Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C4R8

Protein Details
Accession H6C4R8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
805-827AQAKSRHRGKGNHDQPQRNNNTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
738-787RIGRTGKERRERLYRELLERKRSLELEKKKLDTLADKARKQKEGGADGSK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MSISSMLGTEPERATHEQYPQNLHSRTSSRQPSISGPPMSLGAVMSPPQYPSKPSIGDYSWKNRSKTPDRSAGSSLGPRTHRSSSGTMTQRPGSLYEPPPRSGPGAYPEPRYTPPFGSAPAPKDEYEDRTRRTSISGILQSLQQRPESQPQPSTATTFQPYSNPPARPESNPTSMGHGDRPPHSAPNGPDHYRPHGLIGTYDTRPPSQPPGQRYSQNVPPPQSASTSDRALPQSLSPELRRPQPHLSENRGLAGLLHQSSESAYGAQNMARQDSVQSQSDRSVFGDRLRGTRPYSPFAGSVASQTALDDQLRKGSDELSQHRAILGLANESKRGRYSPLPQAVQGAQAQTPQPDAGIKTEHGRVFSGIGSGLGSAQTPTPQPASATPSKRDEGGSRLSEENLMKMSRSTSGITKRNRKNFDEDVRAESDMGDIKKTGLGRGKRAKYQHSYKTEVEDSTTGNRRNGALAPSNQHRRAPTPTSNPSQPQQSHDNHPQRQLPTADNTPIHRFRRTIRIFSVVALARRNPRRHLGFFNYDPQVGPIDIEKPSSPKFDIAIRPNLLPSFTDAEHVNCTYTVRVPRIWLRERERFLICQERYLWGSGIYTDDSDPVAAAMHSGFIASVYPPGIDEALLQKVIDEQTPVIEGSPAPKKPMPVDENKDLHITLLVLPQLERYVDSVRFGIKSRSWPDGSESPASNMPRSGSSNSNNNSKSPKTPHDGVSFMVLKVEFVDDGAEVKRIGRTGKERRERLYRELLERKRSLELEKKKLDTLADKARKQKEGGADGSKPGSKSSGNETGPAGDSAAQAKSRHRGKGNHDQPQRNNNTDGNDDKRDDKRDDDMKLDVGQSPGDWIRQLAVAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.39
4 0.41
5 0.45
6 0.51
7 0.52
8 0.58
9 0.53
10 0.5
11 0.49
12 0.48
13 0.49
14 0.51
15 0.55
16 0.51
17 0.52
18 0.53
19 0.52
20 0.56
21 0.58
22 0.5
23 0.41
24 0.38
25 0.36
26 0.33
27 0.27
28 0.18
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.18
36 0.2
37 0.22
38 0.25
39 0.31
40 0.32
41 0.33
42 0.37
43 0.36
44 0.42
45 0.46
46 0.5
47 0.53
48 0.57
49 0.58
50 0.57
51 0.64
52 0.67
53 0.7
54 0.69
55 0.69
56 0.66
57 0.69
58 0.67
59 0.6
60 0.55
61 0.5
62 0.45
63 0.41
64 0.4
65 0.39
66 0.41
67 0.42
68 0.4
69 0.4
70 0.41
71 0.4
72 0.46
73 0.49
74 0.48
75 0.49
76 0.48
77 0.45
78 0.41
79 0.38
80 0.32
81 0.33
82 0.35
83 0.4
84 0.42
85 0.42
86 0.42
87 0.42
88 0.42
89 0.35
90 0.32
91 0.29
92 0.34
93 0.36
94 0.4
95 0.41
96 0.43
97 0.45
98 0.46
99 0.43
100 0.36
101 0.37
102 0.33
103 0.33
104 0.34
105 0.36
106 0.35
107 0.36
108 0.37
109 0.32
110 0.35
111 0.37
112 0.38
113 0.41
114 0.45
115 0.44
116 0.46
117 0.47
118 0.44
119 0.43
120 0.39
121 0.34
122 0.35
123 0.35
124 0.32
125 0.31
126 0.34
127 0.35
128 0.37
129 0.35
130 0.28
131 0.27
132 0.3
133 0.38
134 0.39
135 0.4
136 0.39
137 0.4
138 0.44
139 0.42
140 0.42
141 0.35
142 0.35
143 0.33
144 0.31
145 0.29
146 0.27
147 0.29
148 0.32
149 0.37
150 0.35
151 0.36
152 0.41
153 0.44
154 0.44
155 0.49
156 0.48
157 0.46
158 0.46
159 0.44
160 0.42
161 0.41
162 0.39
163 0.35
164 0.32
165 0.31
166 0.3
167 0.34
168 0.31
169 0.31
170 0.31
171 0.32
172 0.31
173 0.36
174 0.41
175 0.39
176 0.42
177 0.43
178 0.48
179 0.45
180 0.43
181 0.37
182 0.32
183 0.3
