Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C2L8

Protein Details
Accession H6C2L8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-383MSGGRHGQGHRTRKKKKRVVDLRARTENGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-372QGHRTRKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MAFNFNWSPLSTDAGFLPRAQELLTNALNRADPKPAIIVDDIVVNELNLGDVPPELEILEIGDLAEDRFRGTFKMTYRGNAYLTLKTRVQANPLNTYLRTRSAFASPQPLAADKGLTIPLQITLSEFRLSGFIILVFSRQKGLTLVFRNDPLESLRVSSTFDSIPFVANFLQKEIETQLRGLLMDELPAIIHRLSLRLWAPEYTAREERELGATPTAKDEVVVDPLASPPQDPVDSTGAVLTPAEVASLSLDSSIETQSLFSRKNLLRLATLTDSHRTLSLFTPSIRDAVFRAWTGPMERGEMGGLHSRAGTPALSRTHSYAGSLSTNNTYTFDSSTQTRPGLPSFPSANTVLSMSGGRHGQGHRTRKKKKRVVDLRARTENGTPELASEDGSMADTASVSESTSTAPTVFSAPAATGYSDVNPGLGLISPPQSPAHAERAGTATIRRESGSTRDSASVSEGAPGPAISTDTEEPAVVSQKTSPAPDAEATIRARSRKPKPVSLDDDETPRASMYLPDEKARSVSQPITETRSSIPSEKQPGYHSDARTSRPPLPNFLSFVTDSSNAGSIAEQAWMMKMASEMAKRYEEERLRGSFGPMSPPRDMDQVPPPAYAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.19
4 0.2
5 0.16
6 0.16
7 0.15
8 0.16
9 0.15
10 0.2
11 0.24
12 0.23
13 0.23
14 0.25
15 0.26
16 0.27
17 0.26
18 0.26
19 0.22
20 0.23
21 0.26
22 0.24
23 0.25
24 0.23
25 0.22
26 0.17
27 0.2
28 0.18
29 0.15
30 0.14
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.08
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.14
59 0.18
60 0.2
61 0.29
62 0.3
63 0.33
64 0.38
65 0.4
66 0.37
67 0.38
68 0.38
69 0.36
70 0.38
71 0.39
72 0.35
73 0.33
74 0.38
75 0.34
76 0.37
77 0.36
78 0.37
79 0.39
80 0.41
81 0.44
82 0.38
83 0.41
84 0.37
85 0.37
86 0.34
87 0.3
88 0.29
89 0.31
90 0.34
91 0.32
92 0.38
93 0.32
94 0.32
95 0.32
96 0.3
97 0.27
98 0.24
99 0.22
100 0.13
101 0.15
102 0.15
103 0.13
104 0.12
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.15
130 0.21
131 0.25
132 0.29
133 0.29
134 0.31
135 0.32
136 0.3
137 0.29
138 0.23
139 0.19
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.15
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.15
159 0.12
160 0.14
161 0.16
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.05
178 0.07
179 0.06
180 0.08
181 0.08
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.15
187 0.17
188 0.2
189 0.23
190 0.25
191 0.27
192 0.26
193 0.27
194 0.27
195 0.26
196 0.24
197 0.22
198 0.18
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.14
205 0.12
206 0.12
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.06
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.11
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.07
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.19
250 0.2
251 0.26
252 0.28
253 0.27
254 0.25
255 0.25
256 0.28
257 0.22
258 0.23
259 0.19
260 0.19
261 0.18
262 0.17
263 0.16
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.15
272 0.16
273 0.14
274 0.13
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.1
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.08
299 0.05
300 0.09
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.11
318 0.1
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.13
323 0.15
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.17
330 0.16
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.19
335 0.18
336 0.17
337 0.15
338 0.14
339 0.11
340 0.09
341 0.09
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.1
347 0.11
348 0.18
349 0.26
350 0.36
351 0.42
352 0.53
353 0.63
354 0.7
355 0.8
356 0.8
357 0.81
358 0.82
359 0.84
360 0.85
361 0.85
362 0.86
363 0.83
364 0.81
365 0.74
366 0.64
367 0.55
368 0.47
369 0.38
370 0.29
371 0.2
372 0.15
373 0.15
374 0.14
375 0.12
376 0.1
377 0.08
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.13
422 0.16
423 0.21
424 0.21
425 0.21
426 0.21
427 0.23
428 0.23
429 0.21
430 0.2
431 0.18
432 0.18
433 0.19
434 0.18
435 0.16
436 0.18
437 0.23
438 0.24
439 0.2
440 0.21
441 0.22
442 0.22
443 0.21
444 0.22
445 0.18
446 0.15
447 0.16
448 0.14
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.07
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.11
462 0.12
463 0.15
464 0.12
465 0.12
466 0.11
467 0.15
468 0.17
469 0.19
470 0.19
471 0.17
472 0.19
473 0.19
474 0.21
475 0.18
476 0.22
477 0.22
478 0.25
479 0.27
480 0.28
481 0.34
482 0.4
483 0.47
484 0.53
485 0.58
486 0.62
487 0.67
488 0.73
489 0.75
490 0.72
491 0.69
492 0.61
493 0.6
494 0.53
495 0.45
496 0.36
497 0.28
498 0.21
499 0.16
500 0.16
501 0.17
502 0.23
503 0.25
504 0.27
505 0.29
506 0.29
507 0.31
508 0.3
509 0.28
510 0.24
511 0.26
512 0.27
513 0.3
514 0.33
515 0.36
516 0.35
517 0.34
518 0.31
519 0.32
520 0.31
521 0.3
522 0.32
523 0.34
524 0.41
525 0.42
526 0.42
527 0.41
528 0.43
529 0.47
530 0.5
531 0.44
532 0.45
533 0.47
534 0.49
535 0.53
536 0.53
537 0.54
538 0.56
539 0.56
540 0.55
541 0.56
542 0.55
543 0.52
544 0.48
545 0.43
546 0.35
547 0.34
548 0.3
549 0.25
550 0.22
551 0.2
552 0.19
553 0.15
554 0.14
555 0.13
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.09
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.08
566 0.1
567 0.15
568 0.19
569 0.2
570 0.23
571 0.26
572 0.27
573 0.29
574 0.36
575 0.37
576 0.39
577 0.42
578 0.42
579 0.44
580 0.44
581 0.45
582 0.4
583 0.36
584 0.41
585 0.4
586 0.42
587 0.4
588 0.41
589 0.4
590 0.41
591 0.41
592 0.36
593 0.39
594 0.43
595 0.42