Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C1E6

Protein Details
Accession H6C1E6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-85ANGMARPTRRPQRPSTRNNTADNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 9.5, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAAVVAKPSGTATKMKKPPTPTVHTNGNGGKAAPSSSPASARKSLPGQTPTTASSTNNSTTANGMARPTRRPQRPSTRNNTADNATLDKRAAKRIPEPYGSSVVDSKCFGAPLTPQFIVPKESYILRKFKGCPPSLIVHLHSTHFRFDQQDGSFSYHSEMRVFIEHLAKGTIPHDMVEEFRKSDVKYYDGWLIVRVVDHKSISKDSLASETGGDDEKPFSIHNYNQYITPSPYVPYPAKEQSASRSPPLKQERRESLSSDARDGIHSDDTVDAAPKSSKPQPKIYHVALRPTIMSRHMDLVLDAMAPDPKSVNRKQSQANAANRPTGSAAPQTPISGVPQTPSSDKGPPLKKQKLRIDPKDLLEYEARIVNATAPPLYLNAVDSLEEAETLIDMLKDPLCNERPPSPKSRKRTVAELAAEDAHAKEQERFMLVMDERTAGGTGAANSGAVDGQAAAALFQPRFEKFNALDNIKREIAERKQREKDRQMQEDETRRGQQERLQEEERKRIMIQRAQEARALRAREMQAAMAAQQQQQGLAAQRSSQQVNGIPPNMQSQMMAAQQRGSPIIRQGTPLAASSPVVTSAAQGGHPMAVSGSQQGRGSPQRPGSAVQHGHPSAPMARAPSGQGPSRHGTPQMPQGTPRNATPILRQGTPAQQITQASPHGSTVAPTPQMVAAGMMQGMQGQSANGIQRPLNPQQVAEMQRRHALQQQAAQQAAMQQHMANGTPQMSQAQLSHMQAQQQAQADRQAAIQRQQAQQQQQAMQQGTPQSQHMSPNPQKAYNQSVAEHVKAQIQNLQQSQHSSPAPTHITPQQQASQLAQAQQQQRMLAAQAQQAQLMGGGTPQQQQRLQQNPAVQQFYQSTLAAYTQRFLGQAAAKYGGNTNMLQPNEIQQVQTQAKTAAMATLRRRQVELNNMSIQQAQMRQQQIAQQQAQQQQQQQQQQQQQQQGGGMPNGMMGMNSNMAAALQQQQAHQMQQMHMQQAQQVMAAQQQQQQQQQQQQGMQYQQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.53
3 0.57
4 0.62
5 0.7
6 0.71
7 0.73
8 0.7
9 0.69
10 0.71
11 0.67
12 0.67
13 0.6
14 0.54
15 0.47
16 0.4
17 0.35
18 0.26
19 0.26
20 0.2
21 0.2
22 0.19
23 0.2
24 0.27
25 0.29
26 0.34
27 0.38
28 0.39
29 0.42
30 0.44
31 0.48
32 0.49
33 0.51
34 0.48
35 0.46
36 0.47
37 0.43
38 0.42
39 0.37
40 0.3
41 0.28
42 0.29
43 0.29
44 0.28
45 0.26
46 0.23
47 0.23
48 0.26
49 0.24
50 0.21
51 0.22
52 0.26
53 0.29
54 0.34
55 0.42
56 0.49
57 0.55
58 0.61
59 0.68
60 0.73
61 0.79
62 0.84
63 0.85
64 0.85
65 0.83
66 0.81
67 0.76
68 0.67
69 0.61
70 0.53
71 0.49
72 0.4
73 0.35
74 0.31
75 0.33
76 0.33
77 0.37
78 0.38
79 0.38
80 0.45
81 0.52
82 0.58
83 0.57
84 0.59
85 0.55
86 0.56
87 0.51
88 0.45
89 0.41
90 0.36
91 0.32
92 0.28
93 0.26
94 0.21
95 0.2
96 0.18
97 0.15
98 0.19
99 0.22
100 0.28
101 0.26
102 0.26
103 0.28
104 0.3
105 0.32
106 0.27
107 0.24
108 0.2
109 0.24
110 0.3
111 0.35
112 0.4
113 0.38
114 0.44
115 0.46
116 0.51
117 0.57
118 0.53
119 0.5
120 0.49
121 0.51
122 0.49
123 0.49
124 0.44
125 0.39
126 0.38
127 0.36
128 0.36
129 0.33
130 0.31
131 0.28
132 0.28
133 0.26
134 0.26
135 0.32
136 0.28
137 0.3
138 0.29
139 0.33
140 0.3
141 0.28
142 0.28
143 0.23
144 0.23
145 0.2
146 0.18
147 0.15
148 0.17
149 0.18
150 0.18
151 0.2
152 0.2
153 0.2
154 0.2
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.15
164 0.18
165 0.2
166 0.18
167 0.19
168 0.22
169 0.21
170 0.27
171 0.27
172 0.25
173 0.25
174 0.27
175 0.3
176 0.29
177 0.29
178 0.23
179 0.21
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.19
187 0.22
188 0.24
189 0.24
190 0.24
191 0.22
192 0.21
193 0.23
194 0.21
195 0.18
196 0.16
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.16
208 0.19
209 0.25
210 0.3
211 0.3
212 0.31
213 0.33
214 0.33
215 0.31
216 0.29
217 0.23
218 0.19
219 0.19
220 0.23
221 0.22
