Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C0T8

Protein Details
Accession H6C0T8    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
330-349EQQAKPKPGRKKASANKKAPHydrophilic
635-680VSARPVPKVKKPRGKRKSETSGEPKPAKEPKKRKNAEPKSKRLSTEBasic
847-875PDPEPETKPKPRTNAKTKAKAKSKTDPATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-283KKGEMKGSKRRSKSPTK
334-352KPKPGRKKASANKKAPARS
639-706PVPKVKKPRGKRKSETSGEPKPAKEPKKRKNAEPKSKRLSTEAAEVKKDTEAPAEQAKKAVRKRTSKK
836-841LRKRKA
851-870PETKPKPRTNAKTKAKAKSK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSAIVLLSSSPPQTFARSPTPVDCSSPLPSPGGILRDATQGSKRFKSASKSRNGFSNGFSTARSLLATKTGAENIPLRSPGKERFKTGSPIASQHRGGTGSPRGRFISEKVDGRPDENSGCFPPSQPQPQMVANDQECPPHADIFDFPDSTPPEKLSRVEEPRHMDDSPLHLEKAIPRRLDWTPVKPSGKASTNTNEAVDHAASFSKSLLEDFTYAESKCPETNKLTTKLDVNGEPMKRRRIDFVVTANSLRETVPMLPPPNNNQGKKGEMKGSKRRSKSPTKKMLTITGLATSNYGQDHGKSDRKVAPMLEYLTSTQFGAESEAGSATEQQAKPKPGRKKASANKKAPARSRLVSPTSAMKAIESQEALFGSASQLARDESPTLLRDTLEALKNSECFLSSDPISPQRTQPISIESTSPYQCRGTSRFVKKKNLWSAAGRDEDNALLQVDTVDLVDSPAVRLALAGKDVLLQPAEPVLPKACDGLREWHAHVSDTPLIRKAGSLVDIDDIVTPAGGRSTVSPSKIQMRSYHTSRPLEPEARATEPSKSEARPAEDVAPSPAPSKPVPVKPCYAGFSTHELQKQISAYGFKPVKKREKMIELLDRCWDDKHGIAPQEENREAMTHGDFLSKVHDVSARPVPKVKKPRGKRKSETSGEPKPAKEPKKRKNAEPKSKRLSTEAAEVKKDTEAPAEQAKKAVRKRTSKKALSEEVVMDVDDIDADKEVDGGLDGGTVVGESAKPAATPFDSKTKPSLKQAPTPQANKPATPPPTLPPISFSSSPPAPVTGLQSGALGSLVQTASYSNHPPTEVTPPEETDKRPSSAGSLPAPGGPKTTLRKRKAATNSDPDPEPETKPKPRTNAKTKAKAKSKTDPATVRESPCTTSLTPDHTPPAALPDIQAQIHAAIHFRPQPQFQPQPQPPQDSQRTESGATQPKGETNSSSKAKTKACLSATARVPTWREKILMYDPIVLEDLTAWLNTQGFAAIGEDREVSALEVREWCEMNGVCCLWKGGWRGNKNKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.35
4 0.38
5 0.41
6 0.43
7 0.48
8 0.44
9 0.46
10 0.42
11 0.38
12 0.37
13 0.38
14 0.35
15 0.3
16 0.28
17 0.26
18 0.27
19 0.25
20 0.23
21 0.2
22 0.2
23 0.23
24 0.24
25 0.25
26 0.28
27 0.33
28 0.38
29 0.41
30 0.42
31 0.42
32 0.46
33 0.53
34 0.57
35 0.59
36 0.63
37 0.65
38 0.65
39 0.68
40 0.68
41 0.61
42 0.53
43 0.5
44 0.42
45 0.37
46 0.36
47 0.3
48 0.25
49 0.24
50 0.21
51 0.17
52 0.14
53 0.17
54 0.18
55 0.17
56 0.18
57 0.21
58 0.2
59 0.22
60 0.25
61 0.24
62 0.27
63 0.29
64 0.28
65 0.28
66 0.33
67 0.39
68 0.46
69 0.47
70 0.49
71 0.51
72 0.55
73 0.59
74 0.58
75 0.56
76 0.49
77 0.51
78 0.52
79 0.52
80 0.48
81 0.43
82 0.41
83 0.35
84 0.33
85 0.33
86 0.36
87 0.37
88 0.38
89 0.41
90 0.39
91 0.4
92 0.42
93 0.39
94 0.38
95 0.37
96 0.4
97 0.39
98 0.46
99 0.44
100 0.44
101 0.42
102 0.36
103 0.33
104 0.3
105 0.3
106 0.25
107 0.26
108 0.25
109 0.24
110 0.27
111 0.31
112 0.37
113 0.37
114 0.38
115 0.39
116 0.43
117 0.46
118 0.43
119 0.43
120 0.36
121 0.38
122 0.35
123 0.33
124 0.3
125 0.3
126 0.28
127 0.22
128 0.22
129 0.19
130 0.19
131 0.23
132 0.26
133 0.22
134 0.2
135 0.24
136 0.27
137 0.28
138 0.29
139 0.25
140 0.25
141 0.27
142 0.29
143 0.29
144 0.35
145 0.41
146 0.44
147 0.48
148 0.52
149 0.54
150 0.56
151 0.51
152 0.43
153 0.37
154 0.38
155 0.38
156 0.33
157 0.27
158 0.24
159 0.26
160 0.31
161 0.38
162 0.38
163 0.33
164 0.31
165 0.36
166 0.38
167 0.46
168 0.45
169 0.43
170 0.45
171 0.53
172 0.55
173 0.51
174 0.53
175 0.51
176 0.51
177 0.46
178 0.44
179 0.41
180 0.43
181 0.43
182 0.4
183 0.32
184 0.27
185 0.27
186 0.22
187 0.16
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.14
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.19
207 0.21
208 0.22
209 0.25
210 0.32
211 0.38
212 0.43
213 0.44
214 0.43
215 0.43
216 0.42
217 0.41
218 0.35
219 0.33
220 0.33
221 0.34
222 0.39
223 0.41
224 0.44
225 0.44
226 0.44
227 0.45
228 0.43
229 0.44
230 0.42
231 0.43
232 0.42
233 0.41
234 0.4
235 0.35
236 0.31
237 0.27
238 0.22
239 0.16
240 0.11
241 0.12
242 0.15
243 0.19
244 0.21
245 0.24
246 0.27
247 0.32
248 0.4
249 0.46
250 0.44
251 0.44
252 0.45
253 0.46
254 0.48
255 0.46
256 0.45
257 0.44
258 0.52
259 0.58
260 0.65
261 0.68
262 0.69
263 0.74
264 0.73
265 0.77
266 0.79
267 0.8
268 0.8
269 0.77
270 0.78
271 0.73
272 0.72
273 0.63
274 0.55
275 0.45
276 0.37
277 0.32
278 0.25
279 0.23
280 0.16
281 0.14
282 0.12
283 0.12
284 0.09
285 0.09
286 0.14
287 0.19
288 0.24
289 0.24
290 0.29
291 0.33
292 0.35
293 0.36
294 0.33
295 0.31
296 0.28
297 0.29
298 0.24
299 0.2
300 0.19
301 0.18
302 0.18
303 0.14
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.14
317 0.14
318 0.19
319 0.24
320 0.28
321 0.34
322 0.42
323 0.5
324 0.53
325 0.6
326 0.63
327 0.69
328 0.74
329 0.79
330 0.82
331 0.79
332 0.76
333 0.75
334 0.76
335 0.71
336 0.68
337 0.62
338 0.54
339 0.52
340 0.51
341 0.47
342 0.41
343 0.35
344 0.34
345 0.3
346 0.29
347 0.24
348 0.18
349 0.17
350 0.17
351 0.17
352 0.13
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.09
358 0.07
359 0.06
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.08
369 0.1
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.13
376 0.17
377 0.18
378 0.17
379 0.17
380 0.18
381 0.18
382 0.19
383 0.16
384 0.12
385 0.1
386 0.11
387 0.13
388 0.12
389 0.14
390 0.15
391 0.21
392 0.24
393 0.24
394 0.23
395 0.28
396 0.28
397 0.27
398 0.27
399 0.25
400 0.24
401 0.24
402 0.24
403 0.18
404 0.21
405 0.21
406 0.2
407 0.18
408 0.16
409 0.17
410 0.19
411 0.22
412 0.25
413 0.33
414 0.43
415 0.51
416 0.56
417 0.65
418 0.66
419 0.72
420 0.74
421 0.69
422 0.62
423 0.56
424 0.54
425 0.5
426 0.47
427 0.37
428 0.29
429 0.24
430 0.21
431 0.18
432 0.13
433 0.08
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.11
472 0.15
473 0.18
474 0.2
475 0.21
476 0.22
477 0.22
478 0.21
479 0.2
480 0.18
481 0.18
482 0.17
483 0.16
484 0.15
485 0.15
486 0.15
487 0.15
488 0.12
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.04
506 0.1
507 0.12
508 0.14
509 0.14
510 0.16
511 0.24
512 0.26
513 0.27
514 0.26
515 0.32
516 0.35
517 0.38
518 0.43
519 0.41
520 0.41
521 0.4
522 0.41
523 0.38
524 0.36
525 0.32
526 0.3
527 0.27
528 0.27
529 0.28
530 0.23
531 0.21
532 0.19
533 0.22
534 0.21
535 0.18
536 0.2
537 0.21
538 0.23
539 0.22
540 0.23
541 0.23
542 0.21
543 0.21
544 0.2
545 0.18
546 0.15
547 0.15
548 0.14
549 0.13
550 0.13
551 0.17
552 0.2
553 0.26
554 0.3
555 0.32
556 0.34
557 0.33
558 0.36
559 0.33
560 0.29
561 0.24
562 0.22
563 0.25
564 0.25
565 0.26
566 0.25
567 0.24
568 0.23
569 0.22
570 0.2
571 0.16
572 0.15
573 0.13
574 0.12
575 0.19
576 0.23
577 0.24
578 0.3
579 0.37
580 0.46
581 0.48
582 0.52
583 0.5
584 0.54
585 0.55
586 0.55
587 0.57
588 0.49
589 0.46
590 0.45
591 0.4
592 0.33
593 0.29
594 0.23
595 0.15
596 0.14
597 0.15
598 0.16
599 0.18
600 0.18
601 0.21
602 0.24
603 0.29
604 0.28
605 0.25
606 0.22
607 0.2
608 0.19
609 0.18
610 0.15
611 0.09
612 0.09
613 0.1
614 0.1
615 0.09
616 0.12
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.12
621 0.12
622 0.16
623 0.24
624 0.23
625 0.23
626 0.29
627 0.32
628 0.38
629 0.48
630 0.54
631 0.56
632 0.64
633 0.75
634 0.79
635 0.86
636 0.85
637 0.85
638 0.85
639 0.81
640 0.8
641 0.76
642 0.74
643 0.72
644 0.67
645 0.58
646 0.54
647 0.57
648 0.57
649 0.59
650 0.62
651 0.64
652 0.72
653 0.76
654 0.79
655 0.82
656 0.84
657 0.85
658 0.84
659 0.85
660 0.82
661 0.82
662 0.74
663 0.66
664 0.59
665 0.49
666 0.48
667 0.45
668 0.39
669 0.36
670 0.35
671 0.32
672 0.29
673 0.28
674 0.19
675 0.15
676 0.13
677 0.15
678 0.22
679 0.24
680 0.24
681 0.27
682 0.3
683 0.35
684 0.4
685 0.46
686 0.46
687 0.54
688 0.62
689 0.69
690 0.76
691 0.75
692 0.77
693 0.75
694 0.73
695 0.64
696 0.59
697 0.49
698 0.4
699 0.33
700 0.26
701 0.18
702 0.12
703 0.09
704 0.06
705 0.06
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.03
724 0.03
725 0.04
726 0.04
727 0.05
728 0.05
729 0.07
730 0.09
731 0.12
732 0.15
733 0.23
734 0.25
735 0.27
736 0.34
737 0.39
738 0.41
739 0.46
740 0.53
741 0.49
742 0.56
743 0.63
744 0.66
745 0.66
746 0.67
747 0.64
748 0.64
749 0.61
750 0.53
751 0.49
752 0.47
753 0.43
754 0.42
755 0.4
756 0.33
757 0.4
758 0.4
759 0.36
760 0.31
761 0.32
762 0.33
763 0.33
764 0.31
765 0.28
766 0.27
767 0.29
768 0.26
769 0.23
770 0.19
771 0.18
772 0.21
773 0.17
774 0.17
775 0.15
776 0.15
777 0.13
778 0.12
779 0.11
780 0.07
781 0.05
782 0.07
783 0.06
784 0.06
785 0.06
786 0.07
787 0.09
788 0.12
789 0.15
790 0.15
791 0.16
792 0.17
793 0.18
794 0.2
795 0.27
796 0.26
797 0.27
798 0.28
799 0.29
800 0.34
801 0.36
802 0.36
803 0.36
804 0.37
805 0.34
806 0.33
807 0.31
808 0.3
809 0.31
810 0.34
811 0.28
812 0.26
813 0.25
814 0.27
815 0.28
816 0.24
817 0.22
818 0.19
819 0.22
820 0.29
821 0.39
822 0.46
823 0.5
824 0.58
825 0.59
826 0.67
827 0.71
828 0.72
829 0.71
830 0.7
831 0.69
832 0.65
833 0.63
834 0.55
835 0.5
836 0.43
837 0.39
838 0.38
839 0.41
840 0.46
841 0.54
842 0.58
843 0.62
844 0.7
845 0.75
846 0.78
847 0.81
848 0.82
849 0.84
850 0.87
851 0.88
852 0.87
853 0.85
854 0.83
855 0.82
856 0.82
857 0.78
858 0.78
859 0.74
860 0.68
861 0.68
862 0.66
863 0.59
864 0.54
865 0.49
866 0.43
867 0.38
868 0.38
869 0.3
870 0.3
871 0.3
872 0.31
873 0.31
874 0.32
875 0.34
876 0.3
877 0.3
878 0.25
879 0.27
880 0.22
881 0.2
882 0.18
883 0.19
884 0.22
885 0.21
886 0.21
887 0.16
888 0.15
889 0.16
890 0.16
891 0.13
892 0.1
893 0.16
894 0.21
895 0.24
896 0.27
897 0.29
898 0.35
899 0.44
900 0.52
901 0.54
902 0.6
903 0.63
904 0.7
905 0.71
906 0.72
907 0.66
908 0.67
909 0.69
910 0.64
911 0.61
912 0.56
913 0.55
914 0.49
915 0.49
916 0.48
917 0.49
918 0.44
919 0.43
920 0.38
921 0.38
922 0.39
923 0.37
924 0.33
925 0.29
926 0.37
927 0.39
928 0.42
929 0.44
930 0.48
931 0.5
932 0.51
933 0.51
934 0.5
935 0.48
936 0.53
937 0.52
938 0.54
939 0.56
940 0.55
941 0.51
942 0.47
943 0.49
944 0.47
945 0.47
946 0.42
947 0.38
948 0.34
949 0.38
950 0.4
951 0.43
952 0.38
953 0.38
954 0.35
955 0.35
956 0.35
957 0.28
958 0.22
959 0.16
960 0.14
961 0.1
962 0.09
963 0.08
964 0.09
965 0.09
966 0.09
967 0.09
968 0.08
969 0.07
970 0.08
971 0.09
972 0.09
973 0.09
974 0.1
975 0.11
976 0.1
977 0.11
978 0.11
979 0.1
980 0.13
981 0.13
982 0.14
983 0.17
984 0.19
985 0.22
986 0.22
987 0.21
988 0.24
989 0.24
990 0.23
991 0.24
992 0.24
993 0.21
994 0.21
995 0.23
996 0.17
997 0.22
998 0.26
999 0.3
1000 0.39
1001 0.48