FuNGI

H6C015

Protein Details

Accession

H6C015

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
437-460	NPGGGKRRGAKGKRGKNGNEKFGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
438-454	PGGGKRRGAKGKRGKNG

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 7, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRRWIRNATDKHDSDKNNAQTFQLLYRPQNDPALHDESAGERALYPVSGPASSSQNTTTQKKGLHLKDLEDDLDFDSMRENEGEAAQYGIYFDDTNYDYMQHLRDIGEGGGESHFIEATPVKVQTKGKGKAKTMKLEDALREVSLDDDRSVAGTDMISNFTTRTKDRKYESQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDQGDEDIFAALAQDGPNGELDLEEFEDNYFDEEDEGWESDATEKAPTQPSEVKLPSAAPVTQDGHEDDDTAHLDAEAAAAEDGDWLRDFAKFKRDNARKPPPKAAGSIIAASAIQDKAPSLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSSYSMTSSSLARTQGQQLLDARFDQVEKMYSLDEGDEFDDMDGGMSLASGMTGQSKMSQLSTTSFADEGAVREDFDSMMDGFLGDWNKANPGGGKRRGAKGKRGKNGNEKFGLQQLDEVRAELGPARINRRAPPTKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.64
3	0.6
4	0.6
5	0.61
6	0.57
7	0.56
8	0.51
9	0.46
10	0.45
11	0.42
12	0.39
13	0.35
14	0.33
15	0.37
16	0.4
17	0.39
18	0.44
19	0.41
20	0.38
21	0.39
22	0.41
23	0.35
24	0.32
25	0.3
26	0.24
27	0.26
28	0.23
29	0.17
30	0.11
31	0.12
32	0.12
33	0.11
34	0.09
35	0.1
36	0.11
37	0.11
38	0.12
39	0.14
40	0.18
41	0.19
42	0.21
43	0.2
44	0.26
45	0.32
46	0.35
47	0.37
48	0.37
49	0.39
50	0.43
51	0.51
52	0.49
53	0.52
54	0.5
55	0.49
56	0.49
57	0.49
58	0.43
59	0.34
60	0.3
61	0.22
62	0.21
63	0.17
64	0.12
65	0.13
66	0.12
67	0.13
68	0.12
69	0.11
70	0.1
71	0.11
72	0.12
73	0.09
74	0.1
75	0.09
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.06
82	0.09
83	0.1
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.12
88	0.14
89	0.16
90	0.13
91	0.13
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.12
96	0.11
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.06
103	0.06
104	0.05
105	0.07
106	0.06
107	0.08
108	0.1
109	0.12
110	0.13
111	0.18
112	0.2
113	0.26
114	0.35
115	0.42
116	0.47
117	0.52
118	0.58
119	0.63
120	0.68
121	0.69
122	0.64
123	0.62
124	0.58
125	0.55
126	0.5
127	0.45
128	0.39
129	0.29
130	0.25
131	0.19
132	0.17
133	0.14
134	0.13
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.09
149	0.11
150	0.13
151	0.15
152	0.22
153	0.26
154	0.32
155	0.37
156	0.46
157	0.53
158	0.6
159	0.65
160	0.65
161	0.62
162	0.59
163	0.55
164	0.45
165	0.37
166	0.27
167	0.2
168	0.13
169	0.11
170	0.07
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.1
178	0.14
179	0.14
180	0.12
181	0.13
182	0.12
183	0.12
184	0.12
185	0.11
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.05
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.09
238	0.12
239	0.12
240	0.15
241	0.19
242	0.2
243	0.25
244	0.25
245	0.23
246	0.2
247	0.2
248	0.18
249	0.16
250	0.15
251	0.1
252	0.12
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.13
257	0.14
258	0.14
259	0.14
260	0.11
261	0.1
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.07
281	0.09
282	0.11
283	0.21
284	0.24
285	0.28
286	0.38
287	0.46
288	0.52
289	0.61
290	0.7
291	0.69
292	0.72
293	0.77
294	0.73
295	0.67
296	0.61
297	0.53
298	0.46
299	0.39
300	0.34
301	0.25
302	0.19
303	0.16
304	0.14
305	0.13
306	0.08
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.09
315	0.11
316	0.11
317	0.16
318	0.18
319	0.18
320	0.25
321	0.33
322	0.41
323	0.46
324	0.51
325	0.56
326	0.63
327	0.72
328	0.72
329	0.73
330	0.74
331	0.75
332	0.76
333	0.69
334	0.62
335	0.53
336	0.45
337	0.37
338	0.28
339	0.23
340	0.18
341	0.16
342	0.15
343	0.17
344	0.19
345	0.18
346	0.19
347	0.21
348	0.24
349	0.23
350	0.25
351	0.25
352	0.26
353	0.26
354	0.24
355	0.21
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.13
360	0.12
361	0.11
362	0.12
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.08
389	0.1
390	0.11
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.16
395	0.19
396	0.18
397	0.18
398	0.18
399	0.16
400	0.17
401	0.16
402	0.15
403	0.14
404	0.13
405	0.12
406	0.12
407	0.13
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.1
417	0.11
418	0.1
419	0.11
420	0.12
421	0.14
422	0.14
423	0.15
424	0.17
425	0.25
426	0.35
427	0.4
428	0.48
429	0.52
430	0.6
431	0.69
432	0.7
433	0.72
434	0.74
435	0.77
436	0.78
437	0.82
438	0.82
439	0.83
440	0.86
441	0.84
442	0.79
443	0.71
444	0.64
445	0.61
446	0.55
447	0.44
448	0.4
449	0.34
450	0.34
451	0.32
452	0.29
453	0.24
454	0.21
455	0.21
456	0.18
457	0.18
458	0.18
459	0.23
460	0.29
461	0.34
462	0.38
463	0.44
464	0.52

H6C015

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer