FuNGI

H6BKF4

Protein Details

Accession

H6BKF4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-40	TTTGPKPKPRAGVVRKTKAER	Hydrophilic
197-226	DDIHKGKGNQKQKQRRRTHRPPTGLRPVRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-89	GAKPTTTGPKPKPRAGVVRKTKAEREQFAKEEAERQKARLAEEAAKNARGGARGGRGGAAGRGGRGGAAGGERA
201-261	KGKGNQKQKQRRRTHRPPTGLRPVRAPHARRESEEEAAAAKKKAAGTTAARSTTEKRKPSV

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPDPPAGQPAKPAAAGAKPTTTGPKPKPRAGVVRKTKAEREQFAKEEAERQKARLAEEAAKNARGGARGGRGGAAGRGGRGGAAGGERAREGPVSVGSGVFGAGSGLRPGARSRMQVEGHSEMLDGQPGFKYDESQSGMLAGGSSGGGGGGGTRSGGGEGFGEDDELDEPKRDIERIWISSGEEEEEEDAVVADDGDDIHKGKGNQKQKQRRRTHRPPTGLRPVRAPHARRESEEEAAAAKKKAAGTTAARSTTEKRKPSVTIKKRASDAQDQAVADDHEGAMDVDRDPDVAVEDDPVFVKEQPSSPEMRRRSLRKASSSTKARDARLAIETIEEKAERLRVADDADKLREFLLAAPQITEDENVDEEQILEDGKLFLFQLPPMTPYLLDADLVAQQESVAVKAEPNIDATVSTGGGGAEVKKDPETGDVSGAAKPNLETEGLLTASEPTRLPSGLVGKLRVHKSGKVSLDWGGTDMEVRYGAEVDFLQDVVMVTPPIKTEENEEQNQVPDLLNPDQDANQTTAKDKDKGAGKAYALGQVRRKMVLIPDWEKLYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.31
3	0.29
4	0.27
5	0.25
6	0.27
7	0.34
8	0.36
9	0.41
10	0.46
11	0.55
12	0.6
13	0.66
14	0.71
15	0.72
16	0.77
17	0.77
18	0.78
19	0.78
20	0.81
21	0.81
22	0.8
23	0.8
24	0.78
25	0.77
26	0.74
27	0.7
28	0.68
29	0.63
30	0.61
31	0.58
32	0.5
33	0.5
34	0.48
35	0.51
36	0.44
37	0.43
38	0.44
39	0.43
40	0.44
41	0.41
42	0.39
43	0.38
44	0.41
45	0.48
46	0.46
47	0.45
48	0.42
49	0.38
50	0.35
51	0.28
52	0.25
53	0.22
54	0.24
55	0.24
56	0.25
57	0.23
58	0.22
59	0.21
60	0.2
61	0.2
62	0.15
63	0.13
64	0.13
65	0.12
66	0.12
67	0.11
68	0.1
69	0.07
70	0.07
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.11
78	0.11
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.12
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.09
87	0.07
88	0.06
89	0.04
90	0.04
91	0.05
92	0.05
93	0.06
94	0.06
95	0.08
96	0.09
97	0.15
98	0.18
99	0.21
100	0.23
101	0.3
102	0.32
103	0.33
104	0.38
105	0.35
106	0.32
107	0.29
108	0.26
109	0.19
110	0.18
111	0.18
112	0.12
113	0.1
114	0.09
115	0.1
116	0.13
117	0.12
118	0.15
119	0.13
120	0.2
121	0.22
122	0.22
123	0.2
124	0.19
125	0.19
126	0.16
127	0.14
128	0.08
129	0.05
130	0.04
131	0.04
132	0.03
133	0.03
134	0.03
135	0.02
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.03
141	0.03
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.05
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.07
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.09
158	0.11
159	0.1
160	0.1
161	0.17
162	0.22
163	0.24
164	0.26
165	0.24
166	0.24
167	0.25
168	0.25
169	0.18
170	0.12
171	0.1
172	0.09
173	0.08
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.06
187	0.08
188	0.1
189	0.16
190	0.24
191	0.33
192	0.4
193	0.5
194	0.61
195	0.68
196	0.78
197	0.83
198	0.86
