Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BX13

Protein Details
Accession H6BX13    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPKNKKAKTKHYPSKNSAELSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MPKNKKAKTKHYPSKNSAELSQAEIWDDSALIRSWNDAVAEYEYYHSIHARGEDVEEILRKAEMDELAENGTGALSTEWQQVNSGQTDLESDARPISGSTAVAAGATAAGRASPESQEDGEIEDGELEDDLEAAREALSRKVVLQTELSAPQVPAETPAEQEISQHVAENMASQVPSSSANKPKPMIGPSLPPAAVEAPGPSAEQTLENIKMAYYWAGYYSGLYDGQRQAQASAPPPPPPQP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.83
3 0.76
4 0.66
5 0.6
6 0.51
7 0.46
8 0.41
9 0.31
10 0.26
11 0.23
12 0.21
13 0.16
14 0.15
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.12
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.11
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.08
58 0.07
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.06
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.02
96 0.02
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.02
117 0.02
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.05
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.1
164 0.12
165 0.18
166 0.25
167 0.3
168 0.34
169 0.35
170 0.38
171 0.4
172 0.39
173 0.39
174 0.33
175 0.35
176 0.34
177 0.37
178 0.33
179 0.28
180 0.27
181 0.22
182 0.2
183 0.15
184 0.12
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.16
212 0.18
213 0.23
214 0.25
215 0.24
216 0.24
217 0.26
218 0.3
219 0.29
220 0.35
221 0.33
222 0.37