FuNGI

H6CA50

Protein Details

Accession

H6CA50

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-75	QKGHHRRSLYKALRQKKDVRVGKL	Basic
761-807	VPNQRTKTIKEIRKAQKKQEKTREESRLSRRQKRELEKEERIRKQFP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
57-88	RRSLYKALRQKKDVRVGKLSRAGSVPARARRR
769-805	IKEIRKAQKKQEKTREESRLSRRQKRELEKEERIRKQ

Subcellular Location(s)

mito 15.5, mito_nucl 12.5, nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Pfam	View protein in Pfam PF13041 PPR_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR

Amino Acid Sequences

MFSCSLCVRRALQSLAPSPSASATRLTVSSLPSIVLPTTNISRSHATLQSIQKGHHRRSLYKALRQKKDVRVGKLSRAGSVPARARRRDVLAREENRGRLITDSTGRNLDRAMRLEAKYLVDPLKLAQSVVEKLRDDDFDAAMSLVRASEKSRDGMPVDNIVSWNHIIDWLMSKGEPSMAWKVYNEMKKRGHKPDAHTYTIMLKGYRENIKKPNAVKQAVAVYDSIFAANSNVTPTTIHTNAVLSVCARANDIDSLWRIAGRLPDKGPGAPDHITFTTILQAINAEVRARAIEMGSRNGPSYDPQPLFEQAVSDARKLWVDITARWRKGDLQLDEALVCAMGRLLMLSTDPKAHEDILNLVQQTMNISKNPDASEAPDSDTVAEDSDTTAASGERQASPGSSQSLAKPVSYLPQRGSAPTSIYATPGRNTLSMLLETTTALRYLRQGKYYWDLLTSPEGPYKIVPDHQNIMTYLRLLRVSRASQATLDVLRQPRPKEIQDRLMVRGTFFIAMSTCLRDKNNPNVFEIANRILDLMQGNAEAADQTPSTEVEGQKLRMSPKVLTKYLELALATTNGLNGARLNKTKDGDLDFERDPRKNNTLRALRRLAPDMLNVKRLLKLHITELEQHAAVKSRTPTVQKLLAKRELTHLRVSETIEELVEFLRILIRAHDKILMVNERLEDDGMGPLDKEILSECWSQKRKLSAFISKINNARGIPNESQRVPHERERTQGLSDRPTSTEAVEEDDEFEDEPGASLDAAVPNQRTKTIKEIRKAQKKQEKTREESRLSRRQKRELEKEERIRKQFPPSMLKPKPTQSSNVHQQSRGRNTSSLSRGYSGWGGEFEALAREQGQGEKTEFVDLRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.46
3	0.44
4	0.38
5	0.34
6	0.33
7	0.3
8	0.24
9	0.2
10	0.18
11	0.19
12	0.19
13	0.21
14	0.21
15	0.21
16	0.22
17	0.2
18	0.19
19	0.17
20	0.18
21	0.16
22	0.14
23	0.13
24	0.14
25	0.18
26	0.22
27	0.22
28	0.25
29	0.28
30	0.3
31	0.34
32	0.35
33	0.34
34	0.38
35	0.44
36	0.49
37	0.47
38	0.46
39	0.5
40	0.55
41	0.57
42	0.56
43	0.56
44	0.52
45	0.59
46	0.68
47	0.67
48	0.68
49	0.73
50	0.76
51	0.78
52	0.81
53	0.82
54	0.8
55	0.82
56	0.8
57	0.78
58	0.78
59	0.74
60	0.75
61	0.74
62	0.65
63	0.57
64	0.5
65	0.46
66	0.4
67	0.43
68	0.42
69	0.43
70	0.5
71	0.51
72	0.54
73	0.55
74	0.59
75	0.6
76	0.58
77	0.59
78	0.61
79	0.62
80	0.66
81	0.66
82	0.6
83	0.54
84	0.49
85	0.4
86	0.32
87	0.3
88	0.27
89	0.28
90	0.28
91	0.28
92	0.33
93	0.33
94	0.31
95	0.3
96	0.31
97	0.3
98	0.3
99	0.33
100	0.34
101	0.34
102	0.37
103	0.38
104	0.35
105	0.31
106	0.32
107	0.28
108	0.21
109	0.21
110	0.19
111	0.22
112	0.2
113	0.18
114	0.17
115	0.19
116	0.22
117	0.26
118	0.29
119	0.24
120	0.25
121	0.28
122	0.27
123	0.26
124	0.24
125	0.21
126	0.17
127	0.16
128	0.15
129	0.12
130	0.11
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.09
136	0.14
137	0.16
138	0.18
139	0.19
140	0.23
141	0.24
142	0.27
143	0.28
144	0.27
145	0.26
146	0.25
147	0.25
148	0.21
149	0.22
150	0.18
151	0.16
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.13
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.12
164	0.13
165	0.17
166	0.18
167	0.19
168	0.19
169	0.23
170	0.29
171	0.37
172	0.37
173	0.4
174	0.47
175	0.55
176	0.64
177	0.7
178	0.72
179	0.7
180	0.73
181	0.76
182	0.74
183	0.69
184	0.61
185	0.53
186	0.47
187	0.44
188	0.38
189	0.27
190	0.21
191	0.2
192	0.26
193	0.33
194	0.32
195	0.35
196	0.42
197	0.48
198	0.53
199	0.54
200	0.57
201	0.58
202	0.56
203	0.5
204	0.46
205	0.43
206	0.38
207	0.35
208	0.26
209	0.17
210	0.16
211	0.16
212	0.12
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.1
223	0.15
224	0.16
225	0.16
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.17
230	0.15
231	0.09
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.11
241	0.12
242	0.13
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.12
247	0.18
248	0.17
249	0.2
250	0.2
251	0.23
252	0.24
253	0.25
254	0.25
255	0.21
256	0.23
257	0.21
258	0.2
259	0.2
260	0.2
261	0.2
262	0.18
263	0.16
264	0.15
265	0.14
266	0.13
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.1
272	0.07
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.09
280	0.1
281	0.13
282	0.15
283	0.15
284	0.15
285	0.16
286	0.16
287	0.14
288	0.15
289	0.2
290	0.19
291	0.2
292	0.22
293	0.23
294	0.24
295	0.22
296	0.2
297	0.13
298	0.19
299	0.19
300	0.16
301	0.16
302	0.15
303	0.16
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.13
308	0.16
309	0.25
310	0.33
311	0.34
312	0.34
313	0.35
314	0.32
315	0.37
316	0.41
317	0.33
318	0.29
319	0.29
320	0.29
321	0.28
322	0.26
323	0.19
324	0.11
325	0.09
326	0.04
327	0.03
328	0.02
329	0.02
330	0.02
331	0.02
332	0.03
333	0.03
334	0.05
335	0.06
336	0.07
337	0.08
338	0.09
339	0.1
340	0.11
341	0.12
342	0.11
343	0.14
344	0.14
345	0.16
346	0.14
347	0.14
348	0.13
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.11
353	0.1
354	0.12
355	0.13
356	0.15
357	0.16
358	0.16
359	0.14
360	0.16
361	0.17
362	0.16
363	0.17
364	0.15
365	0.15
366	0.13
367	0.13
368	0.11
369	0.08
370	0.07
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.1
389	0.11
390	0.1
391	0.15
392	0.15
393	0.14
394	0.14
395	0.12
396	0.17
397	0.19
398	0.2
399	0.16
400	0.21
401	0.22
402	0.22
403	0.24
404	0.19
405	0.18
406	0.17
407	0.18
408	0.13
409	0.14
410	0.16
411	0.15
412	0.14
413	0.14
414	0.14
415	0.12
416	0.12
417	0.12
418	0.11
419	0.1
420	0.1
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.09
430	0.16
431	0.18
432	0.2
433	0.21
434	0.23
435	0.27
436	0.29
437	0.25
438	0.19
439	0.17
440	0.16
441	0.19
442	0.17
443	0.14
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.12
448	0.13
449	0.11
450	0.14
451	0.16
452	0.17
453	0.2
454	0.2
455	0.21
456	0.2
457	0.2
458	0.16
459	0.15
460	0.12
461	0.11
462	0.12
463	0.11
464	0.12
465	0.14
466	0.15
467	0.18
468	0.19
469	0.18
470	0.17
471	0.18
472	0.17
473	0.14
474	0.14
475	0.14
476	0.15
477	0.2
478	0.24
479	0.24
480	0.28
481	0.32
482	0.36
483	0.39
484	0.42
485	0.44
486	0.46
487	0.48
488	0.46
489	0.46
490	0.41
491	0.33
492	0.29
493	0.22
494	0.16
495	0.13
496	0.11
497	0.07
498	0.08
499	0.09
500	0.1
501	0.1
502	0.12
503	0.13
504	0.18
505	0.23
506	0.32
507	0.39
508	0.38
509	0.39
510	0.39
511	0.38
512	0.34
513	0.33
514	0.24
515	0.17
516	0.15
517	0.14
518	0.11
519	0.12
520	0.11
521	0.08
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.11
536	0.11
537	0.14
538	0.17
539	0.17
540	0.19
541	0.22
542	0.22
543	0.22
544	0.24
545	0.23
546	0.29
547	0.35
548	0.34
549	0.33
550	0.33
551	0.33
552	0.31
553	0.29
554	0.21
555	0.14
556	0.13
557	0.12
558	0.11
559	0.08
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.09
566	0.13
567	0.16
568	0.19
569	0.23
570	0.24
571	0.25
572	0.27
573	0.27
574	0.27
575	0.27
576	0.28
577	0.25
578	0.3
579	0.32
580	0.31
581	0.31
582	0.33
583	0.38
584	0.38
585	0.42
586	0.46
587	0.52
588	0.56
589	0.6
590	0.6
591	0.56
592	0.55
593	0.53
594	0.47
595	0.38
596	0.37
597	0.36
598	0.33
599	0.32
600	0.3
601	0.27
602	0.28
603	0.28
604	0.26
605	0.24
606	0.23
607	0.24
608	0.28
609	0.29
610	0.29
611	0.3
612	0.29
613	0.25
614	0.23
615	0.2
616	0.19
617	0.17
618	0.18
619	0.17
620	0.19
621	0.22
622	0.26
623	0.29
624	0.31
625	0.39
626	0.4
627	0.46
628	0.5
629	0.53
630	0.51
631	0.48
632	0.52
633	0.51
634	0.49
635	0.47
636	0.41
637	0.36
638	0.36
639	0.37
640	0.3
641	0.24
642	0.21
643	0.16
644	0.15
645	0.12
646	0.1
647	0.09
648	0.07
649	0.05
650	0.06
651	0.07
652	0.07
653	0.11
654	0.16
655	0.17
656	0.18
657	0.21
658	0.19
659	0.2
660	0.26
661	0.26
662	0.22
663	0.22
664	0.22
665	0.2
666	0.21
667	0.19
668	0.14
669	0.1
670	0.11
671	0.1
672	0.09
673	0.08
674	0.08
675	0.09
676	0.08
677	0.08
678	0.07
679	0.09
680	0.12
681	0.17
682	0.19
683	0.28
684	0.32
685	0.34
686	0.37
687	0.45
688	0.44
689	0.48
690	0.53
691	0.53
692	0.55
693	0.61
694	0.63
695	0.59
696	0.61
697	0.55
698	0.52
699	0.43
700	0.4
701	0.36
702	0.36
703	0.35
704	0.38
705	0.41
706	0.37
707	0.4
708	0.42
709	0.45
710	0.44
711	0.48
712	0.5
713	0.46
714	0.5
715	0.53
716	0.52
717	0.49
718	0.49
719	0.45
720	0.44
721	0.45
722	0.43
723	0.38
724	0.37
725	0.34
726	0.28
727	0.27
728	0.2
729	0.21
730	0.2
731	0.18
732	0.18
733	0.17
734	0.17
735	0.15
736	0.14
737	0.1
738	0.09
739	0.09
740	0.07
741	0.07
742	0.06
743	0.06
744	0.07
745	0.08
746	0.09
747	0.12
748	0.14
749	0.17
750	0.18
751	0.23
752	0.25
753	0.26
754	0.36
755	0.43
756	0.49
757	0.54
758	0.64
759	0.7
760	0.78
761	0.83
762	0.83
763	0.84
764	0.86
765	0.89
766	0.89
767	0.88
768	0.85
769	0.87
770	0.86
771	0.83
772	0.82
773	0.81
774	0.81
775	0.81
776	0.84
777	0.82
778	0.82
779	0.85
780	0.86
781	0.87
782	0.87
783	0.87
784	0.87
785	0.89
786	0.9
787	0.89
788	0.85
789	0.79
790	0.74
791	0.74
792	0.69
793	0.67
794	0.66
795	0.65
796	0.7
797	0.72
798	0.73
799	0.69
800	0.71
801	0.72
802	0.65
803	0.65
804	0.61
805	0.64
806	0.68
807	0.72
808	0.68
809	0.64
810	0.68
811	0.7
812	0.73
813	0.69
814	0.62
815	0.54
816	0.53
817	0.58
818	0.57
819	0.53
820	0.46
821	0.41
822	0.38
823	0.39
824	0.38
825	0.3
826	0.25
827	0.2
828	0.18
829	0.17
830	0.16
831	0.13
832	0.13
833	0.12
834	0.12
835	0.11
836	0.11
837	0.12
838	0.16
839	0.18
840	0.18
841	0.2
842	0.22
843	0.22
844	0.28

H6CA50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer