Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0V7H6

Protein Details
Accession Q0V7H6    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
503-522KRKTEEAAKKQAQSKKKRRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-382RRPPPSRIKSPTPEASSPPKSATPPEPKPKAKGFRIGGK
422-437KKGKRTFKIGGKGKGK
494-522KAERRRAELKRKTEEAAKKQAQSKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0032807  C:DNA ligase IV complex  
GO:0045027  F:DNA end binding  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
KEGG pno:SNOG_00038  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSCWRVLELSELPAGQVVPQLLVKPEFGPDSYSVHLTCLSNIWSEELDLAGIVQRAAEEQSPIEVSKRDTAQLAILLANVKKSLDHSDDTICWITRADSDGITLHTTIALPKPLDSLTWKFHLKKQASFVLKNELILPLLLSSHVQHERVDGLVSIIKDKDRAITRLVDQYESSNLDLAAAFPIISGLKSGRKVVKREQAARHIPALQLFREDAFKQETGQLVHLHVSTLGLFQEALSDCRPTVPPQLKSSDVDVSWWIGIPARISGVKIPAKGRNRQTVSSTKPIKPVAESSGDETEDEFETHSNFKTRNLKAPITSDDATEDDEDPDAPLRSQSQKSSQNARRPPPSRIKSPTPEASSPPKSATPPEPKPKAKGFRIGGKTKEIVTQPQDHLDNLPDGDALPLKESGSSQTIADVDLTPKKGKRTFKIGGKGKGKGDVGGSSQVQDTAPPMVDRTRATRSPSTPPPSSPPVSRFGRIISPVIEEREETAEEKAERRRAELKRKTEEAAKKQAQSKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.13
3 0.14
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.18
11 0.16
12 0.18
13 0.19
14 0.18
15 0.21
16 0.2
17 0.22
18 0.23
19 0.25
20 0.22
21 0.22
22 0.24
23 0.21
24 0.2
25 0.18
26 0.18
27 0.17
28 0.18
29 0.18
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.12
34 0.1
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.07
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.18
53 0.23
54 0.24
55 0.24
56 0.23
57 0.24
58 0.24
59 0.23
60 0.21
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.14
70 0.19
71 0.2
72 0.22
73 0.23
74 0.27
75 0.27
76 0.31
77 0.31
78 0.25
79 0.21
80 0.2
81 0.18
82 0.16
83 0.19
84 0.16
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.13
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.15
101 0.17
102 0.2
103 0.22
104 0.23
105 0.28
106 0.33
107 0.33
108 0.38
109 0.47
110 0.45
111 0.46
112 0.48
113 0.52
114 0.53
115 0.53
116 0.5
117 0.49
118 0.46
119 0.41
120 0.36
121 0.28
122 0.21
123 0.18
124 0.16
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.12
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.1
139 0.09
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.17
148 0.19
149 0.21
150 0.21
151 0.24
152 0.26
153 0.31
154 0.32
155 0.27
156 0.24
157 0.23
158 0.23
159 0.22
160 0.19
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.1
176 0.11
177 0.16
178 0.22
179 0.27
180 0.32
181 0.4
182 0.47
183 0.51
184 0.58
185 0.6
186 0.63
187 0.63
188 0.61
189 0.55
190 0.48
191 0.41
192 0.36
193 0.32
194 0.23
195 0.19
196 0.17
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.16
205 0.17
206 0.15
207 0.17
208 0.16
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.11
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.19
231 0.24
232 0.27
233 0.3
234 0.33
235 0.33
236 0.33
237 0.34
238 0.28
239 0.21
240 0.19
241 0.16
242 0.14
243 0.12
244 0.1
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.13
255 0.14
256 0.16
257 0.19
258 0.25
259 0.3
260 0.37
261 0.41
262 0.45
263 0.46
264 0.46
265 0.48
266 0.48
267 0.49
268 0.51
269 0.51
270 0.44
271 0.46
272 0.46
273 0.42
274 0.36
275 0.33
276 0.27
277 0.25
278 0.23
279 0.22
280 0.22
281 0.21
282 0.19
283 0.17
284 0.15
285 0.12
286 0.11
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.16
295 0.26
296 0.27
297 0.35
298 0.4
299 0.41
300 0.41
301 0.44
302 0.41
303 0.38
304 0.36
305 0.28
306 0.24
307 0.22
308 0.21
309 0.18
310 0.16
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.08
319 0.1
320 0.15
321 0.18
322 0.21
323 0.27
324 0.35
325 0.4
326 0.49
327 0.54
328 0.58
329 0.63
330 0.67
331 0.69
332 0.64
333 0.68
334 0.68
335 0.66
336 0.66
337 0.65
338 0.67
339 0.63
340 0.66
341 0.66
342 0.61
343 0.57
344 0.53
345 0.55
346 0.51
347 0.46
348 0.42
349 0.37
350 0.33
351 0.34
352 0.39
353 0.4
354 0.45
355 0.53
356 0.59
357 0.6
358 0.65
359 0.7
360 0.7
361 0.65
362 0.66
363 0.61
364 0.61
365 0.66
366 0.66
367 0.6
368 0.55
369 0.52
370 0.44
371 0.44
372 0.36
373 0.34
374 0.33
375 0.36
376 0.33
377 0.36
378 0.36
379 0.32
380 0.31
381 0.27
382 0.24
383 0.17
384 0.16
385 0.11
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.11
395 0.13
396 0.14
397 0.14
398 0.12
399 0.14
400 0.14
401 0.13
402 0.14
403 0.12
404 0.13
405 0.17
406 0.2
407 0.22
408 0.25
409 0.32
410 0.37
411 0.45
412 0.48
413 0.53
414 0.59
415 0.64
416 0.72
417 0.74
418 0.77
419 0.75
420 0.74
421 0.66
422 0.64
423 0.55
424 0.46
425 0.4
426 0.33
427 0.29
428 0.28
429 0.26
430 0.21
431 0.2
432 0.2
433 0.17
434 0.15
435 0.14
436 0.12
437 0.13
438 0.12
439 0.13
440 0.15
441 0.18
442 0.2
443 0.25
444 0.3
445 0.32
446 0.39
447 0.45
448 0.47
449 0.52
450 0.59
451 0.61
452 0.57
453 0.57
454 0.57
455 0.57
456 0.57
457 0.54
458 0.48
459 0.49
460 0.5
461 0.49
462 0.43
463 0.39
464 0.41
465 0.38
466 0.37
467 0.31
468 0.31
469 0.32
470 0.33
471 0.31
472 0.25
473 0.24
474 0.25
475 0.25
476 0.21
477 0.2
478 0.22
479 0.23
480 0.28
481 0.33
482 0.36
483 0.36
484 0.4
485 0.48
486 0.53
487 0.62
488 0.67
489 0.69
490 0.71
491 0.75
492 0.74
493 0.74
494 0.74
495 0.72
496 0.73
497 0.71
498 0.69
499 0.73
500 0.77
501 0.77
502 0.78