FuNGI

H6BV40

Protein Details

Accession

H6BV40

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-80	LAVSDGKAKKQKEKYRPQVYKAPKKPEP	Hydrophilic
109-135	ADSIARSKKIWERLRRKSHVPKEERDE	Basic
667-692	NEVKDSKEKKSGQEKKSKKDKKSKSK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
60-76	AKKQKEKYRPQVYKAPK
105-127	AKPNADSIARSKKIWERLRRKSH
659-692	KRPAKGDDNEVKDSKEKKSGQEKKSKKDKKSKSK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR012959 CPL_dom IPR033133 PUM-HD IPR040059 PUM3 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08144 CPL
PROSITE	View protein in PROSITE PS50303 PUM_HD

Amino Acid Sequences

MSKMAGTKRTHDNTEAKASKKAKVASELPKQAKSASLEDDFVPFDDADNGTALAVSDGKAKKQKEKYRPQVYKAPKKPEPYLNGTTTSREAHAKQKALTQDRKSAKPNADSIARSKKIWERLRRKSHVPKEERDELVKELFEIISGRVKDFVFKHDAVRVIQCALKYATPEQRRQITRDLKGTYRELAESKYAKFLIAKMVVKDDESRDAVVEEFYGHVKRLIRHPEASWILDDIYRGIATKQQKAIMLREWYGPEFAVFAKSNGTTSGEEVTADLSEILKQNPEKRGPFMQHLKEMTNQLVQKKTTAFTMLHDALLQYFLNCKPGSPEVEEFLAMLRDDEEGDVYKNLAFTKSGSRLVCLALAYGNSKDRRGILKFFKTHIKLMASDVYAHRVLLTAYECIDDTVMTAKAIFPELLSKDLDQEAREQELLAQVDHLTARIPLLYLMFQDAPKWLLPDESAAIIKEVREIRTQTSKKDPEVRRTELMKAISQTLLDLIASQTEALAKSTFGCKYMLETLLGAIGEKEAALTAIADLATSRDESEAMTALLSSPPFGRLLKGLVQGGRFDASTKTVKQVEPPLKFHELLYERIKNQSEDDDGAGEIVKWATGPNSFVIVAMLEAEDFSHADELKAIIKKNASSLDEDNAGARIILEKVGKRPAKGDDNEVKDSKEKKSGQEKKSKKDKKSKSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.63
3	0.56
4	0.59
5	0.58
6	0.56
7	0.57
8	0.56
9	0.5
10	0.52
11	0.58
12	0.58
13	0.65
14	0.69
15	0.68
16	0.66
17	0.61
18	0.55
19	0.52
20	0.46
21	0.4
22	0.36
23	0.33
24	0.32
25	0.31
26	0.32
27	0.27
28	0.23
29	0.21
30	0.15
31	0.14
32	0.15
33	0.14
34	0.13
35	0.13
36	0.13
37	0.1
38	0.1
39	0.09
40	0.07
41	0.08
42	0.07
43	0.14
44	0.16
45	0.22
46	0.29
47	0.33
48	0.42
49	0.52
50	0.62
51	0.65
52	0.76
53	0.81
54	0.85
55	0.9
56	0.86
57	0.86
58	0.87
59	0.87
60	0.85
61	0.84
62	0.79
63	0.77
64	0.79
65	0.78
66	0.74
67	0.71
68	0.69
69	0.62
70	0.6
71	0.55
72	0.5
73	0.44
74	0.38
75	0.32
76	0.3
77	0.3
78	0.33
79	0.4
80	0.41
81	0.39
82	0.43
83	0.5
84	0.55
85	0.61
86	0.57
87	0.6
88	0.62
89	0.67
90	0.66
91	0.65
92	0.63
93	0.59
94	0.58
95	0.53
96	0.53
97	0.49
98	0.51
99	0.53
100	0.48
101	0.43
102	0.44
103	0.46
104	0.51
105	0.58
106	0.61
107	0.62
108	0.7
109	0.81
110	0.82
111	0.85
112	0.86
113	0.87
114	0.86
115	0.83
116	0.81
117	0.78
118	0.8
119	0.73
120	0.65
121	0.58
122	0.5
123	0.45
124	0.36
125	0.28
126	0.21
127	0.18
128	0.15
129	0.13
130	0.11
131	0.15
132	0.16
133	0.16
134	0.17
135	0.17
136	0.22
137	0.22
138	0.26
139	0.26
140	0.27
141	0.29
142	0.3
143	0.33
144	0.29
145	0.31
146	0.27
147	0.22
148	0.23
149	0.2
150	0.19
151	0.18
152	0.17
153	0.17
154	0.22
155	0.29
156	0.34
157	0.39
158	0.43
159	0.5
160	0.52
161	0.53
162	0.57
163	0.57
164	0.57
165	0.59
166	0.56
167	0.51
168	0.52
169	0.51
170	0.43
171	0.36
172	0.32
173	0.26
174	0.25
175	0.27
176	0.25
177	0.24
178	0.25
179	0.24
180	0.22
181	0.22
182	0.21
183	0.22
184	0.25
185	0.26
186	0.23
187	0.26
188	0.26
189	0.26
190	0.28
191	0.23
192	0.21
193	0.2
194	0.19
195	0.16
196	0.16
197	0.15
198	0.13
199	0.11
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.08
205	0.11
206	0.14
207	0.16
208	0.23
209	0.31
210	0.33
211	0.35
212	0.36
213	0.41
214	0.41
215	0.39
216	0.32
217	0.25
218	0.21
219	0.19
220	0.19
221	0.11
222	0.09
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.12
227	0.15
228	0.2
229	0.22
230	0.24
231	0.27
232	0.29
233	0.32
234	0.32
235	0.31
236	0.28
237	0.28
238	0.27
239	0.25
240	0.23
241	0.2
242	0.14
243	0.12
244	0.1
245	0.12
246	0.1
247	0.1
248	0.11
249	0.11
250	0.12
251	0.12
252	0.14
253	0.11
254	0.11
