Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BRM1

Protein Details
Accession H6BRM1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-412LMVRRERLIRRTRMRRAPEQQPSTHydrophilic
483-507QGVAARRAWRRERLARQQTHNYNEQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 6.5cyto_nucl 6.5, mito 6, nucl 5.5, extr 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16454  RING-H2_PA-TM-RING  
Amino Acid Sequences MSADDFGVLAIVLPNPQYDSARSPYIVNGTVGFRLQGSIRTLSPNNPENYDPIDGVLYVPELPASSPCDNATRALIPSNVTTRADVPEGKSHLIGFAPWTGRECVLSYLSVMRDDGVHGAMFYRPDDIHDSSRPPPVSDPRWSLQDGGQWKTANPFPVYAVPGMLGDLLLDELAKYSGNMSELPHGEELVQMYDPHDTIRLWTRVDIGSSSGIPSLWVFLIIVLAILLTVVLVTSIIMHVIQRKQRSRLQRRVANGEVDLEALGIKRLNVPQDVLDKMPQYIYTSKTEPAAQVNQSQGETSVDQGDNTTSASGATPRPGVREVHFSQPTCPICLDDFVHGETTVRELPCNHIFHPECIDPFLRDNSSLCPMCKKSALPAGYCPVQVTNLMVRRERLIRRTRMRRAPEQQPSTTSSGGSVSAPLAALNQRIRRLSMPLASRHRTDPYGSAGGGHIAGSEMHPMQDNGETPAQHDDEMPHEVRTQGVAARRAWRRERLARQQTHNYNEQANEARTLDVSRPLWRRVLGRVIPTLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.12
4 0.14
5 0.16
6 0.21
7 0.25
8 0.28
9 0.29
10 0.28
11 0.29
12 0.32
13 0.31
14 0.27
15 0.24
16 0.23
17 0.23
18 0.22
19 0.2
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.17
24 0.18
25 0.2
26 0.21
27 0.27
28 0.28
29 0.32
30 0.39
31 0.41
32 0.4
33 0.41
34 0.41
35 0.38
36 0.4
37 0.37
38 0.3
39 0.23
40 0.21
41 0.18
42 0.17
43 0.14
44 0.11
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.09
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.18
55 0.21
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.21
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.2
64 0.22
65 0.25
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.22
70 0.24
71 0.25
72 0.24
73 0.24
74 0.28
75 0.3
76 0.3
77 0.29
78 0.26
79 0.24
80 0.22
81 0.18
82 0.13
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.14
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.11
111 0.1
112 0.12
113 0.18
114 0.2
115 0.24
116 0.26
117 0.3
118 0.3
119 0.37
120 0.35
121 0.32
122 0.33
123 0.37
124 0.4
125 0.42
126 0.45
127 0.4
128 0.44
129 0.43
130 0.39
131 0.33
132 0.33
133 0.31
134 0.29
135 0.3
136 0.27
137 0.26
138 0.28
139 0.29
140 0.27
141 0.24
142 0.21
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.19
147 0.17
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.09
152 0.06
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.13
169 0.14
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.07
185 0.09
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.2
191 0.19
192 0.2
193 0.18
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.01
216 0.01
217 0.01
218 0.01
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.03
225 0.03
226 0.07
227 0.12
228 0.16
229 0.23
230 0.27
231 0.32
232 0.38
233 0.48
234 0.55
235 0.61
236 0.66
237 0.65
238 0.65
239 0.67
240 0.63
241 0.54
242 0.44
243 0.35
244 0.26
245 0.2
246 0.16
247 0.09
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.14
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.19
274 0.19
275 0.18
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.19
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.17
284 0.14
285 0.12
286 0.11
287 0.09
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.11
303 0.11
304 0.13
305 0.15
306 0.17
307 0.17
308 0.24
309 0.25
310 0.31
311 0.34
312 0.33
313 0.33
314 0.39
315 0.37
316 0.31
317 0.29
318 0.22
319 0.18
320 0.2
321 0.2
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.1
329 0.12
330 0.13
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.18
335 0.24
336 0.26
337 0.24
338 0.29
339 0.3
340 0.31
341 0.36
342 0.32
343 0.26
344 0.26
345 0.26
346 0.19
347 0.2
348 0.22
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.18
353 0.24
354 0.24
355 0.22
356 0.26
357 0.27
358 0.28
359 0.3
360 0.28
361 0.26
362 0.33
363 0.35
364 0.3
365 0.32
366 0.33
367 0.33
368 0.32
369 0.27
370 0.2
371 0.18
372 0.16
373 0.15
374 0.17
375 0.21
376 0.24
377 0.25
378 0.25
379 0.28
380 0.35
381 0.38
382 0.41
383 0.44
384 0.51
385 0.61
386 0.7
387 0.76
388 0.78
389 0.81
390 0.82
391 0.81
392 0.81
393 0.81
394 0.77
395 0.7
396 0.64
397 0.61
398 0.55
399 0.47
400 0.37
401 0.27
402 0.22
403 0.2
404 0.17
405 0.13
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.13
413 0.18
414 0.22
415 0.26
416 0.27
417 0.3
418 0.3
419 0.33
420 0.33
421 0.34
422 0.35
423 0.4
424 0.47
425 0.48
426 0.49
427 0.48
428 0.48
429 0.43
430 0.4
431 0.35
432 0.33
433 0.32
434 0.29
435 0.27
436 0.23
437 0.22
438 0.19
439 0.16
440 0.09
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.11
449 0.12
450 0.14
451 0.15
452 0.16
453 0.2
454 0.19
455 0.19
456 0.25
457 0.24
458 0.21
459 0.22
460 0.19
461 0.19
462 0.25
463 0.24
464 0.2
465 0.21
466 0.2
467 0.2
468 0.2
469 0.18
470 0.16
471 0.21
472 0.24
473 0.27
474 0.36
475 0.42
476 0.49
477 0.54
478 0.59
479 0.63
480 0.69
481 0.76
482 0.78
483 0.82
484 0.82
485 0.84
486 0.86
487 0.85
488 0.81
489 0.77
490 0.69
491 0.63
492 0.55
493 0.53
494 0.48
495 0.41
496 0.38
497 0.32
498 0.3
499 0.26
500 0.27
501 0.24
502 0.25
503 0.26
504 0.31
505 0.36
506 0.38
507 0.42
508 0.43
509 0.44
510 0.43
511 0.52
512 0.48
513 0.49