Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C5M1

Protein Details
Accession H6C5M1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-105HFLRGGPAGRRRRRDQQVEGNNDKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-91R
Subcellular Location(s) plas 19, nucl 2, mito 2, cyto 2, cyto_nucl 2, cyto_mito 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011992  EF-hand-dom_pair  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR002048  EF_hand_dom  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR023408  MscS_beta-dom_sf  
IPR006685  MscS_channel  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0055085  P:transmembrane transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00924  MS_channel  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
PS50222  EF_HAND_2  
Amino Acid Sequences MSQRSYSHYRNFSREGFQPLRHQTSREMASNPNDVTIDIPLTKVGTSGSRTGARKPDGFTPAPAPQSSDTPEPMDEKQSHHFLRGGPAGRRRRRDQQVEGNNDKDEGGLNAVGRLYRKIYNFSVVTRYFIYVAPLAAAIAVPIVVGATVAEGARIGGVKIVWFFSWIEVVWISLWASKVLARFLPYLFQYFTGVVSTGTRKYALLLRALEIPLSLVGWSICSLTTFVPIMTLNPDQRARGETSLKDWESVVKNILFACVFSTLLLLCEKLFIQLLSISYHRKQFYDRIKESKRHVYLVTLLYDASRQLFPMYCREFAEEDYLINNVLDLAALTSKRNSLFNGHKRSGSATPMRLIQNVARIGDKVTSAFGNVAQEITGKQVFNPTASHSVVVQALEKKHSAEALARRLWMSFVLEGREALYLEDIIDVLGESHEEEAHEAFEILDVDCNGDISLEEMILRITEFGRERKAIANSMHDVDQAIHVLDNLLCSVVFIATIFIFVAWLNKNFTTTLATAGTALLSLSFVFSVTAQEVLGSCIFLFVKHPFDVGDRVDVGDNQYIVERMSLLYTVFRRVADQKRTQVPNNVLNTQWIDNVSRSKAMRERIKLYVSFDTTFEDLDLLKKEMTNFVRDKDNARDYQPDLDIEVTGLAEMDKMELTLEIRHKSNWANEAVRAARRSKFMCALVLALRKIPIYGPGGGAPAAGDPANPTYSVAISDEEAKKNKAAFEEEKDKSRLVPLLPHHKADTQAQNVQSPSTEAQGSSSGAETKEAAAVDHLIRRNVAVDPEETHDREREVAMSKQRSNELEEVRNILRRESTTGRRRAAGHTGLSLTDSAVTRMGSRTIPTVPDSSPPEQVDGSAPSRVDYFEDSTIRPTGSQQMQQQQGWPSVAPLNYYQASTSGPGPEEQEEDAGSSRSRYVPGNAFSQQAYASQQQHQQQQQVPRVPVPGMPEMKRTLQNNGGQSPPPPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.59
3 0.56
4 0.54
5 0.56
6 0.59
7 0.64
8 0.6
9 0.57
10 0.53
11 0.56
12 0.57
13 0.52
14 0.46
15 0.43
16 0.46
17 0.5
18 0.45
19 0.39
20 0.33
21 0.29
22 0.27
23 0.23
24 0.21
25 0.14
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.16
34 0.19
35 0.24
36 0.3
37 0.32
38 0.38
39 0.45
40 0.47
41 0.47
42 0.47
43 0.5
44 0.5
45 0.5
46 0.47
47 0.45
48 0.45
49 0.45
50 0.42
51 0.38
52 0.32
53 0.35
54 0.35
55 0.33
56 0.29
57 0.28
58 0.3
59 0.3
60 0.3
61 0.33
62 0.31
63 0.31
64 0.35
65 0.41
66 0.41
67 0.4
68 0.41
69 0.35
70 0.41
71 0.44
72 0.44
73 0.43
74 0.51
75 0.59
76 0.65
77 0.71
78 0.71
79 0.74
80 0.78
81 0.81
82 0.81
83 0.81
84 0.83
85 0.84
86 0.83
87 0.76
88 0.66
89 0.57
90 0.47
91 0.36
92 0.26
93 0.17
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.27
106 0.29
107 0.34
108 0.35
109 0.35
110 0.4
111 0.35
112 0.36
113 0.32
114 0.31
115 0.25
116 0.24
117 0.24
118 0.17
119 0.17
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.11
165 0.12
166 0.14
167 0.15
168 0.16
169 0.17
170 0.17
171 0.2
172 0.2
173 0.21
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.17
178 0.17
179 0.14
180 0.13
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.16
189 0.21
190 0.21
191 0.23
192 0.23
193 0.23
194 0.26
195 0.26
196 0.24
197 0.18
198 0.16
199 0.11
200 0.1
201 0.08
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.13
218 0.17
219 0.16
220 0.2
221 0.22
222 0.21
223 0.23
224 0.25
225 0.25
226 0.26
227 0.29
228 0.25
229 0.29
230 0.36
231 0.35
232 0.32
233 0.29
234 0.3
235 0.29
236 0.3
237 0.28
238 0.2
239 0.21
240 0.2
241 0.22
242 0.16
243 0.12
244 0.12
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.07
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.16
265 0.18
266 0.24
267 0.24
268 0.24
269 0.26
270 0.33
271 0.42
272 0.48
273 0.51
274 0.55
275 0.61
276 0.66
277 0.69
278 0.7
279 0.63
280 0.55
281 0.51
282 0.43
283 0.41
284 0.38
285 0.33
286 0.23
287 0.2
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.12
292 0.09
293 0.07
294 0.09
295 0.11
296 0.12
297 0.21
298 0.24
299 0.23
300 0.24
301 0.26
302 0.26
303 0.25
304 0.28
305 0.2
306 0.17
307 0.15
308 0.15
309 0.12
310 0.11
311 0.09
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.04
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.09
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.18
326 0.28
327 0.36
328 0.45
329 0.44
330 0.44
331 0.44
332 0.47
333 0.42
334 0.38
335 0.34
336 0.27
337 0.27
338 0.31
339 0.31
340 0.28
341 0.27
342 0.22
343 0.23
344 0.23
345 0.22
346 0.18
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.15
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.09
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.15
372 0.18
373 0.18
374 0.19
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.14
380 0.12
381 0.13
382 0.14
383 0.15
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.12
388 0.14
389 0.19
390 0.23
391 0.24
392 0.24
393 0.24
394 0.24
395 0.23
396 0.18
397 0.14
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.08
407 0.07
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.03
448 0.04
449 0.06
450 0.08
451 0.1
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.18
456 0.2
457 0.21
458 0.21
459 0.23
460 0.22
461 0.22
462 0.22
463 0.17
464 0.16
465 0.12
466 0.11
467 0.08
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.06
490 0.06
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.11
497 0.12
498 0.11
499 0.12
500 0.11
501 0.11
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.06
506 0.06
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.07
529 0.08
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.11
534 0.13
535 0.15
536 0.14
537 0.14
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.08
556 0.08
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.13
561 0.2
562 0.28
563 0.34
564 0.39
565 0.43
566 0.5
567 0.55
568 0.55
569 0.55
570 0.52
571 0.51
572 0.49
573 0.44
574 0.36
575 0.33
576 0.33
577 0.27
578 0.22
579 0.16
580 0.13
581 0.14
582 0.16
583 0.16
584 0.18
585 0.17
586 0.2
587 0.24
588 0.3
589 0.36
590 0.38
591 0.42
592 0.42
593 0.46
594 0.43
595 0.42
596 0.39
597 0.34
598 0.3
599 0.26
600 0.24
601 0.2
602 0.19
603 0.15
604 0.11
605 0.08
606 0.09
607 0.11
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.11
612 0.17
613 0.19
614 0.23
615 0.23
616 0.24
617 0.3
618 0.3
619 0.34
620 0.34
621 0.39
622 0.35
623 0.36
624 0.38
625 0.33
626 0.36
627 0.33
628 0.26
629 0.21
630 0.19
631 0.17
632 0.13
633 0.11
634 0.07
635 0.05
636 0.05
637 0.04
638 0.03
639 0.03
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.05
646 0.09
647 0.13
648 0.15
649 0.16
650 0.17
651 0.19
652 0.22
653 0.25
654 0.26
655 0.27
656 0.26
657 0.26
658 0.31
659 0.32
660 0.32
661 0.31
662 0.3
663 0.28
664 0.31
665 0.32
666 0.31
667 0.33
668 0.3
669 0.29
670 0.26
671 0.26
672 0.25
673 0.27
674 0.24
675 0.2
676 0.19
677 0.17
678 0.17
679 0.15
680 0.14
681 0.13
682 0.14
683 0.14
684 0.14
685 0.15
686 0.15
687 0.14
688 0.1
689 0.07
690 0.07
691 0.06
692 0.05
693 0.06
694 0.08
695 0.08
696 0.08
697 0.09
698 0.09
699 0.09
700 0.1
701 0.1
702 0.09
703 0.09
704 0.15
705 0.19
706 0.22
707 0.24
708 0.25
709 0.26
710 0.27
711 0.29
712 0.25
713 0.28
714 0.28
715 0.33
716 0.42
717 0.42
718 0.46
719 0.46
720 0.43
721 0.37
722 0.36
723 0.31
724 0.23
725 0.27
726 0.29
727 0.38
728 0.41
729 0.42
730 0.41
731 0.39
732 0.41
733 0.41
734 0.42
735 0.36
736 0.39
737 0.38
738 0.4
739 0.38
740 0.36
741 0.3
742 0.24
743 0.19
744 0.16
745 0.15
746 0.12
747 0.13
748 0.14
749 0.15
750 0.12
751 0.13
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.12
756 0.11
757 0.12
758 0.11
759 0.1
760 0.09
761 0.12
762 0.13
763 0.18
764 0.19
765 0.17
766 0.18
767 0.18
768 0.19
769 0.18
770 0.19
771 0.15
772 0.15
773 0.16
774 0.21
775 0.25
776 0.25
777 0.26
778 0.25
779 0.24
780 0.24
781 0.22
782 0.21
783 0.21
784 0.25
785 0.32
786 0.38
787 0.4
788 0.42
789 0.46
790 0.44
791 0.45
792 0.47
793 0.44
794 0.42
795 0.4
796 0.41
797 0.39
798 0.43
799 0.38
800 0.32
801 0.3
802 0.26
803 0.31
804 0.33
805 0.41
806 0.46
807 0.53
808 0.55
809 0.55
810 0.56
811 0.55
812 0.56
813 0.51
814 0.43
815 0.38
816 0.36
817 0.32
818 0.3
819 0.25
820 0.17
821 0.15
822 0.13
823 0.11
824 0.11
825 0.12
826 0.12
827 0.13
828 0.15
829 0.14
830 0.15
831 0.17
832 0.18
833 0.2
834 0.21
835 0.23
836 0.22
837 0.27
838 0.32
839 0.32
840 0.35
841 0.34
842 0.34
843 0.3
844 0.3
845 0.27
846 0.25
847 0.25
848 0.22
849 0.21
850 0.19
851 0.2
852 0.19
853 0.19
854 0.18
855 0.19
856 0.21
857 0.24
858 0.24
859 0.27
860 0.28
861 0.26
862 0.23
863 0.21
864 0.25
865 0.28
866 0.33
867 0.37
868 0.44
869 0.5
870 0.5
871 0.53
872 0.48
873 0.46
874 0.42
875 0.35
876 0.29
877 0.27
878 0.27
879 0.24
880 0.22
881 0.24
882 0.23
883 0.24
884 0.21
885 0.18
886 0.19
887 0.19
888 0.19
889 0.17
890 0.17
891 0.18
892 0.2
893 0.21
894 0.21
895 0.2
896 0.19
897 0.16
898 0.17
899 0.17
900 0.16
901 0.14
902 0.13
903 0.15
904 0.16
905 0.18
906 0.19
907 0.24
908 0.3
909 0.33
910 0.38
911 0.37
912 0.37
913 0.35
914 0.34
915 0.28
916 0.22
917 0.24
918 0.24
919 0.26
920 0.29
921 0.36
922 0.41
923 0.49
924 0.52
925 0.55
926 0.55
927 0.61
928 0.65
929 0.66
930 0.64
931 0.58
932 0.55
933 0.49
934 0.44
935 0.4
936 0.4
937 0.39
938 0.38
939 0.4
940 0.41
941 0.45
942 0.5
943 0.47
944 0.46
945 0.47
946 0.51
947 0.53
948 0.52
949 0.51
950 0.46
951 0.45