Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6BXW4

Protein Details
Accession H6BXW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MGSSAKKKKEKKKDFQKQKLKVGKARPKADNHTDTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-28AKKKKEKKKDFQKQKLKVGKARPK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, pero 7, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSAKKKKEKKKDFQKQKLKVGKARPKADNHTDTSFSAKAIVLNQQLDVNAPSQSAAFLHHVSMLTSRSDSQRRDSLAYLTSHISSTVASKKGTATNTTLPITTNALLSSLCPLTLDGSAGVRQQLLKLFQTLPAEDIRDHVAKILPYMRAAMTHLSRDIRATAVEFLSFLIRTAGLELVACPGGWYQTLECFTTVLGWRGPRTADAKNWSSTKASFGGGDAKATARIMQVLAEFLQVGLGFDDDGGGGGNNTTCVSVSDLAVDFPLWFTNSLMMPSKSNAYAYLDLFGTPQKKKSEDDAAQQILDDPEDRLQLFINKFQPLIVVGVDAAKKEGGELGRASGLLAKTLEQVQQRHENLGNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.96
3 0.96
4 0.95
5 0.94
6 0.93
7 0.9
8 0.88
9 0.87
10 0.87
11 0.85
12 0.84
13 0.81
14 0.8
15 0.8
16 0.81
17 0.77
18 0.72
19 0.67
20 0.61
21 0.54
22 0.51
23 0.43
24 0.33
25 0.28
26 0.23
27 0.19
28 0.18
29 0.24
30 0.22
31 0.22
32 0.23
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.15
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.1
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.21
57 0.27
58 0.29
59 0.33
60 0.37
61 0.39
62 0.41
63 0.4
64 0.36
65 0.34
66 0.33
67 0.3
68 0.25
69 0.23
70 0.2
71 0.18
72 0.15
73 0.11
74 0.14
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.21
80 0.26
81 0.27
82 0.27
83 0.26
84 0.28
85 0.32
86 0.32
87 0.29
88 0.25
89 0.25
90 0.24
91 0.2
92 0.15
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.18
119 0.2
120 0.19
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.12
132 0.14
133 0.16
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.13
138 0.11
139 0.12
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.16
192 0.17
193 0.2
194 0.24
195 0.27
196 0.29
197 0.3
198 0.29
199 0.27
200 0.25
201 0.23
202 0.2
203 0.17
204 0.14
205 0.14
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.09
259 0.1
260 0.12
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.17
265 0.2
266 0.18
267 0.18
268 0.17
269 0.18
270 0.2
271 0.19
272 0.2
273 0.17
274 0.17
275 0.17
276 0.19
277 0.2
278 0.2
279 0.25
280 0.28
281 0.3
282 0.33
283 0.38
284 0.45
285 0.44
286 0.49
287 0.52
288 0.49
289 0.47
290 0.44
291 0.39
292 0.29
293 0.25
294 0.19
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.12
300 0.13
301 0.19
302 0.21
303 0.26
304 0.29
305 0.28
306 0.28
307 0.28
308 0.27
309 0.22
310 0.21
311 0.15
312 0.1
313 0.09
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.15
322 0.12
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.16
332 0.15
333 0.14
334 0.16
335 0.19
336 0.23
337 0.25
338 0.27
339 0.32
340 0.41
341 0.42
342 0.45