Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6CBN6

Protein Details
Accession H6CBN6    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-54ELAITSKKGNKVKKNADPSNPAHydrophilic
192-218SGSGNKKQKTEEKKPRGRPRKDATAADBasic
234-266TETDQQQPAKRKPGRPKKSDQQQSKKKEPTARSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-221KTVRGRGRPAGSGSGNKKQKTEEKKPRGRPRKDATAADSKA
242-262AKRKPGRPKKSDQQQSKKKEP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR021331  Hva1_TUDOR  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF11160  Hva1_TUDOR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MAGEEVEKGDKVSWNWGSGHPGGVVSEVKTEGELAITSKKGNKVKKNADPSNPAVHIERSGNDVVKRASELTVEEKANGSGSAATSGSGSKDADADADADAQTKKNGDDNSSSNNNNNNKRKHDEVAADEDDSKDKTDNDDEAAAAATAEEAENDKKEDQEDQDNDQDEPEPALKENAEGKTVRGRGRPAGSGSGNKKQKTEEKKPRGRPRKDATAADSKAKPEQPSTKQKEATETDQQQPAKRKPGRPKKSDQQQSKKKEPTARSLEGIGSRTRSQRTRTRSGETE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.31
4 0.35
5 0.31
6 0.32
7 0.24
8 0.22
9 0.19
10 0.19
11 0.18
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.12
23 0.13
24 0.15
25 0.19
26 0.27
27 0.34
28 0.42
29 0.5
30 0.57
31 0.67
32 0.74
33 0.8
34 0.81
35 0.81
36 0.79
37 0.74
38 0.71
39 0.62
40 0.54
41 0.46
42 0.39
43 0.34
44 0.28
45 0.25
46 0.21
47 0.22
48 0.23
49 0.21
50 0.23
51 0.21
52 0.2
53 0.21
54 0.18
55 0.16
56 0.14
57 0.15
58 0.17
59 0.21
60 0.2
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.16
66 0.12
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.19
96 0.21
97 0.27
98 0.3
99 0.3
100 0.28
101 0.34
102 0.39
103 0.44
104 0.49
105 0.49
106 0.5
107 0.54
108 0.55
109 0.51
110 0.49
111 0.43
112 0.38
113 0.39
114 0.35
115 0.31
116 0.27
117 0.25
118 0.21
119 0.17
120 0.15
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.11
146 0.12
147 0.19
148 0.2
149 0.22
150 0.26
151 0.27
152 0.26
153 0.24
154 0.22
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.15
167 0.16
168 0.22
169 0.27
170 0.28
171 0.27
172 0.28
173 0.31
174 0.34
175 0.35
176 0.31
177 0.31
178 0.3
179 0.34
180 0.37
181 0.41
182 0.44
183 0.43
184 0.42
185 0.42
186 0.48
187 0.51
188 0.58
189 0.6
190 0.65
191 0.74
192 0.83
193 0.9
194 0.92
195 0.9
196 0.88
197 0.85
198 0.85
199 0.81
200 0.75
201 0.7
202 0.69
203 0.64
204 0.59
205 0.53
206 0.44
207 0.43
208 0.42
209 0.38
210 0.35
211 0.41
212 0.45
213 0.54
214 0.6
215 0.63
216 0.64
217 0.64
218 0.65
219 0.61
220 0.59
221 0.58
222 0.54
223 0.51
224 0.53
225 0.54
226 0.52
227 0.57
228 0.56
229 0.57
230 0.6
231 0.63
232 0.68
233 0.77
234 0.81
235 0.81
236 0.85
237 0.85
238 0.88
239 0.9
240 0.89
241 0.89
242 0.89
243 0.9
244 0.9
245 0.88
246 0.85
247 0.84
248 0.78
249 0.77
250 0.76
251 0.71
252 0.63
253 0.57
254 0.53
255 0.48
256 0.44
257 0.37
258 0.33
259 0.32
260 0.35
261 0.4
262 0.42
263 0.46
264 0.52
265 0.58
266 0.63
267 0.65