Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BXD7

Protein Details
Accession H6BXD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-117SQTGRAAKVRRRPRSRFAQAETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-110TGRAAKVRRRPRS
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Amino Acid Sequences MPLIRLCSRTWVVLPHHNASVTVALATLQRTAASRRCSWQWSVTQKIPFSTGRAALGDQQRPLRTTDPDIDINSLRNTLQAVREANRASLAVRKGSQTGRAAKVRRRPRSRFAQAETSADSQPQLRRSFDHSSQYVNEEKRKRTVKKVEVLATTSDHSITGTTELDEDVGTIRELTSFWRPADEDRTLPARLRLPWLVNLPESTGWTSAIDRLSAEIRAFEQYVTPSEEEQLVVETALQDLTQAIKYTDHDLDVDVIGSRATGIADPLSDLDINVWKPRTPATMSKPKTPVQILALLEKAFRGTHEKIKLGFRPVEVIYNLRTARVPILLCRHKFSGLSIQIQCTPPTYDSTEYVKAFLREYPTLKSLFKVLKQLLLMRGLTVGSHGGLTSYPLLNMIVAALKFSEGQIHPSDAGKQLLFFLDMYSEMDFSSQGISTRPLQFFPKRTSGRHGRHKATVSSGQTPSLSELFPQELAGQRKMTLHRGKAAYLMTLQDPANPFNDVGRSAYMIKDVQATLISVRSNLNQAIKEWDQSSPDFKTQQGSPRPQALLESCLGADYRIYEQERGDMKALGRQLLISTKVQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.46
4 0.43
5 0.41
6 0.36
7 0.31
8 0.23
9 0.17
10 0.13
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.12
18 0.18
19 0.24
20 0.29
21 0.32
22 0.36
23 0.42
24 0.46
25 0.49
26 0.51
27 0.53
28 0.56
29 0.6
30 0.61
31 0.62
32 0.59
33 0.56
34 0.53
35 0.45
36 0.41
37 0.38
38 0.33
39 0.29
40 0.29
41 0.28
42 0.31
43 0.37
44 0.37
45 0.36
46 0.39
47 0.4
48 0.4
49 0.42
50 0.39
51 0.35
52 0.37
53 0.39
54 0.38
55 0.39
56 0.39
57 0.39
58 0.37
59 0.35
60 0.31
61 0.26
62 0.2
63 0.18
64 0.18
65 0.17
66 0.19
67 0.21
68 0.24
69 0.25
70 0.31
71 0.31
72 0.3
73 0.28
74 0.26
75 0.21
76 0.24
77 0.24
78 0.23
79 0.23
80 0.24
81 0.28
82 0.3
83 0.35
84 0.36
85 0.4
86 0.43
87 0.5
88 0.54
89 0.57
90 0.65
91 0.69
92 0.73
93 0.75
94 0.76
95 0.77
96 0.82
97 0.85
98 0.84
99 0.79
100 0.78
101 0.7
102 0.66
103 0.6
104 0.52
105 0.43
106 0.34
107 0.29
108 0.23
109 0.25
110 0.28
111 0.28
112 0.26
113 0.28
114 0.35
115 0.41
116 0.42
117 0.46
118 0.41
119 0.42
120 0.42
121 0.43
122 0.43
123 0.4
124 0.43
125 0.42
126 0.45
127 0.49
128 0.57
129 0.59
130 0.63
131 0.69
132 0.7
133 0.71
134 0.75
135 0.73
136 0.66
137 0.62
138 0.54
139 0.45
140 0.37
141 0.29
142 0.21
143 0.15
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.09
163 0.14
164 0.16
165 0.16
166 0.18
167 0.19
168 0.22
169 0.28
170 0.27
171 0.22
172 0.22
173 0.26
174 0.25
175 0.25
176 0.26
177 0.24
178 0.23
179 0.26
180 0.26
181 0.25
182 0.27
183 0.3
184 0.28
185 0.25
186 0.24
187 0.21
188 0.19
189 0.18
190 0.16
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.09
234 0.12
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.07
260 0.08
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.15
267 0.16
268 0.22
269 0.27
270 0.37
271 0.39
272 0.45
273 0.48
274 0.47
275 0.47
276 0.42
277 0.36
278 0.28
279 0.31
280 0.25
281 0.22
282 0.21
283 0.17
284 0.16
285 0.14
286 0.13
287 0.07
288 0.07
289 0.12
290 0.14
291 0.2
292 0.24
293 0.26
294 0.28
295 0.33
296 0.35
297 0.33
298 0.32
299 0.25
300 0.25
301 0.24
302 0.24
303 0.2
304 0.18
305 0.15
306 0.19
307 0.18
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.14
314 0.12
315 0.21
316 0.27
317 0.28
318 0.31
319 0.31
320 0.29
321 0.29
322 0.28
323 0.29
324 0.25
325 0.3
326 0.28
327 0.28
328 0.31
329 0.32
330 0.3
331 0.22
332 0.2
333 0.15
334 0.17
335 0.18
336 0.16
337 0.18
338 0.22
339 0.25
340 0.24
341 0.25
342 0.23
343 0.21
344 0.21
345 0.2
346 0.2
347 0.19
348 0.2
349 0.22
350 0.22
351 0.24
352 0.24
353 0.22
354 0.23
355 0.23
356 0.24
357 0.28
358 0.26
359 0.27
360 0.28
361 0.3
362 0.27
363 0.26
364 0.24
365 0.17
366 0.17
367 0.14
368 0.12
369 0.1
370 0.08
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.12
393 0.1
394 0.13
395 0.15
396 0.16
397 0.17
398 0.17
399 0.2
400 0.17
401 0.19
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.11
423 0.15
424 0.22
425 0.22
426 0.23
427 0.29
428 0.35
429 0.4
430 0.44
431 0.49
432 0.47
433 0.5
434 0.57
435 0.61
436 0.64
437 0.69
438 0.72
439 0.67
440 0.7
441 0.72
442 0.65
443 0.61
444 0.59
445 0.52
446 0.5
447 0.46
448 0.4
449 0.36
450 0.34
451 0.3
452 0.24
453 0.19
454 0.13
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.13
460 0.18
461 0.23
462 0.25
463 0.23
464 0.23
465 0.28
466 0.31
467 0.38
468 0.4
469 0.39
470 0.44
471 0.45
472 0.45
473 0.44
474 0.42
475 0.34
476 0.27
477 0.26
478 0.19
479 0.2
480 0.19
481 0.19
482 0.2
483 0.19
484 0.2
485 0.19
486 0.18
487 0.17
488 0.19
489 0.16
490 0.16
491 0.16
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.18
496 0.17
497 0.17
498 0.18
499 0.17
500 0.15
501 0.15
502 0.15
503 0.13
504 0.15
505 0.15
506 0.13
507 0.14
508 0.15
509 0.18
510 0.21
511 0.24
512 0.23
513 0.24
514 0.3
515 0.3
516 0.32
517 0.3
518 0.29
519 0.28
520 0.29
521 0.33
522 0.3
523 0.33
524 0.32
525 0.31
526 0.34
527 0.35
528 0.42
529 0.47
530 0.51
531 0.51
532 0.57
533 0.57
534 0.53
535 0.53
536 0.46
537 0.4
538 0.32
539 0.28
540 0.21
541 0.2
542 0.2
543 0.15
544 0.13
545 0.11
546 0.13
547 0.19
548 0.21
549 0.23
550 0.23
551 0.31
552 0.33
553 0.34
554 0.33
555 0.3
556 0.28
557 0.31
558 0.33
559 0.28
560 0.25
561 0.22
562 0.23
563 0.24
564 0.27