Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C5L1

Protein Details
Accession H6C5L1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
538-563VVWKRVPTMPPWRRPKRRGDDAFGTDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013655  PAS_fold_3  
Pfam View protein in Pfam  
PF08447  PAS_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
Amino Acid Sequences METVFITIHDLSLDARIRYCSDSIEDILGYLPHEVTGKSCWEYFHPDEIPFGRSIHGRGVSLDKAAVMNYCRIKHKDGSWVACECVFTVVYDVLVASTAVYRQGPKARQRALDGAGIRRIFSSSPRDPRYHMLSFLSNKFYQEPPAHIPEPRAALFLNRFTRTCTVMYATDGLTSILGIQPSELIGKSFYYCIEENCLQDAIKCLESAKANDSIAYLRFRYRNPMQDMDRAHAESVRALEDSDEDEDGGVPLTTGASVSSVSMSDASTPHAAGDTAPGTNAHGTTPFHEEATLPGQGTRRTPPAHQALPQDPQPTESGAAQASSNAVSESASSGTGTDPEASAHDGVEGVFDRSGSGTSTSSRTLNEDIQPEPLELEAVVSCSSDGLVVVLRRAGPLVPPTLGATEAPYYSNGLFASPWAPEPVLPANEPLGAVAAPAQLPTVTDNAQSGFMAAIRDVAVFAWSLTGINGSLAQYARGHAAGEAVPPELPVWDPNAKTDPESDNAINGFLCSAHRPFDSVAKSSPKKHDELSSSDDEVVWKRVPTMPPWRRPKRRGDDAFGTDGFDGVDGENRDGGRKRTTKSQSGSGSRGGESGSGPGSSSDSKAGSAVDSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.2
4 0.23
5 0.26
6 0.26
7 0.22
8 0.22
9 0.25
10 0.25
11 0.25
12 0.22
13 0.19
14 0.19
15 0.17
16 0.14
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.14
24 0.17
25 0.19
26 0.2
27 0.21
28 0.23
29 0.32
30 0.34
31 0.38
32 0.37
33 0.35
34 0.39
35 0.39
36 0.38
37 0.31
38 0.28
39 0.22
40 0.21
41 0.23
42 0.25
43 0.25
44 0.23
45 0.24
46 0.29
47 0.28
48 0.27
49 0.25
50 0.19
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.14
55 0.19
56 0.24
57 0.28
58 0.34
59 0.37
60 0.42
61 0.45
62 0.47
63 0.51
64 0.53
65 0.55
66 0.53
67 0.51
68 0.47
69 0.43
70 0.38
71 0.28
72 0.23
73 0.17
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.07
87 0.09
88 0.1
89 0.15
90 0.23
91 0.3
92 0.39
93 0.48
94 0.52
95 0.55
96 0.59
97 0.59
98 0.54
99 0.53
100 0.47
101 0.42
102 0.41
103 0.37
104 0.33
105 0.28
106 0.26
107 0.21
108 0.22
109 0.27
110 0.3
111 0.39
112 0.44
113 0.46
114 0.48
115 0.53
116 0.56
117 0.5
118 0.43
119 0.37
120 0.38
121 0.41
122 0.42
123 0.41
124 0.34
125 0.33
126 0.34
127 0.32
128 0.32
129 0.29
130 0.3
131 0.3
132 0.36
133 0.36
134 0.35
135 0.36
136 0.33
137 0.34
138 0.3
139 0.26
140 0.19
141 0.22
142 0.24
143 0.29
144 0.32
145 0.3
146 0.29
147 0.32
148 0.34
149 0.33
150 0.3
151 0.25
152 0.22
153 0.2
154 0.21
155 0.2
156 0.17
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.21
184 0.21
185 0.17
186 0.17
187 0.19
188 0.16
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.18
195 0.17
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.16
201 0.16
202 0.17
203 0.15
204 0.16
205 0.19
206 0.2
207 0.27
208 0.3
209 0.37
210 0.4
211 0.46
212 0.45
213 0.48
214 0.49
215 0.44
216 0.41
217 0.33
218 0.28
219 0.22
220 0.19
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.15
279 0.14
280 0.09
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.15
285 0.16
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.24
290 0.28
291 0.29
292 0.31
293 0.33
294 0.32
295 0.33
296 0.34
297 0.3
298 0.24
299 0.24
300 0.21
301 0.17
302 0.15
303 0.12
304 0.11
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.16
352 0.18
353 0.2
354 0.2
355 0.19
356 0.21
357 0.21
358 0.19
359 0.16
360 0.13
361 0.1
362 0.07
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.09
384 0.11
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.12
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.16
414 0.15
415 0.16
416 0.15
417 0.12
418 0.09
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.1
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.11
466 0.09
467 0.11
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.12
479 0.17
480 0.17
481 0.2
482 0.24
483 0.25
484 0.25
485 0.28
486 0.26
487 0.24
488 0.29
489 0.26
490 0.24
491 0.23
492 0.23
493 0.19
494 0.15
495 0.13
496 0.08
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.14
501 0.15
502 0.17
503 0.18
504 0.25
505 0.28
506 0.27
507 0.32
508 0.38
509 0.43
510 0.48
511 0.56
512 0.53
513 0.52
514 0.53
515 0.55
516 0.51
517 0.52
518 0.52
519 0.48
520 0.45
521 0.42
522 0.38
523 0.33
524 0.3
525 0.28
526 0.23
527 0.18
528 0.19
529 0.24
530 0.27
531 0.32
532 0.41
533 0.47
534 0.55
535 0.66
536 0.75
537 0.79
538 0.85
539 0.89
540 0.88
541 0.89
542 0.87
543 0.85
544 0.83
545 0.78
546 0.76
547 0.65
548 0.56
549 0.45
550 0.36
551 0.27
552 0.18
553 0.13
554 0.08
555 0.13
556 0.12
557 0.13
558 0.16
559 0.16
560 0.21
561 0.25
562 0.28
563 0.33
564 0.38
565 0.41
566 0.49
567 0.57
568 0.61
569 0.63
570 0.68
571 0.68
572 0.68
573 0.68
574 0.64
575 0.58
576 0.49
577 0.45
578 0.36
579 0.28
580 0.21
581 0.2
582 0.16
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.16
587 0.16
588 0.17
589 0.18
590 0.17
591 0.18
592 0.18
593 0.18