FuNGI

Q0U5J7

Protein Details

Accession

Q0U5J7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
473-504	DISAVTGRQKRKQKKKVKSKEATDRRAKTKNM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
480-500	RQKRKQKKKVKSKEATDRRAK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006941 RNase_CAF1 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0004535 F:poly(A)-specific ribonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000289 P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
KEGG	pno:SNOG_12967 -
Pfam	View protein in Pfam PF04857 CAF1

Amino Acid Sequences

MEVDAASFPHHLLGLFIHISEADFVSFDLELSGIPSRLPNKPRSGAGRFTLEERYAEAKEGANRYQILQVGITCARFDYIANKYVLRPYNINISPLISERVDFEREISLQSGAITFLLGCGFDMAKPFTHGVEYLSRQEAEQIKQATADRLENKNPPADMQLKDTDVDSLDFMRRVREAIIKWKAGTSESLAITTHTGLKEQPAIPTISRFEKRLVHQLVRAEYPELVSMGRSECVRIINFDPLREADNNRRIKSRVKEQVNRQSGFRWVFEALAQGNLDHAEPLYVAGNITADSHNVRDRYDRAVERLRTRQPVLVGHNMFTDIVYLYRTFVGELPDTLQGFRDAIHKEFPKIVDTKYLATHAEGDLNASPTLQEIAEGLTKQPLPDIVTHTDHSKYQEKEAFHEAGYDSLLTATIMIRLAAKLGAEHEKKHPSNIAPLTNGAKNTNGDLEDFIRDGREKAQKPVALPPLADISAVTGRQKRKQKKKVKSKEATDRRAKTKNMFDNLRDLSLDPEADEAASPESEPAIDFEDAEAWKDEPAAEAGSWENELFVQDKSGWVPIEQSERHVMEMIPKLDGDSAFWKEFGNTLRVFGTQEAVLKIADW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.13
4	0.12
5	0.12
6	0.12
7	0.13
8	0.12
9	0.08
10	0.08
11	0.08
12	0.09
13	0.09
14	0.08
15	0.07
16	0.06
17	0.06
18	0.08
19	0.11
20	0.09
21	0.1
22	0.14
23	0.18
24	0.26
25	0.33
26	0.38
27	0.44
28	0.49
29	0.56
30	0.6
31	0.62
32	0.6
33	0.58
34	0.58
35	0.51
36	0.49
37	0.47
38	0.4
39	0.35
40	0.32
41	0.32
42	0.26
43	0.26
44	0.25
45	0.23
46	0.28
47	0.32
48	0.3
49	0.3
50	0.3
51	0.3
52	0.32
53	0.3
54	0.26
55	0.22
56	0.2
57	0.21
58	0.22
59	0.21
60	0.17
61	0.15
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.15
66	0.18
67	0.23
68	0.25
69	0.26
70	0.27
71	0.34
72	0.38
73	0.36
74	0.34
75	0.3
76	0.39
77	0.39
78	0.39
79	0.31
80	0.29
81	0.26
82	0.26
83	0.27
84	0.17
85	0.15
86	0.17
87	0.2
88	0.2
89	0.19
90	0.18
91	0.19
92	0.19
93	0.21
94	0.19
95	0.16
96	0.14
97	0.14
98	0.13
99	0.09
100	0.09
101	0.07
102	0.05
103	0.06
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.06
108	0.06
109	0.06
110	0.09
111	0.1
112	0.11
113	0.13
114	0.14
115	0.13
116	0.14
117	0.14
118	0.14
119	0.19
120	0.21
121	0.23
122	0.24
123	0.24
124	0.23
125	0.28
126	0.3
127	0.26
128	0.3
129	0.28
130	0.26
131	0.28
132	0.29
133	0.27
134	0.24
135	0.27
136	0.27
137	0.3
138	0.35
139	0.37
140	0.38
141	0.39
142	0.36
143	0.32
144	0.31
145	0.32
146	0.28
147	0.28
148	0.29
149	0.26
150	0.26
151	0.25
152	0.21
153	0.17
154	0.16
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.13
159	0.13
160	0.14
161	0.13
162	0.13
163	0.15
164	0.19
165	0.19
166	0.28
167	0.34
168	0.34
169	0.34
170	0.35
171	0.33
172	0.28
173	0.27
174	0.21
175	0.19
176	0.18
177	0.18
178	0.17
179	0.16
180	0.16
181	0.15
182	0.15
183	0.1
184	0.11
185	0.1
186	0.12
187	0.17
188	0.17
189	0.17
190	0.16
191	0.18
192	0.18
193	0.2
194	0.21
195	0.23
196	0.23
197	0.24
198	0.25
199	0.29
200	0.31
201	0.39
202	0.41
203	0.37
204	0.38
205	0.41
206	0.4
207	0.36
208	0.34
209	0.25
210	0.2
211	0.18
212	0.15
213	0.11
214	0.09
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.11
223	0.11
224	0.13
225	0.14
226	0.22
227	0.22
228	0.22
229	0.22
230	0.2
231	0.23
232	0.22
233	0.23
234	0.23
235	0.32
236	0.38
237	0.38
238	0.4
239	0.39
240	0.45
241	0.48
242	0.5
243	0.5
244	0.54
245	0.6
246	0.66
247	0.75
248	0.75
249	0.69
250	0.6
251	0.52
252	0.49
253	0.43
254	0.34
255	0.25
256	0.18
257	0.17
258	0.17
259	0.17
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.07
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.13
287	0.14
288	0.18
289	0.22
290	0.22
291	0.24
292	0.31
293	0.34
294	0.36
295	0.41
296	0.42
297	0.4
298	0.4
299	0.38
300	0.33
301	0.34
302	0.33
303	0.33
304	0.3
305	0.26
306	0.25
307	0.23
308	0.21
309	0.16
310	0.13
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.12
325	0.12
326	0.12
327	0.11
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.12
332	0.12
333	0.13
334	0.19
335	0.19
336	0.2
337	0.23
338	0.23
339	0.22
340	0.22
341	0.21
342	0.21
343	0.22
344	0.22
345	0.21
346	0.22
347	0.19
348	0.17
349	0.18
350	0.12
351	0.13
352	0.11
353	0.11
354	0.1
355	0.12
356	0.11
357	0.09
358	0.09
359	0.07
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.04
364	0.06
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.12
375	0.16
376	0.18
377	0.2
378	0.21
379	0.23
380	0.23
381	0.23
382	0.26
383	0.29
384	0.26
385	0.29
386	0.33
387	0.32
388	0.34
389	0.38
390	0.35
391	0.27
392	0.28
393	0.22
394	0.17
395	0.17
396	0.13
397	0.08
398	0.07
399	0.07
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.08
413	0.16
414	0.18
415	0.2
416	0.26
417	0.35
418	0.35
419	0.38
420	0.4
421	0.33
422	0.41
423	0.44
424	0.41
425	0.33
426	0.35
427	0.36
428	0.33
429	0.33
430	0.25
431	0.22
432	0.2
433	0.2
434	0.19
435	0.16
436	0.15
437	0.15
438	0.16
439	0.15
440	0.14
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.18
446	0.26
447	0.26
448	0.32
449	0.39
450	0.39
451	0.41
452	0.48
453	0.48
454	0.41
455	0.39
456	0.34
457	0.31
458	0.28
459	0.26
460	0.18
461	0.14
462	0.15
463	0.16
464	0.18
465	0.21
466	0.25
467	0.34
468	0.44
469	0.52
470	0.61
471	0.71
472	0.78
473	0.83
474	0.9
475	0.93
476	0.94
477	0.93
478	0.92
479	0.93
480	0.93
481	0.92
482	0.9
483	0.87
484	0.84
485	0.81
486	0.76
487	0.72
488	0.72
489	0.71
490	0.69
491	0.67
492	0.61
493	0.62
494	0.59
495	0.53
496	0.43
497	0.35
498	0.29
499	0.25
500	0.23
501	0.15
502	0.13
503	0.12
504	0.11
505	0.1
506	0.09
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.11
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.15
520	0.15
521	0.16
522	0.16
523	0.13
524	0.13
525	0.13
526	0.13
527	0.1
528	0.12
529	0.12
530	0.1
531	0.11
532	0.12
533	0.12
534	0.13
535	0.12
536	0.1
537	0.09
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.11
542	0.1
543	0.12
544	0.13
545	0.17
546	0.16
547	0.15
548	0.17
549	0.19
550	0.27
551	0.26
552	0.29
553	0.32
554	0.32
555	0.33
556	0.32
557	0.29
558	0.28
559	0.35
560	0.32
561	0.26
562	0.25
563	0.25
564	0.26
565	0.26
566	0.21
567	0.2
568	0.24
569	0.24
570	0.24
571	0.24
572	0.22
573	0.26
574	0.26
575	0.26
576	0.21
577	0.22
578	0.24
579	0.24
580	0.25
581	0.22
582	0.22
583	0.17
584	0.2
585	0.19
586	0.18

Q0U5J7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer