Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C273

Protein Details
Accession H6C273    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-55AHANTSPKHNMKPKRKVPYHHHHVLRHKPQSLBasic
264-283STQKISTTPQQQKKGHKGTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF10406  TAF8_C  
CDD cd08049  TAF8  
Amino Acid Sequences MQMSTGSSNMNAHAHDNANPNANAHANTSPKHNMKPKRKVPYHHHHVLRHKPQSLPSAEPALMEQDAVDKLLTDFVKSICEEEAIKQGITDPVIESVALEELVSVADEFMMKFLSRVRRSMQAARRSVPIATDFETAIDVLQVPRPDDQLEPYKTSPRINPPLLPTPPPEDEFHNTVELPPAFLGPELDGHGQLHRFSFNTKGLPELPSAHTYKNTPVYPQRETDTRKIRELATQEGKLGEQALRKLAGAVKLDAAHPLETNGSTQKISTTPQQQKKGHKGTSISVEAIFEETLRDLLAKEPGGFELGPIVNCEKAYRMPDDAQAKRRAAVTDPAVPNGLEKRTNSTTTNRVDVDAMQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.3
4 0.3
5 0.34
6 0.33
7 0.32
8 0.3
9 0.31
10 0.27
11 0.24
12 0.27
13 0.25
14 0.26
15 0.32
16 0.38
17 0.4
18 0.48
19 0.54
20 0.59
21 0.66
22 0.76
23 0.79
24 0.82
25 0.85
26 0.86
27 0.87
28 0.88
29 0.86
30 0.85
31 0.83
32 0.8
33 0.82
34 0.83
35 0.83
36 0.8
37 0.75
38 0.69
39 0.66
40 0.66
41 0.61
42 0.54
43 0.47
44 0.44
45 0.4
46 0.36
47 0.31
48 0.26
49 0.21
50 0.16
51 0.13
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.07
57 0.08
58 0.13
59 0.13
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.2
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.16
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.1
101 0.2
102 0.22
103 0.24
104 0.27
105 0.33
106 0.38
107 0.47
108 0.5
109 0.5
110 0.52
111 0.51
112 0.51
113 0.45
114 0.41
115 0.33
116 0.27
117 0.2
118 0.18
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.1
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.15
136 0.21
137 0.23
138 0.25
139 0.26
140 0.31
141 0.31
142 0.33
143 0.33
144 0.34
145 0.38
146 0.37
147 0.38
148 0.38
149 0.44
150 0.43
151 0.41
152 0.34
153 0.32
154 0.32
155 0.31
156 0.27
157 0.23
158 0.25
159 0.25
160 0.24
161 0.2
162 0.18
163 0.16
164 0.18
165 0.14
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.04
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.13
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.17
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.18
194 0.18
195 0.19
196 0.21
197 0.2
198 0.2
199 0.2
200 0.23
201 0.26
202 0.24
203 0.25
204 0.3
205 0.34
206 0.36
207 0.37
208 0.35
209 0.36
210 0.4
211 0.45
212 0.48
213 0.46
214 0.46
215 0.46
216 0.44
217 0.42
218 0.4
219 0.4
220 0.36
221 0.34
222 0.31
223 0.3
224 0.28
225 0.24
226 0.22
227 0.16
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.18
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.17
243 0.13
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.15
256 0.21
257 0.29
258 0.38
259 0.46
260 0.56
261 0.61
262 0.69
263 0.78
264 0.8
265 0.74
266 0.69
267 0.64
268 0.58
269 0.59
270 0.52
271 0.43
272 0.34
273 0.3
274 0.25
275 0.23
276 0.18
277 0.1
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.08
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.15
292 0.13
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.17
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.14
302 0.18
303 0.21
304 0.23
305 0.26
306 0.27
307 0.34
308 0.43
309 0.48
310 0.51
311 0.55
312 0.53
313 0.5
314 0.51
315 0.46
316 0.4
317 0.4
318 0.37
319 0.4
320 0.4
321 0.4
322 0.38
323 0.35
324 0.35
325 0.32
326 0.31
327 0.26
328 0.26
329 0.32
330 0.36
331 0.4
332 0.41
333 0.43
334 0.47
335 0.48
336 0.53
337 0.46
338 0.42
339 0.39