Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BSX8

Protein Details
Accession H6BSX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-204RAIDLEKKRKDKIRARKVGQLWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-199KKRKDKIRARK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034104  Lsm1  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd01728  LSm1  
Amino Acid Sequences MENLSLDDRPPPSSPQRQGQGQGPAPQNQNQNAVFAGVPPQGAPQLPPQMFTTAAQLLDLTDKKLLLVLRDGRKIFGVLRSWDQFANLVLTDTRERYFVSIPAGTSPDAISATASQDAPSLSANTSLSTATLPRNLYCDIPRGTYLVRGENVLLLGEVDLDREDDPPPGYELGDVEEVFRLQRAIDLEKKRKDKIRARKVGQLWGGEIEGSGEVLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.59
4 0.6
5 0.62
6 0.62
7 0.62
8 0.57
9 0.58
10 0.54
11 0.52
12 0.51
13 0.52
14 0.51
15 0.45
16 0.47
17 0.39
18 0.36
19 0.31
20 0.28
21 0.23
22 0.17
23 0.18
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.15
32 0.23
33 0.23
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.27
38 0.25
39 0.24
40 0.16
41 0.16
42 0.14
43 0.13
44 0.11
45 0.15
46 0.15
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.1
54 0.16
55 0.22
56 0.27
57 0.32
58 0.33
59 0.31
60 0.31
61 0.31
62 0.26
63 0.23
64 0.21
65 0.18
66 0.22
67 0.23
68 0.24
69 0.23
70 0.22
71 0.18
72 0.15
73 0.14
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.11
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.15
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.21
126 0.19
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.21
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.11
140 0.09
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.08
168 0.06
169 0.09
170 0.12
171 0.17
172 0.25
173 0.35
174 0.44
175 0.53
176 0.6
177 0.64
178 0.7
179 0.74
180 0.76
181 0.77
182 0.8
183 0.82
184 0.81
185 0.83
186 0.79
187 0.78
188 0.72
189 0.63
190 0.54
191 0.45
192 0.4
193 0.3
194 0.25
195 0.17
196 0.12