FuNGI

Q0TXM0

Protein Details

Accession

Q0TXM0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
244-268	KLDTASRRPKPPKLERLCRLHRQSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0031380 C:nuclear RNA-directed RNA polymerase complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0030422 P:siRNA processing
KEGG	pno:SNOG_15784 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MDIFITNVPPRVNRVELRMFLKDKLQAHDILAFDVFKKVGENWATVTVAHEKNGRSFIKRHGFRGPETLKFKSAPLGVKASNRKGQPEPLKVLSLQEKESTMKAKHIRQLPTARHDGSPSSIFPIHCLMTGVWGYDHLGKLIFDQKLKDTRAGSVIFGKYALMIYLKNAAHTEDDWHCRIDIPYAILEHTLPSVDNGTRGSITLTLKAPPKIYKILDTEDLHLYTGQLAPQVEVSLGQLMRDLKLDTASRRPKPPKLERLCRLHRQSDKNTALCMVYKLQFPDRHSVRQAWTFLKSFSVPELHCWKTMVPHVPTKTIEGDFNDLVNRVSKEELAYAVQFQMFALVFEGTITPRKMTEMLPSIVSMADIYGPLVTASAVRLLQSKVPTPGPHVGSSDFQITTLRDLLAQGIKMSQDTEHYVASNKRGQQDHVVLTHKATITPTGIFLRGPDADTSNRILRKYSQYTDYFMRVSFTDEDGVSVFHDPKASQHEVYERFRKILREGIHVAGRHFEFLGFSHASLRCHQVWFMASFIFKGLPICARDVIQNLGDFNGFTCSARCAARIGQAFSDTIFAVQIPSTATILETKEDITRNNRVFSDGCGTMSLELFQLLWRKLNPQQRRKRPTVLQIRCRGAKGVLSLDSSLVGEELHIRKSMTKFIAGSEWRDLEICSAAYRPLRVYLNHQFIKILEDLGVPPQNFIKVQNEARKQLELIVKHPLNAADFLRKHKTNIRTGYSHSADHAKIPRLFELMHYAGLSFQTDQFLCEIVEVAAMSSIRDLKYRARIPVESGHLLYGIMDETNTLKEGEVYVATEDETPSGRREKNILIGDRVVVTRAPALHPGDVQLVSAVNVPDGSPLRSLHNCIVFSQQGARDLPSQLSGGDLDGDLFHVIWDPLLIPKYTVPAADYAAAAPFNLGRPVEVNDIVDFFIGFMQNDKLGQISNMHKIRADKRENGTFDSDCILLAKLASDAVDFSKSGVPAKTSDIPRDIDIIRPDFMAPGHNFVINDLGSTELQDLEIEDIEDPDSLSILDHDMSRVRYYRSKKALGHLYRAIDEREFFDHMKSDFAAMQSSTPGLSLMQKLEQYIDRETHLVQWAHHTTFAEELREYYEFNMIDIMDTMRVHRRSPLTELEVFSGNILGKKERASTRFIRQANEDVQERFNRDVSGIVSDIVRGDGEGDAEALPRAIACFKVALQTEGWENQVLIKSWKYVAASVCLEQLWKFQGGSLRPL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.45
3	0.48
4	0.53
5	0.55
6	0.52
7	0.48
8	0.5
9	0.49
10	0.45
11	0.45
12	0.43
13	0.37
14	0.36
15	0.39
16	0.34
17	0.29
18	0.26
19	0.22
20	0.19
21	0.19
22	0.17
23	0.12
24	0.14
25	0.13
26	0.2
27	0.22
28	0.23
29	0.23
30	0.27
31	0.27
32	0.25
33	0.27
34	0.28
35	0.26
36	0.27
37	0.29
38	0.27
39	0.31
40	0.39
41	0.4
42	0.37
43	0.39
44	0.47
45	0.53
46	0.56
47	0.56
48	0.58
49	0.59
50	0.57
51	0.64
52	0.59
53	0.57
54	0.59
55	0.58
56	0.52
57	0.48
58	0.46
59	0.42
60	0.42
61	0.38
62	0.36
63	0.39
64	0.39
65	0.46
66	0.54
67	0.56
68	0.57
69	0.54
70	0.56
71	0.54
72	0.61
73	0.61
74	0.61
75	0.6
76	0.58
77	0.58
78	0.52
79	0.54
80	0.52
81	0.45
82	0.39
83	0.34
84	0.33
85	0.32
86	0.35
87	0.36
88	0.29
89	0.35
90	0.4
91	0.45
92	0.5
93	0.56
94	0.58
95	0.6
96	0.68
97	0.67
98	0.68
99	0.68
100	0.63
101	0.57
102	0.53
103	0.47
104	0.42
105	0.37
106	0.3
107	0.28
108	0.29
109	0.27