199	0.87
200	0.91
201	0.91
202	0.9
203	0.9
204	0.87
205	0.85
206	0.85
207	0.8
208	0.7
209	0.64
210	0.57
211	0.55
212	0.55
213	0.48
214	0.46
215	0.49
216	0.5
217	0.46
218	0.52
219	0.48
220	0.42
221	0.4
222	0.31
223	0.23
224	0.22
225	0.22
226	0.14
227	0.11
228	0.11
229	0.12
230	0.12
231	0.11
232	0.14
233	0.15
234	0.2
235	0.23
236	0.22
237	0.22
238	0.24
239	0.27
240	0.33
241	0.37
242	0.36
243	0.34
244	0.36
245	0.4
246	0.49
247	0.56
248	0.55
249	0.58
250	0.6
251	0.62
252	0.61
253	0.6
254	0.54
255	0.5
256	0.44
257	0.37
258	0.34
259	0.3
260	0.28
261	0.26
262	0.21
263	0.13
264	0.11
265	0.07
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.11
291	0.13
292	0.17
293	0.19
294	0.27
295	0.3
296	0.34
297	0.39
298	0.42
299	0.49
300	0.54
301	0.57
302	0.55
303	0.59
304	0.59
305	0.62
306	0.64
307	0.58
308	0.58
309	0.56
310	0.51
311	0.47
312	0.43
313	0.37
314	0.31
315	0.29
316	0.2
317	0.17
318	0.16
319	0.13
320	0.13
321	0.1
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.12
330	0.14
331	0.17
332	0.18
333	0.2
334	0.19
335	0.19
336	0.18
337	0.16
338	0.13
339	0.11
340	0.14
341	0.14
342	0.14
343	0.14
344	0.13
345	0.14
346	0.14
347	0.13
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.1
368	0.1
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.12
373	0.12
374	0.14
375	0.11
376	0.11
377	0.1
378	0.09
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.07
390	0.09
391	0.11
392	0.1
393	0.12
394	0.12
395	0.11
396	0.11
397	0.11
398	0.1
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.06
406	0.08
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.11
411	0.11
412	0.14
413	0.17
414	0.15
415	0.16
416	0.17
417	0.17
418	0.19
419	0.2
420	0.17
421	0.14
422	0.13
423	0.13
424	0.12
425	0.12
426	0.09
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.11
431	0.1
432	0.11
433	0.11
434	0.13
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.14
441	0.19
442	0.23
443	0.25
444	0.27
445	0.3
446	0.37
447	0.39
448	0.42
449	0.41
450	0.4
451	0.43
452	0.48
453	0.47
454	0.41
455	0.41
456	0.37
457	0.36
458	0.32
459	0.27
460	0.2
461	0.16
462	0.15
463	0.13
464	0.11
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.09
471	0.08
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.09
484	0.12
485	0.14
486	0.14
487	0.2
488	0.29
489	0.37
490	0.39
491	0.42
492	0.39
493	0.39
494	0.4
495	0.34
496	0.24
497	0.19
498	0.21
499	0.2
500	0.2
501	0.19
502	0.2
503	0.2
504	0.22
505	0.22
506	0.2
507	0.21
508	0.21
509	0.23
510	0.29
511	0.32
512	0.34
513	0.33
514	0.36
515	0.41
516	0.45
517	0.47
518	0.45
519	0.41
520	0.43
521	0.44
522	0.44
523	0.4
524	0.41
525	0.43
526	0.44
527	0.45
528	0.41
529	0.4
530	0.36
531	0.38
532	0.4
533	0.42
534	0.4
535	0.43

H6BKF4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer