Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C0H1

Protein Details
Accession H6C0H1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-317SDEEIAPKRKGKTRKRKASSDDDTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-309APKRKGKTRKRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSDEQDKYRPRSPDLSGFNAPPPRLSRIPSYSYTASPFFSPQSAAPSTSYFSSRDHSAVPHQAYPPSTTPRTPSIPTQPPLPSHSPHLPPSFDNPYPLHYSQQQPQFQAPRHFIGTDIHQHPPQQFAPPYPSVDSFHDMARTRQRKAAEDAQFAFNQDHHANAVNPIKTEQTQAPPPPPANVANDPSHGIDVRTKFPVARIKRIMQADEDVGKVAQATPTAVSKALELFMITLVTKGAAEARANSSKRVTAQHLKAALMKDSQFDFLTEICETVPDEGSKKGRAKSEAKSEDSDEEIAPKRKGKTRKRKASSDDDTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.58
3 0.55
4 0.53
5 0.54
6 0.54
7 0.48
8 0.43
9 0.41
10 0.4
11 0.39
12 0.4
13 0.42
14 0.42
15 0.47
16 0.46
17 0.48
18 0.44
19 0.43
20 0.44
21 0.37
22 0.32
23 0.28
24 0.27
25 0.22
26 0.2
27 0.2
28 0.17
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.22
33 0.22
34 0.22
35 0.22
36 0.23
37 0.19
38 0.19
39 0.2
40 0.21
41 0.21
42 0.21
43 0.22
44 0.26
45 0.32
46 0.33
47 0.34
48 0.33
49 0.34
50 0.34
51 0.36
52 0.35
53 0.34
54 0.33
55 0.31
56 0.33
57 0.35
58 0.39
59 0.37
60 0.38
61 0.41
62 0.46
63 0.46
64 0.48
65 0.46
66 0.44
67 0.48
68 0.46
69 0.38
70 0.36
71 0.41
72 0.4
73 0.42
74 0.42
75 0.38
76 0.36
77 0.4
78 0.41
79 0.35
80 0.35
81 0.3
82 0.3
83 0.35
84 0.34
85 0.31
86 0.28
87 0.31
88 0.34
89 0.42
90 0.41
91 0.37
92 0.41
93 0.44
94 0.45
95 0.47
96 0.44
97 0.38
98 0.36
99 0.34
100 0.3
101 0.26
102 0.24
103 0.26
104 0.26
105 0.26
106 0.25
107 0.27
108 0.27
109 0.29
110 0.26
111 0.24
112 0.22
113 0.21
114 0.26
115 0.25
116 0.27
117 0.24
118 0.24
119 0.22
120 0.23
121 0.24
122 0.19
123 0.18
124 0.21
125 0.2
126 0.22
127 0.29
128 0.31
129 0.3
130 0.33
131 0.34
132 0.33
133 0.38
134 0.44
135 0.39
136 0.39
137 0.39
138 0.37
139 0.35
140 0.33
141 0.27
142 0.18
143 0.17
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.13
150 0.17
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.15
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.2
160 0.21
161 0.23
162 0.25
163 0.25
164 0.24
165 0.24
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.24
170 0.23
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.2
175 0.15
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.21
184 0.29
185 0.29
186 0.35
187 0.38
188 0.39
189 0.45
190 0.47
191 0.44
192 0.36
193 0.34
194 0.28
195 0.24
196 0.21
197 0.16
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.16
229 0.24
230 0.25
231 0.27
232 0.27
233 0.28
234 0.3
235 0.33
236 0.35
237 0.37
238 0.4
239 0.45
240 0.45
241 0.44
242 0.45
243 0.42
244 0.37
245 0.3
246 0.27
247 0.23
248 0.22
249 0.23
250 0.19
251 0.18
252 0.17
253 0.14
254 0.16
255 0.14
256 0.13
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.18
265 0.22
266 0.28
267 0.33
268 0.36
269 0.4
270 0.46
271 0.51
272 0.54
273 0.62
274 0.63
275 0.61
276 0.6
277 0.57
278 0.53
279 0.49
280 0.43
281 0.32
282 0.3
283 0.33
284 0.35
285 0.35
286 0.38
287 0.41
288 0.47
289 0.58
290 0.64
291 0.68
292 0.74
293 0.82
294 0.85
295 0.89
296 0.89
297 0.9