184 0.26
185 0.27
186 0.25
187 0.23
188 0.25
189 0.24
190 0.23
191 0.24
192 0.25
193 0.28
194 0.32
195 0.36
196 0.4
197 0.45
198 0.48
199 0.51
200 0.55
201 0.53
202 0.53
203 0.55
204 0.54
205 0.51
206 0.49
207 0.47
208 0.42
209 0.38
210 0.35
211 0.31
212 0.3
213 0.28
214 0.27
215 0.29
216 0.29
217 0.28
218 0.24
219 0.21
220 0.21
221 0.22
222 0.24
223 0.22
224 0.27
225 0.29
226 0.36
227 0.38
228 0.4
229 0.44
230 0.48
231 0.54
232 0.55
233 0.59
234 0.57
235 0.55
236 0.51
237 0.43
238 0.35
239 0.27
240 0.22
241 0.18
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.16
261 0.18
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.23
266 0.24
267 0.23
268 0.2
269 0.2
270 0.17
271 0.18
272 0.24
273 0.22
274 0.25
275 0.27
276 0.28
277 0.28
278 0.34
279 0.35
280 0.32
281 0.33
282 0.31
283 0.29
284 0.26
285 0.25
286 0.18
287 0.16
288 0.13
289 0.11
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.09
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.13
302 0.16
303 0.21
304 0.25
305 0.27
306 0.27
307 0.26
308 0.26
309 0.25
310 0.21
311 0.17
312 0.13
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.19
323 0.25
324 0.32
325 0.4
326 0.4
327 0.39
328 0.41
329 0.38
330 0.35
331 0.29
332 0.21
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.12
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.13
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.16
371 0.22
372 0.25
373 0.27
374 0.3
375 0.31
376 0.31
377 0.31
378 0.26
379 0.23
380 0.25
381 0.23
382 0.22
383 0.22
384 0.21
385 0.23
386 0.21
387 0.18
388 0.14
389 0.13
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.09
394 0.11
395 0.11
396 0.14
397 0.22
398 0.29
399 0.36
400 0.46
401 0.52
402 0.59
403 0.63
404 0.61
405 0.6
406 0.61
407 0.61
408 0.59
409 0.53
410 0.48
411 0.44
412 0.41
413 0.34
414 0.26
415 0.19
416 0.14
417 0.13
418 0.1
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.12
424 0.15
425 0.17
426 0.25
427 0.34
428 0.37
429 0.41
430 0.44
431 0.48
432 0.5
433 0.56
434 0.57
435 0.53
436 0.56
437 0.52
438 0.53
439 0.48
440 0.4
441 0.33
442 0.25
443 0.21
444 0.2
445 0.25
446 0.22
447 0.2
448 0.21
449 0.2
450 0.21
451 0.21
452 0.19
453 0.18
454 0.18
455 0.22
456 0.27
457 0.34
458 0.34
459 0.35
460 0.33
461 0.32
462 0.36
463 0.38
464 0.38
465 0.4
466 0.44
467 0.46
468 0.48
469 0.47
470 0.43
471 0.44
472 0.39
473 0.35
474 0.37
475 0.36
476 0.39
477 0.47
478 0.54
479 0.49
480 0.53
481 0.53
482 0.47
483 0.48
484 0.43
485 0.35
486 0.31
487 0.3
488 0.29
489 0.26
490 0.28
491 0.3
492 0.35
493 0.35
494 0.33
495 0.32
496 0.32
497 0.41
498 0.42
499 0.41
500 0.36
501 0.38
502 0.36
503 0.35
504 0.38
505 0.29
506 0.26
507 0.23
508 0.23
509 0.26
510 0.33
511 0.36
512 0.34
513 0.39
514 0.44
515 0.46
516 0.51
517 0.5
518 0.49
519 0.49
520 0.51