255	0.13
256	0.11
257	0.11
258	0.1
259	0.1
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.04
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.1
268	0.12
269	0.17
270	0.23
271	0.28
272	0.28
273	0.31
274	0.36
275	0.36
276	0.42
277	0.45
278	0.42
279	0.42
280	0.42
281	0.4
282	0.37
283	0.36
284	0.3
285	0.26
286	0.25
287	0.24
288	0.26
289	0.24
290	0.23
291	0.23
292	0.22
293	0.18
294	0.19
295	0.15
296	0.13
297	0.19
298	0.18
299	0.16
300	0.16
301	0.15
302	0.12
303	0.13
304	0.12
305	0.05
306	0.07
307	0.07
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.12
312	0.15
313	0.17
314	0.18
315	0.19
316	0.17
317	0.17
318	0.17
319	0.14
320	0.12
321	0.1
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.04
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.07
339	0.12
340	0.15
341	0.2
342	0.19
343	0.2
344	0.2
345	0.2
346	0.2
347	0.14
348	0.11
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.12
354	0.12
355	0.13
356	0.13
357	0.15
358	0.2
359	0.22
360	0.27
361	0.3
362	0.37
363	0.39
364	0.41
365	0.46
366	0.44
367	0.42
368	0.4
369	0.34
370	0.27
371	0.26
372	0.27
373	0.2
374	0.19
375	0.18
376	0.17
377	0.16
378	0.15
379	0.12
380	0.1
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.06
391	0.05
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.08
399	0.07
400	0.05
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.14
408	0.15
409	0.12
410	0.14
411	0.14
412	0.15
413	0.15
414	0.13
415	0.12
416	0.14
417	0.14
418	0.11
419	0.1
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.08
434	0.09
435	0.09
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.1
450	0.1
451	0.09
452	0.13
453	0.14
454	0.15
455	0.18
456	0.2
457	0.23
458	0.34
459	0.36
460	0.35
461	0.43
462	0.46
463	0.47
464	0.56
465	0.57
466	0.57
467	0.63
468	0.64
469	0.59
470	0.57
471	0.56
472	0.5
473	0.47
474	0.39
475	0.33
476	0.3
477	0.24
478	0.21
479	0.18
480	0.13
481	0.11
482	0.08
483	0.07
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.13
496	0.13
497	0.13
498	0.14
499	0.12
500	0.16
501	0.2
502	0.19
503	0.16
504	0.16
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.11
509	0.07
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.04
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.04
518	0.03
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.11
542	0.11
543	0.12
544	0.12
545	0.15
546	0.19
547	0.22
548	0.24
549	0.25
550	0.26
551	0.25
552	0.25
553	0.23
554	0.18
555	0.15
556	0.14
557	0.16
558	0.19
559	0.2
560	0.24
561	0.28
562	0.28
563	0.33
564	0.41
565	0.46
566	0.48
567	0.51
568	0.51
569	0.52
570	0.52
571	0.46
572	0.46
573	0.39
574	0.39
575	0.43
576	0.43
577	0.39
578	0.45
579	0.47
580	0.39
581	0.39
582	0.37
583	0.33
584	0.28
585	0.28
586	0.23
587	0.2
588	0.19
589	0.17
590	0.12
591	0.1
592	0.08
593	0.06
594	0.05
595	0.06
596	0.08
597	0.09
598	0.1
599	0.11
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.13
604	0.12
605	0.1
606	0.09
607	0.08
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.05
613	0.06
614	0.08
615	0.08
616	0.09
617	0.1
618	0.11
619	0.16
620	0.2
621	0.21
622	0.22
623	0.25
624	0.26
625	0.31
626	0.36
627	0.32
628	0.33
629	0.35
630	0.35
631	0.34
632	0.33
633	0.28
634	0.23
635	0.21
636	0.15
637	0.12
638	0.1
639	0.09
640	0.12
641	0.16
642	0.18
643	0.23
644	0.33
645	0.37
646	0.36
647	0.4
648	0.45
649	0.5
650	0.5
651	0.55
652	0.55
653	0.58
654	0.64
655	0.61
656	0.56
657	0.53
658	0.54
659	0.5
660	0.5
661	0.48
662	0.51
663	0.6
664	0.68
665	0.71
666	0.78
667	0.82
668	0.83
669	0.9
670	0.9
671	0.89
672	0.9

H6BV40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer