FuNGI

H6BP78

Protein Details

Accession

H6BP78

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
336-355	PVQRSPKRSRRESQDNEPGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 5, cyto 4.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR043198 Cyclin/Ssn8 IPR006671 Cyclin_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0016538 F:cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF00134 Cyclin_N
CDD	cd20545 CYCLIN_SpCG1C-like_rpt1 cd20546 CYCLIN_SpCG1C_ScCTK2-like_rpt2

Amino Acid Sequences

MPSFKDVGRSDASPNFSTNPVLERAQSQWLFTPEELLLAPSIVEGMPVAQELANRQKGVNFITQVGIMLKLPQLTLSTAAVYLHRFFMRHAMVQNNKPGLHHYSVAATALFLATKVEENYRKMKELVVACCRVAQKQPNLVVDEQSKEYWKWRDTILHNEDLLLEALCFDLQLEQPYRILYDFLRFYGVQENKALRNASWAFLNDSLVTTMCLQFAPRTIAGCALYLGVKLAGVSLPDDGRERPWWEQLGLDILDIQRGCNLMAEVYENPALPRQGHKDAYTKEDDLVMFDQTRMGTTPQPDRSPADSARSGSQGVKRDRDAVDERESSEWGSGAPVQRSPKRSRRESQDNEPGQSERSSQQQAPADDRSQKHDITTADDVQKRIDDIVNNSSQAPRQSHNNGQQERIPVSRQPEQQSDRVGEQNNGRKSPGTTARVRSVAADGRPAEVATQDAGNDLDDAEKVDYGSEEGEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.35
3	0.32
4	0.32
5	0.28
6	0.26
7	0.24
8	0.24
9	0.23
10	0.23
11	0.25
12	0.32
13	0.31
14	0.29
15	0.3
16	0.32
17	0.34
18	0.31
19	0.31
20	0.22
21	0.23
22	0.21
23	0.17
24	0.14
25	0.11
26	0.11
27	0.07
28	0.08
29	0.06
30	0.06
31	0.05
32	0.05
33	0.05
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.08
38	0.12
39	0.22
40	0.26
41	0.26
42	0.26
43	0.28
44	0.3
45	0.33
46	0.35
47	0.28
48	0.25
49	0.25
50	0.25
51	0.24
52	0.21
53	0.18
54	0.12
55	0.12
56	0.11
57	0.11
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.13
63	0.12
64	0.12
65	0.11
66	0.12
67	0.13
68	0.14
69	0.14
70	0.15
71	0.16
72	0.15
73	0.15
74	0.22
75	0.24
76	0.26
77	0.28
78	0.33
79	0.39
80	0.44
81	0.5
82	0.47
83	0.44
84	0.41
85	0.41
86	0.38
87	0.34
88	0.31
89	0.24
90	0.22
91	0.22
92	0.22
93	0.18
94	0.12
95	0.09
96	0.08
97	0.07
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.07
102	0.08
103	0.14
104	0.18
105	0.22
106	0.3
107	0.32
108	0.34
109	0.33
110	0.33
111	0.34
112	0.35
113	0.39
114	0.38
115	0.38
116	0.35
117	0.39
118	0.38
119	0.34
120	0.34
121	0.35
122	0.34
123	0.39
124	0.44
125	0.44
126	0.46
127	0.45
128	0.42
129	0.37
130	0.33
131	0.27
132	0.23
133	0.22
134	0.2
135	0.25
136	0.27
137	0.26
138	0.25
139	0.26
140	0.33
141	0.35
142	0.44
143	0.43
144	0.41
145	0.39
146	0.38
147	0.35
148	0.28
149	0.25
150	0.14
151	0.09
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.04
157	0.05
158	0.05
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.11
166	0.12
167	0.09
168	0.12
169	0.12
170	0.12
171	0.15
172	0.14
173	0.15
174	0.23
175	0.23
176	0.2
177	0.23
178	0.25
179	0.23
180	0.26
181	0.26
182	0.17
183	0.23
184	0.22
185	0.19
186	0.19
187	0.18
188	0.17
189	0.17
190	0.18
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.09
195	0.09
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.11
204	0.1
205	0.11
206	0.1
207	0.12
208	0.12
209	0.12
210	0.1
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.07
226	0.07
227	0.09
228	0.11
229	0.13
230	0.14
231	0.17
232	0.18
233	0.17
234	0.17
235	0.15
236	0.16
237	0.13
238	0.11
239	0.09
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.05
250	0.05
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.09
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.13
261	0.16
262	0.21
263	0.23
264	0.26
265	0.31
266	0.32
267	0.37
268	0.37
269	0.32
270	0.27
271	0.27
272	0.24
273	0.2
274	0.19
275	0.15
276	0.12
277	0.11
278	0.12
279	0.1
280	0.1
281	0.09
282	0.1
283	0.11
284	0.14
285	0.22
286	0.25
287	0.27
288	0.28
289	0.31
290	0.32
291	0.35
292	0.33
293	0.31
294	0.28
295	0.29
296	0.29
297	0.27
298	0.25
299	0.23
300	0.27
301	0.3
302	0.32
303	0.34
304	0.34
305	0.37
306	0.36
307	0.39
308	0.39
309	0.35
310	0.37
311	0.34
312	0.34
313	0.31
314	0.31
315	0.25
316	0.2
317	0.15
318	0.09
319	0.09
320	0.11
321	0.13
322	0.14
323	0.17
324	0.24
325	0.29
326	0.35
327	0.43
328	0.49
329	0.55
330	0.62
331	0.66
332	0.7
333	0.76
334	0.77
335	0.78
336	0.8
337	0.75
338	0.69
339	0.62
340	0.53
341	0.44
342	0.37
343	0.3
344	0.21
345	0.23
346	0.25
347	0.24
348	0.3
349	0.33
350	0.35
351	0.37
352	0.4
353	0.38
354	0.4
355	0.41
356	0.41
357	0.4
358	0.38
359	0.34
360	0.34
361	0.31
362	0.3
363	0.33
364	0.32
365	0.35
366	0.38
367	0.37
368	0.34
369	0.34
370	0.28
371	0.26
372	0.23
373	0.19
374	0.21
375	0.27
376	0.28
377	0.28
378	0.28
379	0.28
380	0.28
381	0.3
382	0.29
383	0.25
384	0.3
385	0.36
386	0.45
387	0.53
388	0.6
389	0.58
390	0.57
391	0.59
392	0.56
393	0.52
394	0.46
395	0.4
396	0.34
397	0.37
398	0.42
399	0.45
400	0.46
401	0.52
402	0.53
403	0.55
404	0.56
405	0.54
406	0.49
407	0.48
408	0.45
409	0.4
410	0.44
411	0.48
412	0.5
413	0.48
414	0.45
415	0.42
416	0.42
417	0.46
418	0.47
419	0.45
420	0.45
421	0.5
422	0.55
423	0.55
424	0.53
425	0.46
426	0.42
427	0.42
428	0.36
429	0.36
430	0.3
431	0.3
432	0.3
433	0.28
434	0.23
435	0.17
436	0.17
437	0.12
438	0.12
439	0.1
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.08
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.1

H6BP78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer