Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6CC18

Protein Details
Accession H6CC18    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-138PASVSRKRPRSKTPDAQRPLREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-153RKRPRSKTPDAQRPLREISANARPAKSGPPPK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013882  Ctp1_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08573  SAE2  
Amino Acid Sequences MSIPQSLTATLIQALSQSEELQRRVQESNEALERLKQENQRLKREVEDLHQARSNRDAPAPSQLEQLFTQNAEKQAEIDHLKSKLRLVQAKERKWRLQNPQISSPMVSSDDVEATTPASVSRKRPRSKTPDAQRPLREISANARPAKSGPPPKRLSDASRVAIAIPAFTEDGEDHNRSSPDPVMEDDAEGDRDGSASRRLQDLLSGPPPATPLLPRPVTGHATPARTPLNVRDQNNSRRATSASRSPVKGHSMLPPKPPPPPSEDEEPFRSRPVHRLNLTHFKTNPAYTGDQDRAYDDVVRGRGQCCGNNLPVLAATVSPDKDVSEDDLLAEFFGPGADAKIRNLTRLEKDKLLLEARTKRHADKCGQMTTTTVDRPQSPPGYWNTDMPGTQEDNENREKTRMREREEVERRYQQAMRGDGRWLFADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.18
6 0.23
7 0.25
8 0.29
9 0.3
10 0.32
11 0.34
12 0.34
13 0.35
14 0.32
15 0.37
16 0.37
17 0.36
18 0.33
19 0.35
20 0.37
21 0.34
22 0.38
23 0.37
24 0.43
25 0.51
26 0.59
27 0.65
28 0.65
29 0.64
30 0.62
31 0.61
32 0.55
33 0.5
34 0.52
35 0.45
36 0.44
37 0.46
38 0.43
39 0.39
40 0.42
41 0.4
42 0.32
43 0.34
44 0.31
45 0.29
46 0.37
47 0.39
48 0.34
49 0.37
50 0.34
51 0.33
52 0.32
53 0.33
54 0.24
55 0.22
56 0.24
57 0.22
58 0.25
59 0.24
60 0.23
61 0.2
62 0.2
63 0.25
64 0.24
65 0.23
66 0.25
67 0.26
68 0.28
69 0.29
70 0.3
71 0.29
72 0.34
73 0.38
74 0.39
75 0.47
76 0.55
77 0.63
78 0.7
79 0.73
80 0.73
81 0.76
82 0.78
83 0.78
84 0.78
85 0.77
86 0.74
87 0.74
88 0.69
89 0.62
90 0.54
91 0.44
92 0.36
93 0.29
94 0.23
95 0.16
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.1
106 0.14
107 0.22
108 0.32
109 0.41
110 0.48
111 0.55
112 0.64
113 0.7
114 0.77
115 0.79
116 0.8
117 0.81
118 0.81
119 0.82
120 0.76
121 0.71
122 0.65
123 0.56
124 0.46
125 0.37
126 0.36
127 0.36
128 0.38
129 0.35
130 0.32
131 0.3
132 0.31
133 0.34
134 0.37
135 0.39
136 0.4
137 0.47
138 0.5
139 0.52
140 0.56
141 0.55
142 0.52
143 0.5
144 0.49
145 0.41
146 0.38
147 0.36
148 0.31
149 0.29
150 0.23
151 0.15
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.05
158 0.08
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.17
166 0.16
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.09
199 0.1
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.2
205 0.22
206 0.21
207 0.24
208 0.22
209 0.24
210 0.24
211 0.25
212 0.24
213 0.21
214 0.22
215 0.2
216 0.28
217 0.31
218 0.32
219 0.36
220 0.41
221 0.49
222 0.55
223 0.53
224 0.43
225 0.38
226 0.39
227 0.36
228 0.32
229 0.32
230 0.33
231 0.35
232 0.36
233 0.37
234 0.38
235 0.37
236 0.36
237 0.31
238 0.31
239 0.35
240 0.37
241 0.42
242 0.44
243 0.42
244 0.46
245 0.47
246 0.41
247 0.39
248 0.41
249 0.38
250 0.4
251 0.41
252 0.4
253 0.43
254 0.45
255 0.4
256 0.37
257 0.36
258 0.29
259 0.35
260 0.38
261 0.41
262 0.4
263 0.44
264 0.49
265 0.57
266 0.58
267 0.56
268 0.48
269 0.44
270 0.44
271 0.4
272 0.35
273 0.29
274 0.28
275 0.23
276 0.28
277 0.26
278 0.25
279 0.24
280 0.23
281 0.2
282 0.19
283 0.18
284 0.14
285 0.15
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.17
290 0.22
291 0.23
292 0.24
293 0.25
294 0.27
295 0.27
296 0.27
297 0.26
298 0.21
299 0.19
300 0.18
301 0.13
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.12
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.07
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.06
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.19
329 0.2
330 0.22
331 0.26
332 0.3
333 0.35
334 0.43
335 0.47
336 0.41
337 0.43
338 0.42
339 0.44
340 0.42
341 0.37
342 0.37
343 0.41
344 0.42
345 0.48
346 0.49
347 0.51
348 0.55
349 0.59
350 0.57
351 0.58
352 0.61
353 0.6
354 0.58
355 0.51
356 0.46
357 0.42
358 0.41
359 0.34
360 0.3
361 0.26
362 0.28
363 0.3
364 0.36
365 0.36
366 0.33
367 0.35
368 0.38
369 0.43
370 0.41
371 0.41
372 0.37
373 0.35
374 0.34
375 0.32
376 0.31
377 0.26
378 0.25
379 0.31
380 0.3
381 0.32
382 0.39
383 0.39
384 0.36
385 0.4
386 0.44
387 0.42
388 0.5
389 0.54
390 0.54
391 0.61
392 0.63
393 0.68
394 0.74
395 0.74
396 0.72
397 0.71
398 0.67
399 0.64
400 0.63
401 0.57
402 0.55
403 0.56
404 0.53
405 0.46
406 0.48
407 0.43
408 0.43