FuNGI

H6BTC3

Protein Details

Accession

H6BTC3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRAAR	Hydrophilic
431-453	EAREAQRNPKRRRNSPDYNRGGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-443	KRRKEVADRRERNERRREQQQEAREAQRNPKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLTKKYPKIISPVVEEQPYEIDGVQYPVDTTKPNPNGEEMHNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPANESEMMMEIFKYTDRVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRAARDAKEADEKKAEFQTLLRQQQQDRDDVSDEEEVIKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRYWVQWKLNTDPAWAELKVIISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPEYDPNTRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFTRDAKAKTCKLCGQQGHYAENCRGNAKVKAGEFDEKGTTEELKPFIWLHVPVLREYLAAEMFVPGQPFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIHEDGIDKLIAIWRDNLPLMGGYVTCDGNVNLARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKEVADRRERNERRREQQQEAREAQRNPKRRRNSPDYNRGGRVDTRAPTGPVETFEATNYPTLDYNSIVNRGAVDKALTTNKSAAAVLKEQMLAQRAAATETPTKTAATNGTANGADGSPNTDSNTPGSALGKRKAALMEEQDAASDSGTPGRNTPLTKTDTNEEPPPVDPDLDTVRLWEPGYADRYYEQKFHVSPNDIEFRHKVARAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIDKMEVKFDKGTPFRPYEQLMGVLPASSNHAIPPAFHPLMTDEDSEIVDFYPEDFDLDLNGKKQSWKAVVLLPFIDEKRLLKAMGTKYPLLSDDERARNEFGKDALIISDQNPLYDELALQFYSKKAKDGKETVKLSMRKGRLAGTVSKNHDFLPHMDLVGPEADIKLEPVVDDDRSLNVHFTMPPPTHVHKSMLFPGVVLPAPVLDKSDLAILRSKARNSGRDFGGAPLYDNTRRDPMDQQNRGGRINYAADRPPLNANGGYNNGGQNSRDNPFAAFLDPRFASNMPPAGRGGPPPPPPQSQRYGAANGYDQNQGQYGGYGGGGQGGYYNDYQGQGQGQGYYGNQGGQNQYYGGRNGDYQQQYAQGGQGAGNGYYQYPGQGQNQGQGYPPRDDRRGGRGGGNNYGGGYNQGGGGGYGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.68
5	0.65
6	0.63
7	0.62
8	0.59
9	0.52
10	0.47
11	0.4
12	0.35
13	0.31
14	0.24
15	0.17
16	0.13
17	0.12
18	0.15
19	0.14
20	0.12
21	0.12
22	0.12
23	0.14
24	0.15
25	0.17
26	0.25
27	0.32
28	0.35
29	0.36
30	0.38
31	0.41
32	0.43
33	0.48
34	0.42
35	0.39
36	0.36
37	0.34
38	0.31
39	0.27
40	0.24
41	0.14
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.11
46	0.12
47	0.13
48	0.15
49	0.21
50	0.27
51	0.28
52	0.37
53	0.46
54	0.54
55	0.6
56	0.59
57	0.6
58	0.59
59	0.6
60	0.51
61	0.44
62	0.38
63	0.32
64	0.3
65	0.24
66	0.19
67	0.14
68	0.14
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.13
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.47
80	0.46
81	0.47
82	0.47
83	0.45
84	0.39
85	0.31
86	0.29
87	0.26
88	0.24
89	0.23
90	0.19
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.73
103	0.78
104	0.81
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.77
109	0.72
110	0.73
111	0.68
112	0.61
113	0.66
114	0.61
115	0.54
116	0.52
117	0.47
118	0.42
119	0.42
120	0.4
121	0.3
122	0.3
123	0.36
124	0.38
125	0.44
126	0.46
127	0.47
128	0.48
129	0.55
130	0.56
131	0.51
132	0.44
133	0.4
134	0.36
135	0.32
136	0.32
137	0.26
138	0.23
139	0.21
140	0.22
141	0.19
142	0.18
143	0.18
144	0.15
145	0.16
146	0.19
147	0.22
148	0.24
149	0.26
150	0.32
151	0.33
152	0.33
153	0.31
154	0.3
155	0.25
156	0.21
157	0.17
158	0.12
159	0.1
160	0.1
161	0.13
162	0.12
163	0.13
164	0.13
165	0.16
166	0.15
167	0.16
168	0.18
169	0.18
170	0.25
171	0.28
172	0.33
173	0.35
174	0.42
175	0.42
176	0.41
177	0.38
178	0.33
179	0.32
180	0.28
181	0.23
182	0.17
183	0.17
184	0.16
185	0.15
186	0.12
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.13
200	0.14
201	0.15
202	0.19
203	0.24
204	0.3
205	0.32
206	0.33
207	0.35
208	0.39
209	0.42
210	0.38
211	0.42
212	0.39
213	0.42
214	0.43
215	0.42
216	0.4
217	0.37
218	0.35
219	0.26
220	0.23
221	0.18
222	0.18
223	0.15
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.18
242	0.2
243	0.23
244	0.26
245	0.27
246	0.26
247	0.29
248	0.29
249	0.27
250	0.3
251	0.28
252	0.29
253	0.34
254	0.38
255	0.39
256	0.44
257	0.47
258	0.46
259	0.53
260	0.53
261	0.52
262	0.53
263	0.52
264	0.52
265	0.47
266	0.46
267	0.41
268	0.4
269	0.35
270	0.29
271	0.27
272	0.25
273	0.27
274	0.27
275	0.29
276	0.25
277	0.27
278	0.29
279	0.32
280	0.29
281	0.28
282	0.26
283	0.21
284	0.22
285	0.2
286	0.19
287	0.15
288	0.18
289	0.17
290	0.15
291	0.16
292	0.15
293	0.15
294	0.16
295	0.15
296	0.15
297	0.17
298	0.18
299	0.16
300	0.18
301	0.17
302	0.14
303	0.14
304	0.13
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.09
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.11
317	0.12
318	0.12
319	0.14
320	0.18
321	0.18
322	0.19
323	0.21
324	0.18
325	0.16
326	0.16
327	0.14
328	0.1
329	0.08
330	0.08
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.08
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.13
352	0.08
353	0.06
354	0.06
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.11
359	0.11
360	0.13
361	0.13
362	0.13
363	0.1
364	0.1
365	0.09
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.07
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.09
390	0.07
391	0.08
392	0.13
393	0.15
394	0.22
395	0.27
396	0.27
397	0.32
398	0.36
399	0.38
400	0.42
401	0.5
402	0.52
403	0.58
404	0.64
405	0.63
406	0.71
407	0.75
408	0.74
409	0.75
410	0.73
411	0.68
412	0.72
413	0.74
414	0.72
415	0.73
416	0.7
417	0.68
418	0.64
419	0.63
420	0.58
421	0.54
422	0.55
423	0.55
424	0.59
425	0.59
426	0.64
427	0.67
428	0.7
429	0.77
430	0.77
431	0.8
432	0.8
433	0.82
434	0.81
435	0.77
436	0.72
437	0.63
438	0.56
439	0.46
440	0.41
441	0.34
442	0.27
443	0.25
444	0.24
445	0.23
446	0.21
447	0.21
448	0.17
449	0.14
450	0.16
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.11
458	0.08
459	0.08
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.11
464	0.11
465	0.12
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.06
474	0.09
475	0.12
