Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BJW0

Protein Details
Accession H6BJW0    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-122TPTATPAKRGRGRPRKVQAAPHydrophilic
129-149ATDATPKKRGRPRKVTFESEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-6R
109-117KRGRGRPRK
134-142PKKRGRPRK
159-195PKNRGRPRKVAAKAESVTEKAPNAASVRKRGRPRKLK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR002740  EVE_domain  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR015947  PUA-like_sf  
IPR047197  THYN1-like_EVE  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF01878  EVE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd21133  EVE  
Amino Acid Sequences MPPKKRKAASAKGTKTTDPDTSSVVLSPAGRPKRNSVSEPRYDFINHHRPSTTGKRGRPSGASPIARAAIHKSPVAATQNVVGRKRKRAVSVSSVNGADADTPTATPAKRGRGRPRKVQAAPEPVAETATDATPKKRGRPRKVTFESEPVTVKSTDEPPKNRGRPRKVAAKAESVTEKAPNAASVRKRGRPRKLKAEAEPVAEEDSAHSDIEVDVPEQDGGVETKDSDIQYWLMKAEPNSRMEKGHDVKFSIDDLMAKTEPEAWDGVRNAAARNNMRAMRKGDLAFFYHSNCDVPGIAGVMRIVQEHSVDESAFDPNHPYYDPKSDRAKPKWDVVHVEFVRKFDKLVTLKELKSFSEPSGALKDMQMLRQSRLSVSSVKPAEWEFILQLAGEPLTLGQEAGKDGYESDVDGEGEETVADVDADLDTDAAKSVSGNNDSEVEDDEDGADEVELDQVGAGKVNGTALDGADEADEAEHLQQSVPVSQDAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.66
3 0.61
4 0.56
5 0.48
6 0.41
7 0.36
8 0.34
9 0.32
10 0.28
11 0.24
12 0.2
13 0.17
14 0.2
15 0.26
16 0.33
17 0.37
18 0.4
19 0.47
20 0.55
21 0.61
22 0.63
23 0.64
24 0.65
25 0.7
26 0.72
27 0.65
28 0.58
29 0.53
30 0.49
31 0.48
32 0.5
33 0.42
34 0.4
35 0.4
36 0.38
37 0.45
38 0.52
39 0.53
40 0.51
41 0.56
42 0.61
43 0.65
44 0.68
45 0.65
46 0.6
47 0.58
48 0.59
49 0.55
50 0.47
51 0.45
52 0.43
53 0.38
54 0.35
55 0.3
56 0.27
57 0.27
58 0.27
59 0.24
60 0.23
61 0.28
62 0.31
63 0.26
64 0.21
65 0.23
66 0.28
67 0.33
68 0.37
69 0.4
70 0.41
71 0.5
72 0.56
73 0.56
74 0.58
75 0.6
76 0.62
77 0.63
78 0.65
79 0.59
80 0.56
81 0.51
82 0.44
83 0.36
84 0.29
85 0.21
86 0.14
87 0.11
88 0.08
89 0.07
90 0.09
91 0.12
92 0.12
93 0.16
94 0.2
95 0.29
96 0.36
97 0.45
98 0.56
99 0.63
100 0.71
101 0.76
102 0.8
103 0.81
104 0.78
105 0.78
106 0.75
107 0.74
108 0.68
109 0.59
110 0.52
111 0.41
112 0.37
113 0.28
114 0.2
115 0.12
116 0.11
117 0.13
118 0.12
119 0.14
120 0.22
121 0.24
122 0.32
123 0.41
124 0.51
125 0.58
126 0.68
127 0.74
128 0.78
129 0.82
130 0.81
131 0.75
132 0.73
133 0.64
134 0.55
135 0.5
136 0.39
137 0.35
138 0.27
139 0.24
140 0.18
141 0.23
142 0.29
143 0.34
144 0.37
145 0.4
146 0.5
147 0.57
148 0.63
149 0.66
150 0.67
151 0.7
152 0.73
153 0.77
154 0.73
155 0.75
156 0.7
157 0.67
158 0.59
159 0.52
160 0.48
161 0.39
162 0.33
163 0.25
164 0.22
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.17
170 0.19
171 0.27
172 0.33
173 0.39
174 0.49
175 0.56
176 0.65
177 0.7
178 0.75
179 0.77
180 0.8
181 0.8
182 0.76
183 0.76
184 0.68
185 0.61
186 0.53
187 0.43
188 0.35
189 0.27
190 0.22
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.15
224 0.18
225 0.21
226 0.23
227 0.24
228 0.24
229 0.25
230 0.32
231 0.29
232 0.31
233 0.29
234 0.27
235 0.27
236 0.26
237 0.25
238 0.18
239 0.14
240 0.1
241 0.09
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.08
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.18
259 0.16
260 0.18
261 0.22
262 0.24
263 0.25
264 0.28
265 0.28
266 0.26
267 0.29
268 0.28
269 0.25
270 0.23
271 0.23
272 0.22
273 0.2
274 0.19
275 0.16
276 0.16
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.14
308 0.24
309 0.27
310 0.3
311 0.38
312 0.44
313 0.53
314 0.57
315 0.63
316 0.56
317 0.61
318 0.61
319 0.57
320 0.57
321 0.5
322 0.54
323 0.46
324 0.5
325 0.43
326 0.4
327 0.38
328 0.31
329 0.28
330 0.19
331 0.27
332 0.23
333 0.25
334 0.3
335 0.34
336 0.35
337 0.39
338 0.39
339 0.32
340 0.33
341 0.32
342 0.25
343 0.26
344 0.25
345 0.23
346 0.26
347 0.25
348 0.22
349 0.2
350 0.25
351 0.21
352 0.23
353 0.26
354 0.24
355 0.26
356 0.29
357 0.29
358 0.24
359 0.25
360 0.25
361 0.25
362 0.24
363 0.31
364 0.28
365 0.27
366 0.28
367 0.26
368 0.26
369 0.21
370 0.2
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.1
375 0.1
376 0.08
377 0.08
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.08
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.03
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.09
419 0.14
420 0.17
421 0.18
422 0.19
423 0.21
424 0.22
425 0.22
426 0.22
427 0.19
428 0.16
429 0.16
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.11
466 0.12
467 0.15
468 0.16