Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BP38

Protein Details
Accession H6BP38    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-249NNEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDWHydrophilic
367-395LQRLKEQDSKEKRKARRKENERKRKEIIRBasic
723-754ALNARPIKKVREAKGRKKMRAAARLEKLRKKSBasic
774-796RMMARAAKKGRPKEKVKLVVARGHydrophilic
814-835IVDSRLKKDVRAEKRLKRKLKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14HGKGRLDK
20-20K
236-241KKKRKR
376-392KEKRKARRKENERKRKE
486-496AKLRAKRARKE
718-754REKLRALNARPIKKVREAKGRKKMRAAARLEKLRKKS
774-835RMMARAAKKGRPKEKVKLVVARGPNKGLSGRPRGVKGKYKIVDSRLKKDVRAEKRLKRKLKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHGKGRLDKWYRLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSRVLLDLCAAPGSWCQVAAETMPAQSLIVGVDLAPIKPIPHVITFQSDITTDKCRATIRTHFKHLKADTVLHDGAPNVGVAWVQDAFSQAELVLQSMKLATEFLKEGGTFVTKVFRSKDYNALLWVFKQLFTSVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGFKAPKRIDPKFLDPKHVFAEVQEPTPNNEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDWTQHKEIPVSEFIHTTDPIAILGTVNKLSFEQSPNGDLALAALDRLPETTEEIRMCCADLKVLGKKEFRTLLRWRLKVRDKFGMSAKAKKEQEAENKEEGEEVAEVESMDEELKIQEELQRLKEQDSKEKRKARRKENERKRKEIIRMQMHMTTPHDIGLEQEGPAGEGAMFTLRAAKKVQDPAKIDGAGMDEVDIEESEDSQAESEDEDSDDDGDRLERELDMLYESYQRRREEADAKLRAKRARKEKETDEWGGLSDEDKAGDATTDGESDVDDEFPARPLPKAEGLSTQAAMFFDQDIFQDLGIEDDNDNDSAIALEDESSDQAKSQSPPANGAGASQDKQSKTLKSALKKPTASTAQQQRQTKVYEESDSESESETVPKSSGTASRPEDPLLPNGQLDIDIITAEAMTLAQDLATRRTKPGELVDDSFNKFSFRDVDGLPEWFLEDEAQHSKPQRPITAAAAAAIREKLRALNARPIKKVREAKGRKKMRAAARLEKLRKKSALLLEDEGISEKDKAASISRMMARAAKKGRPKEKVKLVVARGPNKGLSGRPRGVKGKYKIVDSRLKKDVRAEKRLKRKLKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.74
4 0.73
5 0.7
6 0.68
7 0.69
8 0.73
9 0.75
10 0.72
11 0.73
12 0.69
13 0.72
14 0.65
15 0.63
16 0.58
17 0.54
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.57
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.47
28 0.42
29 0.47
30 0.44
31 0.46
32 0.42
33 0.42
34 0.36
35 0.3
36 0.28
37 0.22
38 0.19
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.17
44 0.15
45 0.12
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.16
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.15
70 0.14
71 0.16
72 0.19
73 0.2
74 0.25
75 0.27
76 0.27
77 0.25
78 0.23
79 0.21
80 0.22
81 0.25
82 0.21
83 0.2
84 0.22
85 0.24
86 0.27
87 0.32
88 0.4
89 0.45
90 0.51
91 0.6
92 0.65
93 0.66
94 0.72
95 0.66
96 0.63
97 0.56
98 0.53
99 0.46
100 0.46
101 0.43
102 0.34
103 0.33
104 0.25
105 0.22
106 0.18
107 0.14
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.12
141 0.12
142 0.18
143 0.17
144 0.21
145 0.23
146 0.27
147 0.31
148 0.34
149 0.42
150 0.39
151 0.4
152 0.39
153 0.39
154 0.35
155 0.29
156 0.31
157 0.23
158 0.2
159 0.19
160 0.17
161 0.15
162 0.17
163 0.19
164 0.15
165 0.17
166 0.19
167 0.22
168 0.26
169 0.26
170 0.26
171 0.3
172 0.34
173 0.36
174 0.37
175 0.39
176 0.36
177 0.35
178 0.35
179 0.28
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.11
184 0.1
185 0.12
186 0.16
187 0.2
188 0.29
189 0.35
190 0.42
191 0.52
192 0.55
193 0.61
194 0.61
195 0.67
196 0.68
197 0.64
198 0.65
199 0.56
200 0.56
201 0.51
202 0.47
203 0.37
204 0.27
205 0.32
206 0.23
207 0.24
208 0.23
209 0.21
210 0.22
211 0.26
212 0.26
213 0.2
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.29
218 0.31
219 0.34
220 0.44
221 0.53
222 0.6
223 0.69
224 0.78
225 0.78
226 0.84
227 0.86
228 0.85
229 0.86
230 0.83
231 0.8
232 0.75
233 0.66
234 0.59
235 0.51
236 0.44
237 0.35
238 0.3
239 0.23
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.2
250 0.17
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.12
265 0.13
266 0.15
267 0.15
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.14
272 0.12
273 0.09
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.1
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.14
296 0.18
297 0.23
298 0.27
299 0.28
300 0.29
301 0.33
302 0.37
303 0.34
304 0.35
305 0.37
306 0.43
307 0.49
308 0.52
309 0.51
310 0.55
311 0.63
312 0.63
313 0.62
314 0.6
315 0.53
316 0.52
317 0.53
318 0.54
319 0.47
320 0.48
321 0.46
322 0.45
323 0.44
324 0.42
325 0.42
326 0.39
327 0.46
328 0.45
329 0.48
330 0.42
331 0.42
332 0.4
333 0.36
334 0.29
335 0.2
336 0.13
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.08
352 0.11
353 0.14
354 0.16
355 0.2
356 0.2
357 0.23
358 0.27
359 0.26
360 0.32
361 0.41
362 0.47
363 0.52
364 0.61
365 0.67
366 0.73
367 0.8
368 0.81
369 0.81
370 0.84
371 0.86
372 0.89
373 0.91
374 0.88
375 0.86
376 0.81
377 0.77
378 0.74
379 0.69
380 0.67
381 0.64
382 0.59
383 0.54
384 0.52
385 0.45
386 0.39
387 0.34
388 0.26
389 0.19
390 0.17
391 0.14
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.16
414 0.24
415 0.29
416 0.3
417 0.33
418 0.35
419 0.37
420 0.36
421 0.32
422 0.25
423 0.22
424 0.15
425 0.12
426 0.09
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.12
462 0.13
463 0.17
464 0.23
465 0.23
466 0.23
467 0.26
468 0.29
469 0.3
470 0.37
471 0.42
472 0.44
473 0.47
474 0.5
475 0.52
476 0.53
477 0.54
478 0.54
479 0.55
480 0.57
481 0.61
482 0.64
483 0.65
484 0.68
485 0.68
486 0.62
487 0.52
488 0.42
489 0.36
490 0.29
491 0.24
492 0.16
493 0.1
494 0.08
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.07
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.07
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.1
518 0.12
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.19
523 0.22
524 0.23
525 0.22
526 0.19
527 0.16
528 0.14
529 0.13
530 0.1
531 0.08
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.06
544 0.07
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.06
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.08
562 0.11
563 0.12
564 0.18
565 0.23
566 0.23
567 0.27
568 0.28
569 0.28
570 0.25
571 0.24
572 0.22
573 0.19
574 0.19
575 0.18
576 0.22
577 0.2
578 0.24
579 0.27
580 0.26
581 0.26
582 0.33
583 0.37
584 0.39
585 0.48
586 0.53
587 0.58
588 0.57
589 0.55
590 0.55
591 0.54
592 0.51
593 0.5
594 0.52
595 0.51
596 0.57
597 0.6
598 0.54
599 0.53
600 0.53
601 0.47
602 0.42
603 0.38
604 0.33
605 0.31
606 0.32
607 0.29
608 0.27
609 0.25
610 0.2
611 0.17
612 0.15
613 0.15
614 0.12
615 0.12
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.12
620 0.16
621 0.16
622 0.23
623 0.26
624 0.3
625 0.32
626 0.32
627 0.34
628 0.3
629 0.32
630 0.28
631 0.25
632 0.2
633 0.19
634 0.18
635 0.15
636 0.13
637 0.1
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.06
651 0.07
652 0.13
653 0.18
654 0.2
655 0.22
656 0.25
657 0.26
658 0.28
659 0.33
660 0.35
661 0.34
662 0.36
663 0.39
664 0.4
665 0.42
666 0.39
667 0.33
668 0.27
669 0.22
670 0.21
671 0.2
672 0.17
673 0.18
674 0.17
675 0.23
676 0.23
677 0.25
678 0.23
679 0.19
680 0.18
681 0.14
682 0.14
683 0.09
684 0.08
685 0.1
686 0.14
687 0.16
688 0.19
689 0.22
690 0.28
691 0.33
692 0.39
693 0.39
694 0.38
695 0.4
696 0.41
697 0.42
698 0.36
699 0.32
700 0.28
701 0.24
702 0.22
703 0.2
704 0.16
705 0.12
706 0.13
707 0.13
708 0.18
709 0.25
710 0.27
711 0.36
712 0.45
713 0.51
714 0.57
715 0.62
716 0.61
717 0.63
718 0.69
719 0.67
720 0.69
721 0.73
722 0.77
723 0.82
724 0.87
725 0.84
726 0.84
727 0.84
728 0.82
729 0.81
730 0.79
731 0.78
732 0.77
733 0.81
734 0.81
735 0.81
736 0.78
737 0.76
738 0.71
739 0.64
740 0.62
741 0.6
742 0.57
743 0.54
744 0.51
745 0.44
746 0.41
747 0.38
748 0.32
749 0.24
750 0.19
751 0.15
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.16
757 0.19
758 0.19
759 0.26
760 0.28
761 0.29
762 0.29
763 0.33
764 0.32
765 0.38
766 0.43
767 0.43
768 0.5
769 0.58
770 0.67
771 0.71
772 0.77
773 0.78
774 0.82
775 0.85
776 0.84
777 0.82
778 0.78
779 0.77
780 0.77
781 0.74
782 0.67
783 0.61
784 0.53
785 0.47
786 0.44
787 0.42
788 0.42
789 0.44
790 0.46
791 0.49
792 0.55
793 0.59
794 0.64
795 0.67
796 0.65
797 0.67
798 0.64
799 0.67
800 0.67
801 0.68
802 0.7
803 0.67
804 0.68
805 0.67
806 0.66
807 0.61
808 0.64
809 0.67
810 0.66
811 0.7
812 0.72
813 0.73
814 0.81
815 0.89