222 0.21
223 0.25
224 0.28
225 0.29
226 0.3
227 0.31
228 0.32
229 0.39
230 0.39
231 0.38
232 0.4
233 0.39
234 0.47
235 0.56
236 0.58
237 0.56
238 0.62
239 0.66
240 0.66
241 0.67
242 0.61
243 0.58
244 0.57
245 0.52
246 0.45
247 0.38
248 0.32
249 0.3
250 0.28
251 0.23
252 0.16
253 0.15
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.15
264 0.23
265 0.3
266 0.33
267 0.43
268 0.48
269 0.54
270 0.6
271 0.6
272 0.62
273 0.57
274 0.59
275 0.51
276 0.46
277 0.4
278 0.34
279 0.31
280 0.24
281 0.24
282 0.18
283 0.19
284 0.19
285 0.18
286 0.16
287 0.15
288 0.12
289 0.1
290 0.09
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.1
297 0.17
298 0.21
299 0.3
300 0.33
301 0.38
302 0.43
303 0.5
304 0.57
305 0.59
306 0.62
307 0.61
308 0.58
309 0.57
310 0.51
311 0.44
312 0.36
313 0.28
314 0.23
315 0.18
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.13
324 0.12
325 0.11
326 0.13
327 0.14
328 0.15
329 0.17
330 0.19
331 0.2
332 0.23
333 0.31
334 0.35
335 0.41
336 0.5
337 0.57
338 0.6
339 0.66
340 0.73
341 0.75
342 0.79
343 0.79
344 0.78
345 0.73
346 0.7
347 0.67
348 0.58
349 0.49
350 0.4
351 0.33
352 0.25
353 0.21
354 0.18
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.12
386 0.15
387 0.16
388 0.19
389 0.26
390 0.31
391 0.35
392 0.44
393 0.49
394 0.55
395 0.61
396 0.68
397 0.69
398 0.65
399 0.69
400 0.64
401 0.61
402 0.55
403 0.48
404 0.4
405 0.31
406 0.28
407 0.21
408 0.16
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.05
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.09
448 0.09
449 0.11
450 0.12
451 0.14
452 0.14
453 0.22
454 0.25
455 0.27
456 0.28
457 0.28
458 0.32
459 0.29
460 0.28
461 0.21
462 0.22
463 0.27
464 0.35
465 0.4
466 0.44
467 0.52
468 0.58
469 0.66
470 0.68
471 0.71
472 0.69
473 0.69
474 0.65
475 0.61
476 0.61
477 0.6
478 0.55
479 0.48
480 0.41
481 0.36
482 0.33
483 0.3
484 0.27
485 0.27
486 0.27
487 0.3
488 0.31
489 0.36
490 0.37
491 0.44
492 0.41
493 0.34
494 0.31
495 0.31
496 0.33
497 0.31
498 0.31
499 0.32
500 0.35
501 0.35
502 0.37
503 0.33
504 0.3
505 0.31
506 0.29
507 0.21
508 0.22
509 0.21
510 0.2
511 0.2
512 0.17
513 0.14
514 0.13
515 0.13
516 0.1
517 0.11
518 0.09
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.11
529 0.14
530 0.14
531 0.13
532 0.13
533 0.14
534 0.18
535 0.19
536 0.17
537 0.15
538 0.16
539 0.18
540 0.17
541 0.15
542 0.11
543 0.1
544 0.11
545 0.14
546 0.14
547 0.12
548 0.12
549 0.13
550 0.13
551 0.14
552 0.12
553 0.1
554 0.12
555 0.16
556 0.15
557 0.16
558 0.16
559 0.15
560 0.16
561 0.15
562 0.13
563 0.1
564 0.09
565 0.08
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.04
580 0.04
581 0.05
582 0.07
583 0.08
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.15
588 0.19
589 0.2
590 0.22
591 0.25
592 0.25
593 0.26
594 0.29
595 0.28
596 0.31
597 0.31
598 0.27
599 0.3
600 0.28
601 0.28
602 0.25
603 0.23
604 0.17
605 0.17
606 0.17
607 0.12
608 0.13
609 0.13
610 0.15
611 0.17
612 0.18
613 0.21
614 0.21
615 0.24
616 0.25
617 0.27
618 0.27
619 0.25
620 0.24
621 0.23
622 0.31
623 0.32
624 0.29
625 0.3
626 0.34
627 0.37
628 0.36
629 0.34
630 0.3
631 0.26
632 0.27
633 0.27
634 0.29
635 0.28
636 0.27
637 0.28
638 0.25
639 0.29
640 0.32
641 0.3
642 0.23
643 0.23
644 0.23
645 0.23
646 0.23
647 0.19
648 0.15
649 0.15
650 0.14
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.13
656 0.13
657 0.12
658 0.13
659 0.12
660 0.12
661 0.11
662 0.09
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.06
675 0.07
676 0.08
677 0.1
678 0.1
679 0.14
680 0.2
681 0.24
682 0.29
683 0.28
684 0.27
685 0.28
686 0.35
687 0.35
688 0.36
689 0.35
690 0.3
691 0.34
692 0.34
693 0.33
694 0.33
695 0.33
696 0.3
697 0.32
698 0.37
699 0.37
700 0.37
701 0.35
702 0.29
703 0.28
704 0.26
705 0.21
706 0.14
707 0.1
708 0.11
709 0.12
710 0.12
711 0.09
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.1
716 0.1
717 0.09
718 0.1
719 0.1
720 0.13
721 0.15
722 0.16
723 0.2
724 0.2
725 0.22
726 0.24
727 0.24
728 0.25
729 0.26
730 0.25
731 0.22
732 0.25
733 0.23
734 0.21
735 0.23
736 0.23
737 0.21
738 0.25
739 0.29
740 0.31
741 0.33
742 0.39
743 0.43
744 0.43
745 0.45
746 0.46
747 0.44
748 0.41
749 0.43
750 0.38
751 0.32
752 0.3
753 0.28
754 0.25
755 0.24
756 0.22
757 0.19
758 0.2
759 0.25
760 0.26
761 0.33
762 0.37
763 0.45
764 0.47
765 0.47
766 0.47
767 0.46
768 0.5
769 0.45
770 0.42
771 0.34
772 0.37
773 0.37
774 0.37
775 0.34
776 0.27
777 0.28
778 0.26
779 0.27
780 0.26
781 0.26
782 0.3
783 0.31
784 0.32
785 0.27
786 0.31
787 0.31
788 0.31
789 0.29
790 0.24
791 0.23
792 0.27
793 0.3
794 0.26
795 0.29
796 0.29
797 0.34
798 0.35
799 0.38
800 0.37
801 0.36
802 0.37
803 0.35
804 0.34
805 0.3
806 0.3
807 0.3
808 0.31
809 0.32
810 0.34
811 0.35
812 0.3
813 0.28
814 0.26
815 0.24
816 0.21
817 0.2
818 0.21
819 0.24
820 0.24
821 0.23
822 0.22
823 0.21
824 0.17
825 0.14
826 0.1
827 0.05
828 0.08
829 0.09
830 0.14
831 0.16
832 0.21
833 0.22
834 0.28
835 0.37
836 0.43
837 0.46
838 0.45
839 0.49
840 0.52
841 0.56
842 0.54
843 0.45
844 0.4
845 0.37
846 0.37
847 0.33
848 0.26
849 0.2
850 0.17
851 0.2
852 0.2
853 0.19
854 0.16
855 0.15
856 0.16
857 0.16
858 0.15
859 0.18
860 0.19
861 0.21
862 0.22
863 0.23
864 0.23
865 0.23
866 0.25
867 0.22
868 0.2
869 0.18
870 0.21
871 0.24
872 0.25
873 0.25
874 0.23
875 0.25
876 0.29
877 0.29
878 0.24
879 0.2
880 0.28
881 0.3
882 0.31
883 0.27
884 0.22
885 0.22
886 0.22
887 0.21
888 0.17
889 0.17
890 0.22
891 0.27
892 0.35
893 0.39
894 0.4
895 0.42
896 0.42
897 0.46
898 0.5
899 0.49
900 0.47
901 0.46
902 0.45
903 0.45
904 0.42
905 0.35
906 0.28
907 0.27
908 0.27
909 0.3
910 0.32
911 0.31
912 0.32
913 0.38
914 0.4
915 0.45
916 0.42
917 0.4
918 0.45
919 0.51
920 0.55
921 0.54
922 0.54
923 0.53
924 0.59
925 0.63
926 0.63
927 0.64
928 0.67
929 0.71
930 0.72
931 0.71
932 0.67
933 0.59
934 0.53
935 0.49
936 0.43
937 0.35
938 0.28
939 0.21
940 0.17
941 0.16
942 0.14
943 0.1
944 0.07
945 0.09
946 0.09
947 0.09
948 0.09
949 0.08
950 0.08
951 0.08
952 0.09
953 0.13
954 0.15
955 0.17
956 0.17
957 0.24
958 0.26
959 0.28
960 0.31
961 0.29
962 0.27
963 0.34
964 0.39
965 0.36
966 0.36
967 0.35
968 0.33
969 0.33
970 0.31
971 0.24
972 0.2
973 0.17
974 0.19
975 0.22
976 0.23
977 0.25
978 0.31
979 0.36
980 0.42
981 0.49
982 0.53
983 0.56
984 0.6
985 0.6
986 0.58
987 0.57
988 0.56