Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R8W0

Protein Details
Accession C4R8W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-386THVSKKFVPKDVSKKVRKAAKPFLKWLDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-149KK
374-374R
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 9.833, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR045196  IF2/IF5  
IPR002735  Transl_init_fac_IF2/IF5_dom  
IPR016189  Transl_init_fac_IF2/IF5_N  
IPR016190  Transl_init_fac_IF2/IF5_Zn-bd  
IPR003307  W2_domain  
Gene Ontology GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0043614  C:multi-eIF complex  
GO:0005092  F:GDP-dissociation inhibitor activity  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
GO:0042256  P:cytosolic ribosome assembly  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
GO:0045947  P:negative regulation of translational initiation  
KEGG ppa:PAS_chr4_0771  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01873  eIF-5_eIF-2B  
PF02020  W2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51363  W2  
CDD cd11561  W2_eIF5  
Amino Acid Sequences MSFVNICRDNTDPFYRYKMPLIQAKTEGRGNGIKTAVLNLPDVARALNRPTIYVLKYFGFELGAQTSQERSLVNGVHEASKLQDCLDGFINKFVLCGSCKNPETDIIIEKDGTLTRDCKACGSKTKIDPRHKLATYIEKNPPESAKSKKNRKAATASANVVGGGVSISDIASGQKSTDADAIPADDDDDIDELARKINAEASALPEVQEVADDEWAVDMSEEAIRKRAQELEGLTVNEELSALDEFGEWLLGFDKSELPSDVDIYKRASDLDIVEDEKILQVLAQALFDEDILNQIPEHKGLLGKLITNENAEKSLLGGIERLVGLQFTDLIPAVPKIVMILYDEDLVSEAVIQDWGTHVSKKFVPKDVSKKVRKAAKPFLKWLDEAEEEDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.45
4 0.46
5 0.46
6 0.46
7 0.51
8 0.53
9 0.51
10 0.53
11 0.55
12 0.53
13 0.5
14 0.43
15 0.4
16 0.39
17 0.36
18 0.33
19 0.3
20 0.27
21 0.24
22 0.27
23 0.25
24 0.22
25 0.21
26 0.17
27 0.17
28 0.16
29 0.16
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.16
34 0.2
35 0.2
36 0.2
37 0.23
38 0.28
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.23
43 0.24
44 0.23
45 0.2
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.14
59 0.15
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.17
67 0.17
68 0.16
69 0.13
70 0.15
71 0.13
72 0.15
73 0.19
74 0.2
75 0.18
76 0.2
77 0.21
78 0.18
79 0.18
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.16
84 0.18
85 0.24
86 0.26
87 0.28
88 0.28
89 0.28
90 0.3
91 0.29
92 0.29
93 0.23
94 0.23
95 0.21
96 0.2
97 0.19
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.23
107 0.26
108 0.32
109 0.39
110 0.44
111 0.5
112 0.6
113 0.66
114 0.72
115 0.74
116 0.72
117 0.74
118 0.66
119 0.61
120 0.55
121 0.56
122 0.51
123 0.51
124 0.51
125 0.45
126 0.46
127 0.44
128 0.41
129 0.34
130 0.33
131 0.33
132 0.36
133 0.43
134 0.53
135 0.59
136 0.66
137 0.66
138 0.68
139 0.68
140 0.65
141 0.63
142 0.57
143 0.51
144 0.43
145 0.39
146 0.33
147 0.26
148 0.19
149 0.11
150 0.05
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.15
215 0.14
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.21
220 0.21
221 0.2
222 0.17
223 0.16
224 0.12
225 0.1
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.14
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.07
267 0.05
268 0.04
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.16
290 0.14
291 0.15
292 0.17
293 0.2
294 0.2
295 0.21
296 0.22
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.15
301 0.13
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.11
335 0.09
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.07
343 0.1
344 0.12
345 0.16
346 0.17
347 0.21
348 0.26
349 0.35
350 0.4
351 0.45
352 0.5
353 0.56
354 0.65
355 0.72
356 0.78
357 0.78
358 0.8
359 0.8
360 0.83
361 0.82
362 0.81
363 0.81
364 0.81
365 0.79
366 0.81
367 0.81
368 0.75
369 0.68
370 0.61
371 0.57
372 0.48
373 0.43