Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BKB4

Protein Details
Accession H6BKB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21ITCDCQRKKEEVRCNARANAHydrophilic
91-112DDSEKRYRFKPMKSRQRAFIHSHydrophilic
321-340AEAKRKKQEHEELLRKKAQKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
Amino Acid Sequences MITCDCQRKKEEVRCNARANAPEPALRQTCLKCDEECARLERNRALALALHISDDHTDDHVPYSTTTLNMYLEDVAWAHKQEEILRLFAADDSEKRYRFKPMKSRQRAFIHSIAEDFGFDSESLDPEPHRHVVLFKTPKFVSAPMKTLAQAARIKRGQLNVAAPIHSTAEKKADEVKHEYNGFLLLKPRFALTEDELRPVIKKSAPDTNFDIFFLPQDEGVALIPSMTWDTPEQLVTRLTSLQPTIIGAVTKDNLAGSVVLCHFDTEGPEPKVLRQQGKPVTNEINGWSQVAARRAAPAQAPQVKPVGQKPVYTVLGSRLAEAKRKKQEHEELLRKKAQKQEVVDDWEQEVEREEQVEAERRASLESADGVDEAQTAEKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.81
3 0.78
4 0.74
5 0.69
6 0.62
7 0.59
8 0.52
9 0.47
10 0.43
11 0.45
12 0.41
13 0.37
14 0.4
15 0.35
16 0.38
17 0.39
18 0.4
19 0.33
20 0.37
21 0.42
22 0.4
23 0.4
24 0.38
25 0.4
26 0.41
27 0.45
28 0.42
29 0.4
30 0.38
31 0.35
32 0.32
33 0.26
34 0.25
35 0.24
36 0.2
37 0.17
38 0.15
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.13
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.13
68 0.15
69 0.21
70 0.21
71 0.21
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.12
78 0.11
79 0.17
80 0.22
81 0.24
82 0.26
83 0.27
84 0.36
85 0.41
86 0.49
87 0.54
88 0.59
89 0.69
90 0.77
91 0.81
92 0.8
93 0.81
94 0.76
95 0.71
96 0.66
97 0.57
98 0.47
99 0.42
100 0.34
101 0.26
102 0.21
103 0.15
104 0.1
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.17
120 0.26
121 0.33
122 0.31
123 0.36
124 0.35
125 0.36
126 0.36
127 0.36
128 0.35
129 0.3
130 0.32
131 0.27
132 0.28
133 0.27
134 0.28
135 0.25
136 0.23
137 0.25
138 0.23
139 0.29
140 0.29
141 0.3
142 0.3
143 0.31
144 0.27
145 0.26
146 0.26
147 0.23
148 0.22
149 0.21
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.1
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.2
160 0.21
161 0.23
162 0.28
163 0.29
164 0.3
165 0.3
166 0.29
167 0.23
168 0.23
169 0.2
170 0.15
171 0.17
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.12
180 0.2
181 0.21
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.19
187 0.19
188 0.12
189 0.14
190 0.15
191 0.24
192 0.25
193 0.28
194 0.32
195 0.31
196 0.3
197 0.28
198 0.27
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.1
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.05
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.11
253 0.12
254 0.19
255 0.2
256 0.21
257 0.22
258 0.23
259 0.3
260 0.34
261 0.36
262 0.31
263 0.39
264 0.46
265 0.52
266 0.52
267 0.49
268 0.49
269 0.44
270 0.42
271 0.35
272 0.31
273 0.26
274 0.24
275 0.2
276 0.17
277 0.19
278 0.2
279 0.19
280 0.15
281 0.17
282 0.17
283 0.19
284 0.19
285 0.2
286 0.26
287 0.33
288 0.34
289 0.33
290 0.36
291 0.36
292 0.38
293 0.38
294 0.4
295 0.33
296 0.34
297 0.35
298 0.39
299 0.38
300 0.35
301 0.32
302 0.26
303 0.31
304 0.3
305 0.28
306 0.27
307 0.27
308 0.34
309 0.4
310 0.45
311 0.48
312 0.54
313 0.58
314 0.62
315 0.7
316 0.72
317 0.77
318 0.78
319 0.76
320 0.78
321 0.81
322 0.75
323 0.71
324 0.69
325 0.67
326 0.63
327 0.61
328 0.62
329 0.61
330 0.65
331 0.61
332 0.54
333 0.47
334 0.42
335 0.36
336 0.28
337 0.23
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.14
343 0.17
344 0.25
345 0.24
346 0.24
347 0.24
348 0.24
349 0.25
350 0.24
351 0.21
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.1