Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C0M7

Protein Details
Accession H6C0M7    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-54HNLDSLNTPKKRKHRADEKESSEKKKKKKQRTEGPAPTTEEBasic
63-92EGQTPTGGDKKKKKKSKDKQKEKVPTSPVQBasic
296-324TWNGPSREEIRKNKKKGRKGRLRDEDGASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-44PKKRKHRADEKESSEKKKKKKQR
71-85DKKKKKKSKDKQKEK
305-317IRKNKKKGRKGRL
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 9.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSAQVDGRHGSPSHNLDSLNTPKKRKHRADEKESSEKKKKKKQRTEGPAPTTEEPIEVAAQAEGQTPTGGDKKKKKKSKDKQKEKVPTSPVQEPAEPEDVELPDAPSPEPEAEEEDSTTQVPQATASTTMDGDDGAAVEPEFMADLLNSTEPSSFNSTRLSLYLSIPAIALEASSSAILATHLAPLLLTYFPPAQGIVLGFSDPVLSAKPDTAINLPLLPPSTGDVHPQAEVLAKTADEFGVCWVWLTVTLLVFRPERGDELYGWTNVMSEGFVGLVSYNYFQTAVAKSRIPQDWTWNGPSREEIRKNKKKGRKGRLRDEDGASSQTPENENAAVEEGDQDATVSQVQLADVGSFVDAKGSKIPPTQKFRVVDTEVVPSHDRHKWSLQIEGTLLDDEAERRIVEEERAKFEMAQHRSQSQTPGDRTGDPSVLMSGALARSREGSVASRLSGPVVGQRHRMTY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.31
4 0.38
5 0.45
6 0.48
7 0.49
8 0.51
9 0.57
10 0.67
11 0.76
12 0.78
13 0.79
14 0.8
15 0.85
16 0.89
17 0.92
18 0.9
19 0.9
20 0.88
21 0.86
22 0.86
23 0.83
24 0.83
25 0.83
26 0.85
27 0.86
28 0.89
29 0.91
30 0.91
31 0.94
32 0.95
33 0.94
34 0.91
35 0.85
36 0.8
37 0.7
38 0.62
39 0.52
40 0.41
41 0.31
42 0.25
43 0.19
44 0.14
45 0.12
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.12
55 0.18
56 0.23
57 0.3
58 0.4
59 0.51
60 0.61
61 0.71
62 0.79
63 0.83
64 0.89
65 0.92
66 0.93
67 0.94
68 0.94
69 0.95
70 0.95
71 0.9
72 0.88
73 0.83
74 0.78
75 0.73
76 0.69
77 0.64
78 0.56
79 0.51
80 0.44
81 0.42
82 0.39
83 0.33
84 0.27
85 0.24
86 0.21
87 0.21
88 0.19
89 0.15
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.1
94 0.12
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.1
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.2
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.1
248 0.15
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.05
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.08
271 0.1
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.22
277 0.25
278 0.26
279 0.25
280 0.29
281 0.33
282 0.36
283 0.4
284 0.41
285 0.39
286 0.36
287 0.38
288 0.36
289 0.4
290 0.45
291 0.49
292 0.54
293 0.63
294 0.72
295 0.78
296 0.82
297 0.83
298 0.86
299 0.87
300 0.87
301 0.87
302 0.89
303 0.89
304 0.88
305 0.83
306 0.76
307 0.68
308 0.59
309 0.52
310 0.41
311 0.33
312 0.25
313 0.22
314 0.2
315 0.17
316 0.17
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.13
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.14
347 0.16
348 0.18
349 0.24
350 0.33
351 0.38
352 0.47
353 0.51
354 0.53
355 0.54
356 0.55
357 0.57
358 0.52
359 0.47
360 0.41
361 0.42
362 0.35
363 0.36
364 0.34
365 0.27
366 0.29
367 0.3
368 0.31
369 0.29
370 0.33
371 0.37
372 0.37
373 0.43
374 0.4
375 0.37
376 0.35
377 0.32
378 0.28
379 0.21
380 0.19
381 0.12
382 0.11
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.13
390 0.18
391 0.25
392 0.28
393 0.32
394 0.35
395 0.35
396 0.33
397 0.39
398 0.42
399 0.4
400 0.44
401 0.42
402 0.44
403 0.46
404 0.48
405 0.47
406 0.45
407 0.48
408 0.44
409 0.47
410 0.46
411 0.45
412 0.48
413 0.46
414 0.4
415 0.31
416 0.29
417 0.23
418 0.2
419 0.17
420 0.13
421 0.11
422 0.12
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.15
427 0.16
428 0.17
429 0.17
430 0.18
431 0.21
432 0.23
433 0.24
434 0.24
435 0.23
436 0.24
437 0.22
438 0.2
439 0.21
440 0.26
441 0.28
442 0.33