Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BVD4

Protein Details
Accession H6BVD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-125PTPKEAKPAKKTTTKRKKKSSAAKPKPKGRKRLSKTAVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-122PASRPKAHTGRAPAKRSPTPKEAKPAKKTTTKRKKKSSAAKPKPKGRKRLSK
223-243RRQLAKKAKEAGKKTKFQRLK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTASLPYSRTLSKQLIARTARSFTRPSATPLLRVTCDCTPNSARSTRAHGFLGHLSTVKSARSYATSTDKPASRPKAHTGRAPAKRSPTPKEAKPAKKTTTKRKKKSSAAKPKPKGRKRLSKTAVLQKQRQEQKDLRATALLDQPKQLPQTAYTLVVVEEAKKGGDVKSNAASASARYRSLSPEEREEYNHQANLNKEKNEQAYKRWVQGFTPLQIKQANNARRQLAKKAKEAGKKTKFQRLKDDRTVKAPRNAYSFFFTERHRSGDLKGLSVGESGKLIGREWKNLSPAEKKPYEDKAAADKARYEEEYKTVYGVDPPHLRRGSGSSST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.45
3 0.46
4 0.48
5 0.46
6 0.46
7 0.45
8 0.44
9 0.43
10 0.37
11 0.4
12 0.37
13 0.39
14 0.44
15 0.42
16 0.43
17 0.45
18 0.46
19 0.42
20 0.41
21 0.4
22 0.36
23 0.38
24 0.34
25 0.35
26 0.34
27 0.37
28 0.4
29 0.38
30 0.36
31 0.35
32 0.43
33 0.4
34 0.4
35 0.37
36 0.33
37 0.33
38 0.33
39 0.32
40 0.25
41 0.22
42 0.19
43 0.2
44 0.2
45 0.18
46 0.15
47 0.13
48 0.14
49 0.16
50 0.18
51 0.2
52 0.27
53 0.28
54 0.31
55 0.36
56 0.37
57 0.38
58 0.45
59 0.49
60 0.47
61 0.5
62 0.55
63 0.59
64 0.61
65 0.62
66 0.63
67 0.64
68 0.67
69 0.68
70 0.63
71 0.61
72 0.64
73 0.65
74 0.62
75 0.61
76 0.59
77 0.58
78 0.65
79 0.68
80 0.7
81 0.72
82 0.74
83 0.71
84 0.74
85 0.78
86 0.79
87 0.8
88 0.81
89 0.82
90 0.85
91 0.87
92 0.88
93 0.9
94 0.9
95 0.9
96 0.9
97 0.92
98 0.9
99 0.9
100 0.91
101 0.88
102 0.87
103 0.85
104 0.85
105 0.81
106 0.84
107 0.78
108 0.76
109 0.76
110 0.76
111 0.74
112 0.69
113 0.68
114 0.62
115 0.67
116 0.65
117 0.6
118 0.57
119 0.52
120 0.54
121 0.57
122 0.52
123 0.44
124 0.38
125 0.36
126 0.32
127 0.33
128 0.27
129 0.19
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.21
134 0.19
135 0.14
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.11
153 0.11
154 0.13
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.15
160 0.11
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.2
168 0.26
169 0.23
170 0.27
171 0.3
172 0.3
173 0.33
174 0.34
175 0.35
176 0.31
177 0.31
178 0.26
179 0.26
180 0.28
181 0.34
182 0.35
183 0.3
184 0.29
185 0.31
186 0.35
187 0.4
188 0.39
189 0.34
190 0.4
191 0.41
192 0.45
193 0.45
194 0.41
195 0.33
196 0.4
197 0.39
198 0.32
199 0.36
200 0.31
201 0.3
202 0.34
203 0.33
204 0.31
205 0.36
206 0.4
207 0.39
208 0.43
209 0.43
210 0.46
211 0.48
212 0.53
213 0.54
214 0.53
215 0.53
216 0.58
217 0.62
218 0.64
219 0.69
220 0.7
221 0.68
222 0.71
223 0.7
224 0.72
225 0.72
226 0.68
227 0.71
228 0.71
229 0.72
230 0.74
231 0.77
232 0.69
233 0.71
234 0.75
235 0.7
236 0.68
237 0.63
238 0.56
239 0.54
240 0.53
241 0.47
242 0.43
243 0.38
244 0.34
245 0.32
246 0.32
247 0.33
248 0.33
249 0.34
250 0.33
251 0.32
252 0.3
253 0.36
254 0.35
255 0.29
256 0.28
257 0.24
258 0.22
259 0.22
260 0.2
261 0.12
262 0.11
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.18
268 0.2
269 0.26
270 0.31
271 0.35
272 0.37
273 0.39
274 0.45
275 0.44
276 0.48
277 0.51
278 0.5
279 0.49
280 0.51
281 0.56
282 0.56
283 0.5
284 0.47
285 0.47
286 0.53
287 0.52
288 0.47
289 0.43
290 0.4
291 0.42
292 0.42
293 0.36
294 0.29
295 0.31
296 0.33
297 0.3
298 0.28
299 0.24
300 0.22
301 0.23
302 0.23
303 0.26
304 0.31
305 0.34
306 0.42
307 0.43
308 0.42
309 0.4
310 0.43