Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QX39

Protein Details
Accession C4QX39    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-133AYPHKNPKLTSRKRKSKILGSKTHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-125KLTSRKRKSK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0140492  F:metal-dependent deubiquitinase activity  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0035871  P:protein K11-linked deubiquitination  
GO:0071108  P:protein K48-linked deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0435  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
CDD cd02663  Peptidase_C19G  
Amino Acid Sequences MFKKFLTGDKSKKSGISTKCRRDTLHSPSDIALTEDRATIRGTPTHQFQPPAEEDTRSEYADEFSNPNHPFGDGNDKIFGMENFGNTCYCNSILQCLYYTSDFKEKMLAYPHKNPKLTSRKRKSKILGSKTHSFIAYLNNQTQSAQNANAASQTSSSDNGSSSSKTKSSSRRTSIFGLKRESTVVDDQSSQIQLQESQHSGNSSNSTDVFHQENNGLLVKYPNFKNIKFIPDIVNQQNNITVVGAVSDISANSDQRKKQALVNGPIIHLDQSFHEEYGLRLSLFTVMKDLFECMAENTSSYGVVSPVKLIEILKKENELFRSSMHQDAHEFLNFVINSITETEEGSTFQGIFEGLLTSETKCLACETISSRDEKFLDLSIDLTKDSSITNCLKNFSQMEMLNGSNKFYCDTCHSLQEAARTVNLKKLPKVLALHLKRFKYEEALQRNVKLFHRIAYTKTLRVFNTTEDSVELDKLYELYAVIVHIGGGPYHGHYVSLIKTPFFGWLLFDDETVEAINEDYVLRFFGDGVGLATAYVLFYQELQEKSYINFSLYGDHPNEAVHGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.59
3 0.61
4 0.63
5 0.69
6 0.75
7 0.76
8 0.73
9 0.73
10 0.73
11 0.71
12 0.7
13 0.62
14 0.56
15 0.52
16 0.51
17 0.42
18 0.36
19 0.27
20 0.2
21 0.19
22 0.19
23 0.18
24 0.17
25 0.18
26 0.18
27 0.2
28 0.21
29 0.24
30 0.27
31 0.32
32 0.38
33 0.41
34 0.42
35 0.4
36 0.43
37 0.42
38 0.44
39 0.4
40 0.35
41 0.33
42 0.36
43 0.38
44 0.3
45 0.28
46 0.22
47 0.22
48 0.22
49 0.23
50 0.18
51 0.17
52 0.25
53 0.25
54 0.26
55 0.24
56 0.22
57 0.21
58 0.22
59 0.31
60 0.25
61 0.26
62 0.27
63 0.26
64 0.26
65 0.27
66 0.23
67 0.19
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.14
79 0.19
80 0.19
81 0.2
82 0.2
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.21
87 0.19
88 0.25
89 0.25
90 0.24
91 0.28
92 0.26
93 0.28
94 0.36
95 0.41
96 0.4
97 0.5
98 0.6
99 0.62
100 0.64
101 0.61
102 0.62
103 0.66
104 0.7
105 0.71
106 0.72
107 0.75
108 0.8
109 0.88
110 0.85
111 0.85
112 0.84
113 0.83
114 0.82
115 0.78
116 0.79
117 0.72
118 0.66
119 0.55
120 0.45
121 0.36
122 0.33
123 0.33
124 0.29
125 0.29
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.28
130 0.25
131 0.21
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.15
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.17
151 0.18
152 0.2
153 0.26
154 0.34
155 0.43
156 0.51
157 0.55
158 0.55
159 0.58
160 0.61
161 0.64
162 0.61
163 0.56
164 0.53
165 0.47
166 0.44
167 0.42
168 0.36
169 0.3
170 0.27
171 0.23
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.15
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.13
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.11
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.16
208 0.16
209 0.23
210 0.25
211 0.25
212 0.31
213 0.32
214 0.35
215 0.32
216 0.33
217 0.3
218 0.31
219 0.36
220 0.34
221 0.34
222 0.3
223 0.28
224 0.28
225 0.23
226 0.2
227 0.14
228 0.1
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.1
240 0.14
241 0.15
242 0.19
243 0.23
244 0.23
245 0.26
246 0.32
247 0.36
248 0.36
249 0.41
250 0.39
251 0.35
252 0.34
253 0.31
254 0.25
255 0.17
256 0.13
257 0.07
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.1
298 0.13
299 0.16
300 0.16
301 0.18
302 0.19
303 0.21
304 0.23
305 0.2
306 0.18
307 0.16
308 0.21
309 0.21
310 0.25
311 0.22
312 0.21
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.17
317 0.16
318 0.11
319 0.16
320 0.15
321 0.14
322 0.12
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.09
353 0.13
354 0.19
355 0.21
356 0.23
357 0.22
358 0.25
359 0.25
360 0.24
361 0.21
362 0.15
363 0.15
364 0.13
365 0.14
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.11
375 0.14
376 0.19
377 0.19
378 0.22
379 0.22
380 0.26
381 0.27
382 0.24
383 0.26
384 0.22
385 0.23
386 0.23
387 0.23
388 0.23
389 0.22
390 0.21
391 0.16
392 0.16
393 0.16
394 0.13
395 0.15
396 0.16
397 0.22
398 0.23
399 0.26
400 0.27
401 0.28
402 0.29
403 0.31
404 0.29
405 0.23
406 0.24
407 0.22
408 0.22
409 0.26
410 0.31
411 0.3
412 0.29
413 0.35
414 0.35
415 0.38
416 0.4
417 0.41
418 0.45
419 0.48
420 0.55
421 0.56
422 0.55
423 0.51
424 0.51
425 0.45
426 0.41
427 0.42
428 0.42
429 0.43
430 0.5
431 0.5
432 0.52
433 0.54
434 0.51
435 0.46
436 0.43
437 0.36
438 0.32
439 0.37
440 0.35
441 0.34
442 0.4
443 0.42
444 0.4
445 0.44
446 0.45
447 0.39
448 0.42
449 0.4
450 0.34
451 0.36
452 0.32
453 0.28
454 0.24
455 0.25
456 0.21
457 0.21
458 0.17
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.1
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.13
482 0.15
483 0.21
484 0.2
485 0.18
486 0.19
487 0.2
488 0.22
489 0.2
490 0.18
491 0.13
492 0.14
493 0.19
494 0.18
495 0.18
496 0.16
497 0.15
498 0.16
499 0.14
500 0.12
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.09
527 0.15
528 0.16
529 0.19
530 0.2
531 0.21
532 0.22
533 0.27
534 0.25
535 0.2
536 0.22
537 0.2
538 0.24
539 0.24
540 0.29
541 0.26
542 0.26
543 0.24
544 0.22