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.13
480	0.13
481	0.13
482	0.12
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.11
487	0.11
488	0.1
489	0.12
490	0.12
491	0.1
492	0.09
493	0.1
494	0.09
495	0.1
496	0.1
497	0.11
498	0.12
499	0.13
500	0.15
501	0.14
502	0.14
503	0.13
504	0.14
505	0.13
506	0.12
507	0.13
508	0.12
509	0.13
510	0.12
511	0.12
512	0.11
513	0.1
514	0.07
515	0.06
516	0.07
517	0.06
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.09
522	0.1
523	0.11
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.13
528	0.16
529	0.18
530	0.19
531	0.18
532	0.19
533	0.19
534	0.18
535	0.17
536	0.16
537	0.17
538	0.16
539	0.15
540	0.14
541	0.14
542	0.13
543	0.1
544	0.07
545	0.05
546	0.08
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.11
551	0.14
552	0.14
553	0.17
554	0.18
555	0.21
556	0.22
557	0.23
558	0.25
559	0.25
560	0.28
561	0.28
562	0.24
563	0.2
564	0.2
565	0.21
566	0.18
567	0.15
568	0.12
569	0.12
570	0.14
571	0.14
572	0.13
573	0.12
574	0.12
575	0.13
576	0.13
577	0.12
578	0.1
579	0.11
580	0.15
581	0.13
582	0.13
583	0.13
584	0.17
585	0.18
586	0.19
587	0.18
588	0.18
589	0.18
590	0.21
591	0.24
592	0.24
593	0.24
594	0.26
595	0.31
596	0.28
597	0.29
598	0.28
599	0.27
600	0.27
601	0.27
602	0.23
603	0.2
604	0.22
605	0.21
606	0.23
607	0.2
608	0.17
609	0.16
610	0.15
611	0.13
612	0.1
613	0.08
614	0.04
615	0.04
616	0.05
617	0.06
618	0.06
619	0.07
620	0.08
621	0.08
622	0.09
623	0.13
624	0.16
625	0.15
626	0.19
627	0.2
628	0.25
629	0.28
630	0.3
631	0.27
632	0.23
633	0.23
634	0.2
635	0.19
636	0.15
637	0.12
638	0.09
639	0.07
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.08
644	0.1
645	0.1
646	0.11
647	0.11
648	0.11
649	0.11
650	0.13
651	0.2
652	0.2
653	0.23
654	0.27
655	0.31
656	0.32
657	0.33
658	0.33
659	0.28
660	0.27
661	0.24
662	0.2
663	0.17
664	0.15
665	0.12
666	0.1
667	0.08
668	0.1
669	0.09
670	0.09
671	0.08
672	0.1
673	0.1
674	0.11
675	0.14
676	0.18
677	0.18
678	0.18
679	0.18
680	0.18
681	0.21
682	0.22
683	0.2
684	0.12
685	0.13
686	0.13
687	0.13
688	0.11
689	0.07
690	0.06
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.06
697	0.06
698	0.07
699	0.09
700	0.1
701	0.1
702	0.11
703	0.12
704	0.13
705	0.15
706	0.19
707	0.2
708	0.21
709	0.22
710	0.26
711	0.28
712	0.28
713	0.27
714	0.22
715	0.22
716	0.2
717	0.19
718	0.15
719	0.12
720	0.14
721	0.16
722	0.14
723	0.13
724	0.2
725	0.23
726	0.29
727	0.31
728	0.29
729	0.28
730	0.28
731	0.28
732	0.26
733	0.23
734	0.22
735	0.27
736	0.31
737	0.32
738	0.33
739	0.34
740	0.32
741	0.31
742	0.27
743	0.2
744	0.16
745	0.15
746	0.13
747	0.12
748	0.11
749	0.11
750	0.1
751	0.16
752	0.14
753	0.14
754	0.15
755	0.15
756	0.15
757	0.14
758	0.13
759	0.08
760	0.1
761	0.1
762	0.09
763	0.09
764	0.1
765	0.17
766	0.17
767	0.21
768	0.25
769	0.29
770	0.37
771	0.45
772	0.52