521 0.45
522 0.39
523 0.35
524 0.29
525 0.23
526 0.16
527 0.14
528 0.09
529 0.1
530 0.1
531 0.11
532 0.11
533 0.13
534 0.15
535 0.17
536 0.17
537 0.16
538 0.17
539 0.22
540 0.29
541 0.3
542 0.36
543 0.34
544 0.34
545 0.34
546 0.33
547 0.27
548 0.2
549 0.18
550 0.15
551 0.13
552 0.15
553 0.14
554 0.16
555 0.17
556 0.17
557 0.15
558 0.11
559 0.12
560 0.11
561 0.15
562 0.18
563 0.18
564 0.18
565 0.22
566 0.27
567 0.35
568 0.4
569 0.44
570 0.48
571 0.54
572 0.56
573 0.57
574 0.54
575 0.47
576 0.46
577 0.48
578 0.4
579 0.36
580 0.34
581 0.31
582 0.3
583 0.3
584 0.26
585 0.16
586 0.16
587 0.12
588 0.13
589 0.11
590 0.1
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.06
615 0.07
616 0.09
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.09
621 0.11
622 0.12
623 0.12
624 0.1
625 0.08
626 0.09
627 0.1
628 0.1
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.12
633 0.19
634 0.19
635 0.23
636 0.24
637 0.26
638 0.29
639 0.38
640 0.39
641 0.42
642 0.48
643 0.52
644 0.53
645 0.53
646 0.51
647 0.41
648 0.36
649 0.27
650 0.2
651 0.13
652 0.13
653 0.12
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.12
658 0.11
659 0.1
660 0.1
661 0.14
662 0.14
663 0.16
664 0.16
665 0.17
666 0.19
667 0.2
668 0.22
669 0.22
670 0.29
671 0.31
672 0.37
673 0.36
674 0.36
675 0.41
676 0.4
677 0.42
678 0.38
679 0.35
680 0.31
681 0.35
682 0.35
683 0.3
684 0.26
685 0.23
686 0.22
687 0.25
688 0.26
689 0.27
690 0.3
691 0.38
692 0.4
693 0.47
694 0.45
695 0.45
696 0.48
697 0.45
698 0.48
699 0.47
700 0.5
701 0.49
702 0.52
703 0.56
704 0.54
705 0.52
706 0.45
707 0.45
708 0.39
709 0.31
710 0.29
711 0.22
712 0.17
713 0.17
714 0.17
715 0.1
716 0.08
717 0.09
718 0.07
719 0.09
720 0.09
721 0.1
722 0.09
723 0.1
724 0.12
725 0.13
726 0.15
727 0.2
728 0.29
729 0.39
730 0.5
731 0.59
732 0.63
733 0.68
734 0.76
735 0.75
736 0.72
737 0.73
738 0.68
739 0.68
740 0.73
741 0.73
742 0.72
743 0.69
744 0.64
745 0.59
746 0.55
747 0.53
748 0.53
749 0.56
750 0.57
751 0.62
752 0.62
753 0.58
754 0.58
755 0.54
756 0.49
757 0.47
758 0.48
759 0.5
760 0.53
761 0.6
762 0.64
763 0.65
764 0.61
765 0.59
766 0.57
767 0.54
768 0.56
769 0.53
770 0.48
771 0.47
772 0.49
773 0.46
774 0.37
775 0.31
776 0.28
777 0.23
778 0.24
779 0.29
780 0.35
781 0.33
782 0.35
783 0.35
784 0.34
785 0.34
786 0.31
787 0.24
788 0.16
789 0.16
790 0.17
791 0.19
792 0.19
793 0.2
794 0.24
795 0.32
796 0.37
797 0.44
798 0.49
799 0.55
800 0.6
801 0.69
802 0.75
803 0.76
804 0.79
805 0.81
806 0.82
807 0.85
808 0.84
809 0.77
810 0.72
811 0.65
812 0.6
813 0.56
814 0.55
815 0.51
816 0.49
817 0.47
818 0.49
819 0.53
820 0.54
821 0.52
822 0.49
823 0.51
824 0.52
825 0.53
826 0.5
827 0.46
828 0.43
829 0.42
830 0.39
831 0.32
832 0.26
833 0.23
834 0.19
835 0.21
836 0.2
837 0.19
838 0.18
839 0.16
840 0.17
841 0.17