Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BRN1

Protein Details
Accession H6BRN1    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-77LASGTKRKRDEPPKKDTQRNKRQKSQSKKQPKREPEPEPSESSHydrophilic
135-158EIIARHAAKKQKQKPAKSKSAEEEHydrophilic
743-775PNGVIRIKGEKKKLSNKDKKRLDDKRERVEGKMBasic
781-813GSEAAAKKERIDRKKGKSKNKSKGKVGKGKAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-68KRKRDEPPKKDTQRNKRQKSQSKKQPKRE
141-152AAKKQKQKPAKS
748-813RIKGEKKKLSNKDKKRLDDKRERVEGKMWRKGKGSEAAAKKERIDRKKGKSKNKSKGKVGKGKAKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17947  DEADc_DDX27  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MIAPSSADDFVLTISDDEELPFSDPESEEEQTLALASGTKRKRDEPPKKDTQRNKRQKSQSKKQPKREPEPEPSESSSEDEGEQGVQDGTIDPDFEFDIGGGAVLEDLEEFDGWGEGASNTTKGDGKKKTVDIDEIIARHAAKKQKQKPAKSKSAEEEDEEASSASGDESAADTDGEEDDDVDIPDFDDDELLAPDVFGANVGSEEGGEGQEDSEEEEQDNSEDEANEDEDASDSDSVASPMAHPDDLASDAGSETSESDAEEQAKRAAFFAPEDKTTNTNSKAASSFQQFSLSRPILKALAALSFTAPTPIQARAIPVALQGLDVVGSAVTGSGKTAAFLLPILERLLYRPRKVPTTRVAILMPTRELAVQCYNVATALARFTDITFAQVVGGFPLREQEAILKKRPDVVIATPGRFIDHMRNSASFVVENIEILVLDEADRMLETGFEDELNEILKTIPKGRQTMLFSATMTDSVDKLVRVGMNRPVRLSVDAKKSTVSGLVQEFVRLRPGRENLRLATLCVLCKNFFTERTIIFFRQKKEAHRVRIVFGLLGLKAGELHGSMSQEQRISAVNAFREGKTTHLLATDLASRGLDIKNVMTVVNYEAPQTHEIYLHRVGRTARAGRSGRACTIAAEPDRKVVRAAVKSARQQGAKVVSRVVDAQEVDAMNAQIEAMESEIEEILKEEKEEKQLSQVEQQLTRGENLVKHEAEIMARPKRTWFETEKEKQQAKVKGLMELNGPNGVIRIKGEKKKLSNKDKKRLDDKRERVEGKMWRKGKGSEAAAKKERIDRKKGKSKNKSKGKVGKGKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.09
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.14
11 0.14
12 0.17
13 0.21
14 0.21
15 0.19
16 0.19
17 0.19
18 0.16
19 0.16
20 0.12
21 0.07
22 0.09
23 0.11
24 0.2
25 0.25
26 0.31
27 0.35
28 0.4
29 0.51
30 0.59
31 0.69
32 0.69
33 0.74
34 0.79
35 0.85
36 0.9
37 0.9
38 0.9
39 0.9
40 0.92
41 0.92
42 0.91
43 0.92
44 0.93
45 0.93
46 0.93
47 0.93
48 0.93
49 0.94
50 0.94
51 0.94
52 0.94
53 0.94
54 0.93
55 0.9
56 0.89
57 0.87
58 0.81
59 0.76
60 0.69
61 0.61
62 0.52
63 0.46
64 0.37
65 0.3
66 0.25
67 0.19
68 0.16
69 0.14
70 0.13
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.06
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.03
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.05
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.14
110 0.17
111 0.26
112 0.3
113 0.36
114 0.43
115 0.47
116 0.51
117 0.5
118 0.51
119 0.44
120 0.43
121 0.4
122 0.33
123 0.3
124 0.26
125 0.23
126 0.21
127 0.24
128 0.28
129 0.32
130 0.43
131 0.51
132 0.6
133 0.7
134 0.78
135 0.84
136 0.85
137 0.88
138 0.84
139 0.82
140 0.79
141 0.78
142 0.69
143 0.62
144 0.55
145 0.46
146 0.4
147 0.33
148 0.25
149 0.16
150 0.14
151 0.1
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.08
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.12
257 0.13
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.2
262 0.21
263 0.22
264 0.24
265 0.28
266 0.26
267 0.26
268 0.25
269 0.25
270 0.24
271 0.24
272 0.25
273 0.24
274 0.23
275 0.21
276 0.27
277 0.25
278 0.26
279 0.32
280 0.29
281 0.26
282 0.24
283 0.25
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.12
305 0.1
306 0.1
307 0.08
308 0.08
309 0.06
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.02
316 0.02
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.17
336 0.2
337 0.22
338 0.26
339 0.28
340 0.36
341 0.38
342 0.43
343 0.4
344 0.44
345 0.44
346 0.4
347 0.38
348 0.32
349 0.31
350 0.26
351 0.2
352 0.13
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.1
388 0.17
389 0.21
390 0.25
391 0.26
392 0.26
393 0.3
394 0.3
395 0.26
396 0.21
397 0.19
398 0.24
399 0.24
400 0.25
401 0.21
402 0.21
403 0.2
404 0.18
405 0.18
406 0.16
407 0.17
408 0.19
409 0.2
410 0.2
411 0.21
412 0.22
413 0.21
414 0.14
415 0.11
416 0.1
417 0.08
418 0.08
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.07
445 0.07
446 0.11
447 0.15
448 0.17
449 0.2
450 0.21
451 0.26
452 0.28
453 0.3
454 0.29
455 0.26
456 0.22
457 0.21
458 0.21
459 0.15
460 0.12
461 0.1
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.09
469 0.1
470 0.12
471 0.2
472 0.25
473 0.26
474 0.26
475 0.26
476 0.25
477 0.27
478 0.29
479 0.27
480 0.3
481 0.31
482 0.31
483 0.3
484 0.29
485 0.27
486 0.25
487 0.18
488 0.13
489 0.12
490 0.13
491 0.13
492 0.14
493 0.14
494 0.13
495 0.19
496 0.17
497 0.17
498 0.21
499 0.26
500 0.32
501 0.36
502 0.39
503 0.33
504 0.4
505 0.38
506 0.33
507 0.33
508 0.27
509 0.23
510 0.22
511 0.22
512 0.16
513 0.16
514 0.19
515 0.17
516 0.17
517 0.2
518 0.2
519 0.2
520 0.25
521 0.28
522 0.27
523 0.32
524 0.35
525 0.34
526 0.4
527 0.43
528 0.44
529 0.51
530 0.57
531 0.57
532 0.61
533 0.6
534 0.53
535 0.53
536 0.48
537 0.37
538 0.29
539 0.23
540 0.14
541 0.13
542 0.11
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.04
548 0.05
549 0.06
550 0.08
551 0.09
552 0.11
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.15
560 0.16
561 0.15
562 0.19
563 0.21
564 0.2
565 0.22
566 0.2
567 0.2
568 0.2
569 0.2
570 0.16
571 0.15
572 0.16
573 0.13
574 0.14
575 0.15
576 0.13
577 0.12
578 0.11
579 0.1
580 0.12
581 0.12
582 0.12
583 0.09
584 0.09
585 0.1
586 0.11
587 0.11
588 0.08
589 0.09
590 0.11
591 0.13
592 0.13
593 0.12
594 0.13
595 0.15
596 0.17
597 0.18
598 0.16
599 0.16
600 0.16
601 0.21
602 0.26
603 0.28
604 0.26
605 0.28
606 0.28
607 0.3
608 0.37
609 0.37
610 0.33
611 0.37
612 0.39
613 0.4
614 0.46
615 0.44
616 0.38
617 0.36
618 0.34
619 0.27
620 0.28
621 0.3
622 0.27
623 0.28
624 0.27
625 0.3
626 0.31
627 0.3
628 0.28
629 0.26
630 0.3
631 0.3
632 0.35
633 0.36
634 0.41
635 0.47
636 0.54
637 0.55
638 0.49
639 0.46
640 0.46
641 0.48
642 0.46
643 0.41
644 0.36
645 0.31
646 0.31
647 0.32
648 0.27
649 0.21
650 0.16
651 0.15
652 0.16
653 0.15
654 0.15
655 0.15
656 0.13
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.05
661 0.06
662 0.05
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.05
667 0.06
668 0.06
669 0.05
670 0.06
671 0.08
672 0.08
673 0.09
674 0.11
675 0.15
676 0.22
677 0.24
678 0.24
679 0.3
680 0.35
681 0.37
682 0.41
683 0.44
684 0.41
685 0.4
686 0.42
687 0.37
688 0.33
689 0.32
690 0.28
691 0.24
692 0.22
693 0.26
694 0.31
695 0.27
696 0.26
697 0.27
698 0.25
699 0.24
700 0.27
701 0.29
702 0.3
703 0.32
704 0.32
705 0.34
706 0.38
707 0.41
708 0.42
709 0.4
710 0.42
711 0.51
712 0.59
713 0.64
714 0.69
715 0.69
716 0.68
717 0.7
718 0.69
719 0.63
720 0.63
721 0.55
722 0.52
723 0.5
724 0.46
725 0.42
726 0.37
727 0.34
728 0.27
729 0.26
730 0.18
731 0.18
732 0.16
733 0.13
734 0.12
735 0.19
736 0.27
737 0.35
738 0.44
739 0.51
740 0.6
741 0.7
742 0.79
743 0.82
744 0.84
745 0.87
746 0.89
747 0.91
748 0.91
749 0.91
750 0.91
751 0.9
752 0.91
753 0.9
754 0.89
755 0.89
756 0.82
757 0.75
758 0.72
759 0.72
760 0.7
761 0.7
762 0.64
763 0.58
764 0.6
765 0.6
766 0.59
767 0.58
768 0.55
769 0.55
770 0.59
771 0.63
772 0.65
773 0.65
774 0.62
775 0.62
776 0.65
777 0.64
778 0.67
779 0.68
780 0.73
781 0.81
782 0.86
783 0.88
784 0.9
785 0.92
786 0.92
787 0.93
788 0.92
789 0.92
790 0.92
791 0.92
792 0.91
793 0.9