773	0.55
774	0.57
775	0.56
776	0.59
777	0.57
778	0.55
779	0.54
780	0.48
781	0.42
782	0.41
783	0.39
784	0.35
785	0.36
786	0.39
787	0.37
788	0.42
789	0.44
790	0.45
791	0.43
792	0.39
793	0.38
794	0.32
795	0.28
796	0.26
797	0.21
798	0.19
799	0.19
800	0.18
801	0.17
802	0.15
803	0.13
804	0.08
805	0.07
806	0.07
807	0.06
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.05
812	0.08
813	0.1
814	0.09
815	0.11
816	0.11
817	0.12
818	0.14
819	0.14
820	0.13
821	0.12
822	0.13
823	0.13
824	0.13
825	0.19
826	0.18
827	0.21
828	0.26
829	0.3
830	0.34
831	0.35
832	0.37
833	0.34
834	0.38
835	0.4
836	0.38
837	0.33
838	0.28
839	0.26
840	0.25
841	0.22
842	0.17
843	0.11
844	0.08
845	0.1
846	0.1
847	0.1
848	0.08
849	0.08
850	0.09
851	0.14
852	0.13
853	0.14
854	0.19
855	0.19
856	0.26
857	0.31
858	0.31
859	0.35
860	0.4
861	0.46
862	0.47
863	0.53
864	0.47
865	0.46
866	0.46
867	0.4
868	0.39
869	0.31
870	0.27
871	0.22
872	0.25
873	0.25
874	0.26
875	0.27
876	0.27
877	0.29
878	0.3
879	0.35
880	0.41
881	0.49
882	0.52
883	0.55
884	0.57
885	0.59
886	0.58
887	0.51
888	0.42
889	0.34
890	0.35
891	0.32
892	0.29
893	0.29
894	0.31
895	0.31
896	0.31
897	0.31
898	0.27
899	0.27
900	0.24
901	0.22
902	0.23
903	0.24
904	0.25
905	0.22
906	0.22
907	0.21
908	0.21
909	0.2
910	0.21
911	0.23
912	0.22
913	0.23
914	0.22
915	0.21
916	0.22
917	0.23
918	0.21
919	0.19
920	0.18
921	0.22
922	0.22
923	0.22
924	0.22
925	0.21
926	0.21
927	0.23
928	0.29
929	0.24
930	0.26
931	0.26
932	0.26
933	0.27
934	0.28
935	0.27
936	0.29
937	0.34
938	0.38
939	0.43
940	0.47
941	0.51
942	0.53
943	0.56
944	0.53
945	0.53
946	0.51
947	0.5
948	0.45
949	0.42
950	0.39
951	0.35
952	0.32
953	0.3
954	0.25
955	0.22
956	0.21
957	0.19
958	0.16
959	0.14
960	0.12
961	0.09
962	0.09
963	0.08
964	0.07
965	0.08
966	0.08
967	0.07
968	0.08
969	0.08
970	0.11
971	0.11
972	0.12
973	0.11
974	0.13
975	0.13
976	0.13
977	0.14
978	0.14
979	0.15
980	0.14
981	0.13
982	0.14
983	0.14
984	0.15
985	0.14
986	0.14
987	0.15
988	0.17
989	0.2
990	0.2
991	0.2
992	0.18
993	0.2
994	0.21
995	0.22
996	0.21
997	0.19
998	0.19
999	0.21
1000	0.29
1001	0.29
1002	0.28
1003	0.28
1004	0.3
1005	0.3
1006	0.29
1007	0.28
1008	0.21
1009	0.18
1010	0.17
1011	0.18
1012	0.15
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.13
1016	0.11
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.11
1020	0.12
1021	0.16
1022	0.19
1023	0.26
1024	0.27
1025	0.32
1026	0.35
1027	0.34
1028	0.36
1029	0.39
1030	0.39
1031	0.39
1032	0.46
1033	0.47
1034	0.47
1035	0.52
1036	0.53
1037	0.54
1038	0.57
1039	0.53
1040	0.52
1041	0.53
1042	0.54
1043	0.56
1044	0.53
1045	0.45
1046	0.39
1047	0.36
1048	0.29
1049	0.23
1050	0.19
1051	0.13
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.09

H6BTC3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer