442	0.12
443	0.1
444	0.08
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.11
449	0.13
450	0.14
451	0.16
452	0.2
453	0.22
454	0.23
455	0.29
456	0.34
457	0.36
458	0.41
459	0.4
460	0.41
461	0.38
462	0.37
463	0.32
464	0.27
465	0.24
466	0.19
467	0.21
468	0.18
469	0.18
470	0.16
471	0.15
472	0.13
473	0.11
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.09
478	0.11
479	0.17
480	0.18
481	0.18
482	0.19
483	0.2
484	0.26
485	0.33
486	0.33
487	0.3
488	0.35
489	0.42
490	0.49
491	0.53
492	0.47
493	0.45
494	0.48
495	0.47
496	0.46
497	0.39
498	0.32
499	0.29
500	0.3
501	0.25
502	0.23
503	0.24
504	0.19
505	0.24
506	0.28
507	0.29
508	0.33
509	0.4
510	0.47
511	0.54
512	0.57
513	0.56
514	0.58
515	0.61
516	0.64
517	0.58
518	0.5
519	0.43
520	0.41
521	0.36
522	0.3
523	0.28
524	0.19
525	0.17
526	0.17
527	0.2
528	0.23
529	0.29
530	0.35
531	0.36
532	0.43
533	0.51
534	0.59
535	0.66
536	0.73
537	0.75
538	0.8
539	0.8
540	0.8
541	0.77
542	0.76
543	0.68
544	0.6
545	0.52
546	0.46
547	0.43
548	0.39
549	0.35
550	0.29
551	0.31
552	0.31
553	0.32
554	0.27
555	0.25
556	0.24
557	0.25
558	0.23
559	0.2
560	0.17
561	0.15
562	0.15
563	0.13
564	0.13
565	0.16
566	0.19
567	0.23
568	0.29
569	0.34
570	0.37
571	0.38
572	0.37
573	0.38
574	0.41
575	0.39
576	0.36
577	0.33
578	0.31
579	0.29
580	0.28
581	0.23
582	0.16
583	0.12
584	0.09
585	0.07
586	0.08
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.09
591	0.09
592	0.11
593	0.12
594	0.13
595	0.17
596	0.17
597	0.19
598	0.25
599	0.28
600	0.32
601	0.36
602	0.38
603	0.39
604	0.43
605	0.49
606	0.44
607	0.45
608	0.41
609	0.39
610	0.39
611	0.34
612	0.33
613	0.33
614	0.37
615	0.37
616	0.4
617	0.39
618	0.4
619	0.44
620	0.42
621	0.38
622	0.32
623	0.33
624	0.29
625	0.3
626	0.33
627	0.3
628	0.3
629	0.26
630	0.27
631	0.24
632	0.26
633	0.24
634	0.19
635	0.21
636	0.22
637	0.26
638	0.24
639	0.24
640	0.24
641	0.23
642	0.25
643	0.21
644	0.23
645	0.21
646	0.22
647	0.21
648	0.18
649	0.23
650	0.25
651	0.28
652	0.26
653	0.25
654	0.27
655	0.35
656	0.36
657	0.3
658	0.27
659	0.24
660	0.24
661	0.27
662	0.25
663	0.19
664	0.2
665	0.22
666	0.21
667	0.23
668	0.2
669	0.16
670	0.2
671	0.25
672	0.32
673	0.37
674	0.43
675	0.5
676	0.59
677	0.63
678	0.66
679	0.64
680	0.61
681	0.59
682	0.61
683	0.59
684	0.51
685	0.49
686	0.43
687	0.39
688	0.34
689	0.34
690	0.3
691	0.28
692	0.3
693	0.32
694	0.33
695	0.33

H6CB35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer