Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C280

Protein Details
Accession H6C280    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-58EPSSVTKSTPRQKPQAKVSKKPKQKSPTPESEEGHydrophilic
306-348QDAVNGKMPEKKKKKKDVQVTNEQASPEKKKKKRRHLVDENVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-48KPQAKVSKKPKQ
312-322KMPEKKKKKKD
331-340SPEKKKKKRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAKVKETARPSNLSEERVQDSSDEEPSSVTKSTPRQKPQAKVSKKPKQKSPTPESEEGSTDASSDSDTSDESEDESDSSPTSSQQKRTAPSIMESPKKKPKTAPTSAAVQIAPKAFKPPQGYEPVAVSASDYASEVGTLFDDLSSKQIWHISIPDSVSIESIRELDIKAATAGEPVLSKDGVNYNLKSMESNDEVVFLPHGKTMRYQQNTKRVEQSFVLQEMSDAPKSKKDASVIFTAADTGKPKPVRQQPGGLKMRYVPYGAPALPESPEIEDADIEMKDTLDLPAELEPTSSQSTTKKSKHSSQDAVNGKMPEKKKKKKDVQVTNEQASPEKKKKKRRHLVDENVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.45
4 0.41
5 0.39
6 0.28
7 0.27
8 0.26
9 0.26
10 0.22
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.2
15 0.18
16 0.16
17 0.19
18 0.27
19 0.37
20 0.46
21 0.53
22 0.6
23 0.68
24 0.76
25 0.81
26 0.83
27 0.82
28 0.83
29 0.86
30 0.86
31 0.88
32 0.88
33 0.87
34 0.86
35 0.86
36 0.86
37 0.84
38 0.85
39 0.83
40 0.8
41 0.72
42 0.65
43 0.58
44 0.49
45 0.41
46 0.3
47 0.22
48 0.17
49 0.14
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.2
69 0.24
70 0.28
71 0.35
72 0.41
73 0.43
74 0.47
75 0.49
76 0.42
77 0.39
78 0.43
79 0.42
80 0.44
81 0.44
82 0.48
83 0.54
84 0.56
85 0.57
86 0.55
87 0.59
88 0.61
89 0.65
90 0.64
91 0.57
92 0.58
93 0.57
94 0.52
95 0.42
96 0.32
97 0.27
98 0.23
99 0.21
100 0.15
101 0.18
102 0.17
103 0.22
104 0.27
105 0.28
106 0.31
107 0.37
108 0.38
109 0.34
110 0.34
111 0.3
112 0.25
113 0.21
114 0.16
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.08
168 0.11
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.15
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.17
191 0.26
192 0.3
193 0.37
194 0.42
195 0.52
196 0.55
197 0.56
198 0.58
199 0.5
200 0.47
201 0.41
202 0.38
203 0.31
204 0.28
205 0.26
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.18
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.23
216 0.24
217 0.24
218 0.27
219 0.28
220 0.31
221 0.28
222 0.26
223 0.23
224 0.21
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.11
229 0.17
230 0.19
231 0.21
232 0.29
233 0.38
234 0.45
235 0.46
236 0.55
237 0.55
238 0.64
239 0.7
240 0.61
241 0.53
242 0.47
243 0.46
244 0.38
245 0.32
246 0.21
247 0.17
248 0.21
249 0.2
250 0.18
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.12
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.18
283 0.25
284 0.34
285 0.4
286 0.45
287 0.5
288 0.58
289 0.67
290 0.72
291 0.73
292 0.7
293 0.74
294 0.72
295 0.69
296 0.65
297 0.57
298 0.5
299 0.5
300 0.49
301 0.5
302 0.55
303 0.61
304 0.67
305 0.76
306 0.84
307 0.87
308 0.92
309 0.93
310 0.91
311 0.92
312 0.9
313 0.83
314 0.74
315 0.65
316 0.59
317 0.54
318 0.54
319 0.53
320 0.55
321 0.6
322 0.68
323 0.78
324 0.85
325 0.9
326 0.91
327 0.92
328 0.93