110	0.27
111	0.29
112	0.24
113	0.22
114	0.23
115	0.17
116	0.18
117	0.19
118	0.18
119	0.14
120	0.14
121	0.15
122	0.17
123	0.17
124	0.13
125	0.14
126	0.13
127	0.16
128	0.23
129	0.24
130	0.22
131	0.24
132	0.3
133	0.37
134	0.4
135	0.41
136	0.35
137	0.35
138	0.39
139	0.37
140	0.33
141	0.32
142	0.3
143	0.26
144	0.25
145	0.21
146	0.17
147	0.16
148	0.14
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.16
153	0.16
154	0.17
155	0.18
156	0.18
157	0.19
158	0.2
159	0.24
160	0.23
161	0.28
162	0.28
163	0.29
164	0.28
165	0.27
166	0.27
167	0.25
168	0.21
169	0.19
170	0.19
171	0.19
172	0.19
173	0.18
174	0.17
175	0.14
176	0.12
177	0.1
178	0.08
179	0.08
180	0.11
181	0.11
182	0.13
183	0.13
184	0.14
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.15
189	0.16
190	0.19
191	0.19
192	0.22
193	0.26
194	0.29
195	0.31
196	0.3
197	0.34
198	0.36
199	0.37
200	0.39
201	0.38
202	0.4
203	0.44
204	0.42
205	0.4
206	0.37
207	0.36
208	0.3
209	0.26
210	0.22
211	0.16
212	0.15
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.13
226	0.13
227	0.14
228	0.15
229	0.15
230	0.11
231	0.15
232	0.19
233	0.2
234	0.29
235	0.38
236	0.42
237	0.51
238	0.58
239	0.61
240	0.69
241	0.76
242	0.77
243	0.78
244	0.83
245	0.82
246	0.85
247	0.86
248	0.85
249	0.82
250	0.8
251	0.78
252	0.77
253	0.76
254	0.76
255	0.74
256	0.66
257	0.6
258	0.52
259	0.44
260	0.36
261	0.31
262	0.24
263	0.2
264	0.2
265	0.22
266	0.28
267	0.32
268	0.33
269	0.41
270	0.42
271	0.45
272	0.46
273	0.48
274	0.45
275	0.47
276	0.48
277	0.41
278	0.41
279	0.36
280	0.33
281	0.31
282	0.27
283	0.22
284	0.21
285	0.23
286	0.19
287	0.23
288	0.3
289	0.29
290	0.29
291	0.3
292	0.28
293	0.26
294	0.33
295	0.34
296	0.31
297	0.37
298	0.38
299	0.41
300	0.42
301	0.4
302	0.38
303	0.31
304	0.3
305	0.24
306	0.26
307	0.23
308	0.22
309	0.2
310	0.17
311	0.16
312	0.17
313	0.16
314	0.13
315	0.13
316	0.13
317	0.13
318	0.14
319	0.14
320	0.13
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.1
326	0.09
327	0.1
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.07
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.13
341	0.14
342	0.15
343	0.2
344	0.21
345	0.22
346	0.22
347	0.22
348	0.21
349	0.19
350	0.18
351	0.11
352	0.06
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.09
367	0.1
368	0.13
369	0.15
370	0.17
371	0.19
372	0.22
373	0.22
374	0.25
375	0.3
376	0.29
377	0.29
378	0.28
379	0.27
380	0.25
381	0.26
382	0.24
383	0.17
384	0.15
385	0.15
386	0.14
387	0.14
388	0.14
389	0.12
390	0.09
391	0.1
392	0.12
393	0.12
394	0.12
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.11
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.16
407	0.17
408	0.21
409	0.23
410	0.24
411	0.28
412	0.29
413	0.3
414	0.33
415	0.36
416	0.35
417	0.34
418	0.34
419	0.29
420	0.28
421	0.3
422	0.23
423	0.19
424	0.17
425	0.14
426	0.13
427	0.13
428	0.14
429	0.12
430	0.12
431	0.11
432	0.11
433	0.13
434	0.12
435	0.12
436	0.11
437	0.12
438	0.13
439	0.15
440	0.18
441	0.2
442	0.21
443	0.21
444	0.22
445	0.23
446	0.31
447	0.35
448	0.35
449	0.36
450	0.36
451	0.39
452	0.4
453	0.38
454	0.31
455	0.25
456	0.23
457	0.17
458	0.18
459	0.16
460	0.14
461	0.13
462	0.12
463	0.13
464	0.12
465	0.12
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.07
470	0.09
471	0.08
472	0.1
473	0.17
474	0.19
475	0.18
476	0.19
477	0.25
478	0.29
479	0.35
480	0.39
481	0.33
482	0.33
483	0.34
484	0.35
485	0.3
486	0.31
487	0.29
488	0.27
489	0.29
490	0.3
491	0.32
492	0.3
493	0.29
494	0.25
495	0.23
496	0.18
497	0.15
498	0.12
499	0.09
500	0.09
501	0.13
502	0.1
503	0.1
504	0.15
505	0.16
506	0.18
507	0.19
508	0.22
509	0.19
510	0.19
511	0.19
512	0.16
513	0.16
514	0.15
515	0.15
516	0.11
517	0.1
518	0.09
519	0.1
520	0.08
521	0.07
522	0.06
523	0.06
524	0.08
525	0.09
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.12
530	0.13
531	0.14
532	0.12
533	0.12
534	0.11
535	0.1
536	0.1
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.11
549	0.17
550	0.18
551	0.19
552	0.17
553	0.18
554	0.17
555	0.16
556	0.16
557	0.1
558	0.07
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.1
575	0.1
576	0.12
577	0.15
578	0.22
579	0.23
580	0.24
581	0.24
582	0.24
583	0.23
584	0.23
585	0.24
586	0.17
587	0.15
588	0.14
589	0.14
590	0.12
591	0.11
592	0.1
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.06
597	0.09
598	0.09
599	0.1
600	0.1
601	0.13
602	0.2
603	0.29
604	0.38
605	0.45
606	0.55
607	0.64
608	0.72
609	0.74
610	0.75
611	0.71
612	0.71
613	0.72
614	0.7
615	0.68
616	0.68
617	0.67
618	0.61
619	0.56
620	0.47
621	0.36
622	0.29
623	0.22
624	0.17
625	0.14
626	0.13
627	0.13
628	0.12
629	0.12
630	0.1
631	0.08
632	0.06
633	0.04
634	0.04
635	0.07
636	0.08
637	0.09
638	0.09
639	0.1
640	0.13
641	0.14
642	0.19
643	0.17
644	0.17
645	0.17
646	0.17
647	0.23
648	0.21
649	0.22
650	0.19
651	0.18
652	0.16
653	0.16
654	0.16
655	0.1
656	0.1
657	0.08
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.09
662	0.09
663	0.09
664	0.12
665	0.13
666	0.14
667	0.21
668	0.27
669	0.35
670	0.35
671	0.35
672	0.32
673	0.3
674	0.32
675	0.25
676	0.17
677	0.09
678	0.09
679	0.09
680	0.11
681	0.14
682	0.11
683	0.11
684	0.11
685	0.12
686	0.12
687	0.13
688	0.14
689	0.16
690	0.22
691	0.3
692	0.33
693	0.36
694	0.37
695	0.36
696	0.33
697	0.33
698	0.31
699	0.24
700	0.22
701	0.27
702	0.26
703	0.26
704	0.26
705	0.21
706	0.18
707	0.19
708	0.18
709	0.17
710	0.18
711	0.23
712	0.28
713	0.28
714	0.3
715	0.35
716	0.41
717	0.42
718	0.47
719	0.48
720	0.44
721	0.47
722	0.52
723	0.46
724	0.4
725	0.33
726	0.3
727	0.26
728	0.28
729	0.29
730	0.27
731	0.27
732	0.28
733	0.27
734	0.25
735	0.25
736	0.21
737	0.23
738	0.18
739	0.16
740	0.15
741	0.14
742	0.13
743	0.13
744	0.13
745	0.07
746	0.06
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.09
751	0.09
752	0.08
753	0.07
754	0.08
755	0.05
756	0.06
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.07
764	0.07
765	0.08
766	0.1
767	0.14
768	0.22
769	0.26
770	0.3
771	0.32
772	0.32
773	0.35
774	0.39
775	0.39
776	0.32
777	0.29
778	0.25
779	0.21
780	0.2
781	0.16
782	0.11
783	0.06
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.05
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.08
795	0.07
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.08
804	0.08
805	0.1
806	0.16
807	0.17
808	0.18
809	0.21
810	0.23
811	0.29
812	0.35
813	0.35
814	0.31
815	0.31
816	0.3
817	0.28
818	0.26
819	0.18
820	0.12
821	0.1
822	0.1
823	0.1
824	0.1
825	0.13
826	0.15
827	0.15
828	0.15
829	0.16
830	0.17
831	0.16
832	0.15
833	0.11
834	0.09
835	0.09
836	0.1
837	0.09
838	0.06
839	0.07
840	0.07
841	0.09
842	0.1
843	0.11
844	0.11
845	0.12
846	0.17
847	0.18
848	0.21
849	0.22
850	0.26
851	0.26
852	0.25
853	0.28
854	0.24
855	0.23
856	0.24
857	0.22
858	0.21
859	0.21
860	0.21
861	0.19
862	0.2
863	0.2
864	0.17
865	0.16
866	0.12
867	0.12
868	0.1
869	0.08
870	0.08
871	0.07
872	0.06
873	0.05
874	0.06
875	0.05
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.05
880	0.05
881	0.05
882	0.05
883	0.07
884	0.09
885	0.09
886	0.09
887	0.1
888	0.12
889	0.13
890	0.13
891	0.11
892	0.11
893	0.12
894	0.12
895	0.12
896	0.1
897	0.1
898	0.1
899	0.09
900	0.07
901	0.07
902	0.07
903	0.09
904	0.08
905	0.08
906	0.1
907	0.13
908	0.16
909	0.16
910	0.16
911	0.14
912	0.15
913	0.15
914	0.13
915	0.1
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.06
920	0.07
921	0.08
922	0.09
923	0.09
924	0.09
925	0.08
926	0.08
927	0.09
928	0.13
929	0.16
930	0.24
931	0.26
932	0.27
933	0.29
934	0.34
935	0.41
936	0.46
937	0.49
938	0.48
939	0.52
940	0.6
941	0.6
942	0.58
943	0.55
944	0.45
945	0.4
946	0.34
947	0.27
948	0.19
949	0.17
950	0.14
951	0.09
952	0.09
953	0.08
954	0.06
955	0.06
956	0.06
957	0.05
958	0.06
959	0.07
960	0.09
961	0.08
962	0.1
963	0.13
964	0.13
965	0.16
966	0.16
967	0.16
968	0.16
969	0.22
970	0.28
971	0.28
