Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C5I8

Protein Details
Accession H6C5I8    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-67AKKVAAKEEKKPKKVPVKEPTPESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-58PAQSQKTKSKEVAKKVAAKEEKKPKKVP
449-486GFGGRGGRGGFGGRGGRGGFGDRGGRGGRGGGRGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKSKSKSGAAAKATKSDVLTKVKGAAVTKPAQSQKTKSKEVAKKVAAKEEKKPKKVPVKEPTPESSSEEEDDDTSSTSDESEKVETKGKRAVKPAAKAESSDESSEESDSDDSASEDEAPKVNGAAKKATAPAKAAAKESDSSDSEESESDSEDATMEDAKAASSEDDDSSEESDSDDEEETAPKANGVKPAADDEASSDDDDESDEDESSEDSSDSDEDDEAEAKPKSAKRKAEDDETPAAKKSKVADVDTSKGPNLFVGNLSWNVDENWLRSEFEEFGELSGVRLMTDRQTGRSKGFGYVEFVDAADAAKAYAAKQGAELDGRPLNVDFANARSNDNKPADNRRKSYGDQLGEPTDTLFLGNLSFDCTQEDVSEAFAPHGTVMGIRLPTDRETGAPKGFGYVTFGSVDEAKAALEAMQGGYIKNRPIRLDYSQPRPQNGDSPARGGFGGRGGRGGFGGRGGRGGFGDRGGRGGRGGGRGGRGGSTNRGGFGDFSGKKTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.51
3 0.45
4 0.42
5 0.42
6 0.41
7 0.41
8 0.37
9 0.39
10 0.38
11 0.39
12 0.35
13 0.33
14 0.33
15 0.35
16 0.37
17 0.4
18 0.45
19 0.48
20 0.53
21 0.55
22 0.59
23 0.62
24 0.66
25 0.66
26 0.7
27 0.72
28 0.76
29 0.78
30 0.76
31 0.76
32 0.73
33 0.77
34 0.75
35 0.71
36 0.71
37 0.72
38 0.75
39 0.74
40 0.76
41 0.76
42 0.78
43 0.83
44 0.84
45 0.83
46 0.83
47 0.82
48 0.82
49 0.77
50 0.7
51 0.63
52 0.57
53 0.5
54 0.42
55 0.36
56 0.32
57 0.27
58 0.24
59 0.22
60 0.18
61 0.15
62 0.12
63 0.11
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.11
69 0.14
70 0.17
71 0.19
72 0.26
73 0.27
74 0.3
75 0.37
76 0.42
77 0.43
78 0.48
79 0.56
80 0.55
81 0.62
82 0.66
83 0.65
84 0.58
85 0.54
86 0.51
87 0.47
88 0.43
89 0.35
90 0.28
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.18
95 0.13
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.16
111 0.16
112 0.17
113 0.19
114 0.19
115 0.2
116 0.26
117 0.29
118 0.26
119 0.26
120 0.28
121 0.32
122 0.33
123 0.32
124 0.28
125 0.26
126 0.26
127 0.26
128 0.25
129 0.2
130 0.22
131 0.2
132 0.2
133 0.18
134 0.17
135 0.16
136 0.12
137 0.12
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.1
174 0.12
175 0.16
176 0.16
177 0.17
178 0.16
179 0.19
180 0.19
181 0.17
182 0.15
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.13
215 0.15
216 0.24
217 0.3
218 0.36
219 0.37
220 0.46
221 0.49
222 0.52
223 0.52
224 0.48
225 0.47
226 0.43
227 0.39
228 0.32
229 0.3
230 0.23
231 0.22
232 0.19
233 0.19
234 0.2
235 0.21
236 0.25
237 0.27
238 0.3
239 0.29
240 0.28
241 0.23
242 0.2
243 0.18
244 0.13
245 0.11
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.13
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.21
281 0.22
282 0.24
283 0.27
284 0.26
285 0.24
286 0.26
287 0.22
288 0.22
289 0.21
290 0.21
291 0.17
292 0.16
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.06
297 0.04
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.09
319 0.1
320 0.14
321 0.14
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.26
326 0.28
327 0.29
328 0.29
329 0.4
330 0.49
331 0.54
332 0.55
333 0.54
334 0.56
335 0.55
336 0.59
337 0.56
338 0.48
339 0.43
340 0.43
341 0.4
342 0.35
343 0.33
344 0.24
345 0.16
346 0.13
347 0.11
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.09
362 0.1
363 0.12
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.05
372 0.06
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.16
381 0.15
382 0.19
383 0.23
384 0.23
385 0.22
386 0.21
387 0.21
388 0.21
389 0.19
390 0.2
391 0.16
392 0.16
393 0.16
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.15
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.06
406 0.05
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.11
411 0.14
412 0.18
413 0.21
414 0.25
415 0.25
416 0.3
417 0.35
418 0.38
419 0.46
420 0.49
421 0.54
422 0.6
423 0.61
424 0.6
425 0.6
426 0.56
427 0.53
428 0.52
429 0.52
430 0.45
431 0.45
432 0.43
433 0.39
434 0.36
435 0.29
436 0.24
437 0.21
438 0.23
439 0.19
440 0.2
441 0.19
442 0.2
443 0.2
444 0.2
445 0.14
446 0.15
447 0.17
448 0.15
449 0.17
450 0.17
451 0.17
452 0.17
453 0.19
454 0.16
455 0.17
456 0.2
457 0.18
458 0.21
459 0.22
460 0.21
461 0.19
462 0.22
463 0.23
464 0.22
465 0.26
466 0.25
467 0.27
468 0.29
469 0.29
470 0.26
471 0.26
472 0.26
473 0.29
474 0.32
475 0.3
476 0.3
477 0.29
478 0.29
479 0.26
480 0.26
481 0.3
482 0.26
483 0.28