Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6CBN5

Protein Details
Accession H6CBN5    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
359-387LSVTRGKGFAKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-129AKVKKGKASKR
170-189KPSASAKKPSTPVKAGMKRK
364-379GKGFAKEKNKKKRGSY
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MPSKMKKDAAASAPKPSPQVLRLVEEFLSRNGLQSTHKAFTKELAKLRQKSGWPAPEETTSEVRLEAVVEEFLKKEVEQVTTTSSDESEASSASSSTSSSDDSSSDEESEEEVSEKEPAKVKKGKASKRSVSPSSSSSSSSSSSSSSDSDADDEDEATSTTRAKAPAAQKPSASAKKPSTPVKAGMKRKAESSSSESESSSSESEEEPPTKRVKVDESDSSQSSSSEDDSSDSDNDSEDKKLPASTKTKVTKAADDVKPLNKKTQQVAAADTPSESSGTVVGDNDGSGETSHAEGLMHSERSRLINNSNSKTPPGSLKKKHVGAKPTPLAQLSEQANGEQYLSNAYQSYDYAEKAYRDLSVTRGKGFAKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.46
4 0.43
5 0.34
6 0.41
7 0.36
8 0.38
9 0.37
10 0.38
11 0.36
12 0.34
13 0.33
14 0.25
15 0.28
16 0.22
17 0.22
18 0.2
19 0.21
20 0.21
21 0.27
22 0.33
23 0.32
24 0.35
25 0.35
26 0.35
27 0.4
28 0.44
29 0.44
30 0.45
31 0.5
32 0.57
33 0.61
34 0.65
35 0.65
36 0.6
37 0.62
38 0.64
39 0.61
40 0.56
41 0.54
42 0.52
43 0.5
44 0.49
45 0.44
46 0.38
47 0.31
48 0.28
49 0.24
50 0.21
51 0.17
52 0.15
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.13
63 0.15
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.21
68 0.22
69 0.23
70 0.19
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.13
75 0.1
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.13
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.11
102 0.12
103 0.14
104 0.19
105 0.21
106 0.28
107 0.34
108 0.37
109 0.43
110 0.52
111 0.58
112 0.62
113 0.7
114 0.68
115 0.7
116 0.75
117 0.71
118 0.65
119 0.58
120 0.51
121 0.46
122 0.4
123 0.33
124 0.27
125 0.25
126 0.22
127 0.2
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.16
152 0.21
153 0.28
154 0.33
155 0.34
156 0.32
157 0.34
158 0.42
159 0.42
160 0.38
161 0.37
162 0.35
163 0.39
164 0.44
165 0.47
166 0.44
167 0.41
168 0.45
169 0.49
170 0.54
171 0.55
172 0.58
173 0.58
174 0.53
175 0.53
176 0.5
177 0.41
178 0.37
179 0.35
180 0.31
181 0.28
182 0.28
183 0.26
184 0.23
185 0.22
186 0.2
187 0.15
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.1
192 0.12
193 0.14
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.18
198 0.19
199 0.18
200 0.2
201 0.22
202 0.25
203 0.27
204 0.3
205 0.32
206 0.32
207 0.32
208 0.28
209 0.24
210 0.2
211 0.16
212 0.12
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.15
230 0.21
231 0.24
232 0.26
233 0.34
234 0.38
235 0.4
236 0.45
237 0.46
238 0.43
239 0.44
240 0.5
241 0.43
242 0.43
243 0.44
244 0.44
245 0.48
246 0.45
247 0.47
248 0.42
249 0.44
250 0.42
251 0.45
252 0.42
253 0.37
254 0.4
255 0.36
256 0.32
257 0.29
258 0.25
259 0.19
260 0.15
261 0.14
262 0.09
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.1
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.16
288 0.18
289 0.22
290 0.2
291 0.22
292 0.29
293 0.37
294 0.41
295 0.45
296 0.44
297 0.43
298 0.42
299 0.39
300 0.41
301 0.42
302 0.48
303 0.5
304 0.58
305 0.65
306 0.71
307 0.76
308 0.73
309 0.72
310 0.69
311 0.72
312 0.68
313 0.63
314 0.59
315 0.52
316 0.48
317 0.4
318 0.39
319 0.31
320 0.29
321 0.25
322 0.23
323 0.23
324 0.21
325 0.21
326 0.14
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.17
336 0.15
337 0.15
338 0.17
339 0.2
340 0.2
341 0.2
342 0.21
343 0.18
344 0.19
345 0.2
346 0.23
347 0.29
348 0.3
349 0.3
350 0.34
351 0.33
352 0.38
353 0.43
354 0.47
355 0.49
356 0.57
357 0.66
358 0.73
359 0.81
360 0.82
361 0.87
362 0.88
363 0.88
364 0.88
365 0.87
366 0.87
367 0.87
368 0.82
369 0.72
370 0.62
371 0.57
372 0.48
373 0.43
374 0.34
375 0.26
376 0.23