972	0.31
973	0.32
974	0.33
975	0.32
976	0.35
977	0.3
978	0.28
979	0.29
980	0.28
981	0.25
982	0.24
983	0.23
984	0.2
985	0.19
986	0.21
987	0.17
988	0.19
989	0.2
990	0.21
991	0.21
992	0.2
993	0.23
994	0.16
995	0.15
996	0.11
997	0.12
998	0.1
999	0.11
1000	0.11
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.08
1004	0.08
1005	0.07
1006	0.08
1007	0.07
1008	0.07
1009	0.07
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.07
1013	0.06
1014	0.06
1015	0.05
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.07
1020	0.07
1021	0.09
1022	0.12
1023	0.14
1024	0.17
1025	0.19
1026	0.22
1027	0.3
1028	0.36
1029	0.45
1030	0.5
1031	0.56
1032	0.57
1033	0.62
1034	0.69
1035	0.66
1036	0.67
1037	0.62
1038	0.57
1039	0.52
1040	0.5
1041	0.44
1042	0.35
1043	0.31
1044	0.26
1045	0.24
1046	0.24
1047	0.22
1048	0.21
1049	0.23
1050	0.22
1051	0.23
1052	0.21
1053	0.19
1054	0.18
1055	0.18
1056	0.18
1057	0.15
1058	0.15
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.11
1062	0.1
1063	0.09
1064	0.08
1065	0.11
1066	0.13
1067	0.14
1068	0.17
1069	0.18
1070	0.18
1071	0.21
1072	0.24
1073	0.24
1074	0.26
1075	0.25
1076	0.24
1077	0.25
1078	0.25
1079	0.26
1080	0.29
1081	0.27
1082	0.24
1083	0.3
1084	0.33
1085	0.33
1086	0.34
1087	0.31
1088	0.25
1089	0.29
1090	0.31
1091	0.26
1092	0.21
1093	0.21
1094	0.22
1095	0.22
1096	0.22
1097	0.17
1098	0.2
1099	0.17
1100	0.17
1101	0.18
1102	0.14
1103	0.14
1104	0.14
1105	0.14
1106	0.11
1107	0.11
1108	0.14
1109	0.21
1110	0.22
1111	0.23
1112	0.29
1113	0.33
1114	0.35
1115	0.4
1116	0.45
1117	0.43
1118	0.46
1119	0.46
1120	0.42
1121	0.39
1122	0.35
1123	0.3
1124	0.24
1125	0.19
1126	0.17
1127	0.18
1128	0.17
1129	0.17
1130	0.2
1131	0.27
1132	0.32
1133	0.34
1134	0.39
1135	0.43
1136	0.51
1137	0.59
1138	0.59
1139	0.55
1140	0.53
1141	0.57
1142	0.55
1143	0.54
1144	0.48
1145	0.41
1146	0.44
1147	0.45
1148	0.44
1149	0.39
1150	0.35
1151	0.3
1152	0.27
1153	0.27
1154	0.23
1155	0.23
1156	0.19
1157	0.17
1158	0.16
1159	0.15
1160	0.15
1161	0.13
1162	0.11
1163	0.07
1164	0.08
1165	0.07
1166	0.08
1167	0.08
1168	0.08
1169	0.08
1170	0.09
1171	0.09
1172	0.08
1173	0.07
1174	0.06
1175	0.08
1176	0.08
1177	0.09
1178	0.09
1179	0.11
1180	0.12
1181	0.18
1182	0.2
1183	0.2
1184	0.2
1185	0.21
1186	0.25
1187	0.24
1188	0.26
1189	0.2
1190	0.19
1191	0.21
1192	0.24
1193	0.23
1194	0.23
1195	0.23
1196	0.24
1197	0.24
1198	0.28
1199	0.26
1200	0.26
1201	0.27
1202	0.29
1203	0.3
1204	0.29
1205	0.29
1206	0.26
1207	0.25
1208	0.22
1209	0.23
1210	0.2
1211	0.19
1212	0.18
1213	0.19
1214	0.26

Q0TXM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer