Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C5W3

Protein Details
Accession H6C5W3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-180AYFSSLLERQKKKPRLKNERSARLAQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-171KKKPRLKN
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto 9, mito_nucl 8, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007231  Nucleoporin_int_Nup93/Nic96  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0017056  F:structural constituent of nuclear pore  
Pfam View protein in Pfam  
PF04097  Nic96  
Amino Acid Sequences MSLFGQPSAGQGQGSSGGLFSGLNVNTNTDAQGKRKSIFDNSTSQQTTSTAFPTLNTNASSGSVFNLGGAAKTSAPTFSFGTAATTSAPSTGLFGAATSTSQQPAPTSSLFGASTTQPPVNNTSTFGNTLGQNNAAGAGAQQTDAAPSQTRDAAYFSSLLERQKKKPRLKNERSARLAQLPGLDLDLGDLARRAQEIRQRGTKPSEPHTDSRAHYLLAGSGIAPGQAYRDFQALAPDDRAGLSRTAADAFADESTAYLRDLRTKGREAMMREGMDRVYREVDQFIEESLGVDFEEQKLRIMDHFGLVPPGQEGDEDDAQSLFGRTPRRSKEALSGTARGTRSIFGRSAVERSIIGTPGSVAGSASFFKSAAPPPAVFTRGQSSRDLREKEKSLIGRVEELNRARLQDAPYPLLQAFAEAEDGHIGDSPQQLVEAYHALREITKEGRSPVSERKYAHAYLDETGSIGATSLKKQILEGSRVYLEKSFLRELKLLIEKNAREAALGGQPSVVNIVRAYIRLRAVRRDLVPDGAELQQDKDENGDYFWVIVFYLLRCGFVKEAAAYVKTNEVFQSTDKRFVAYLTAYAESPDRRLARRQQEAIDNEYAKMTKVAQKSAVDPYKIACYKVVGRCDLNTRSLDAIGQGIEDWLWLQFTLARETERVEEISGEIFGLDQIRETISEIGEKHFQKSQIEGSNAYGTFLLMQVLAGMFEQAVDYLHNFNPVSAVHLAVALAYYGLLRVSDFTVAGNELLTYSTTQLPMINFVPLVAHHTATFRSALPIAAVDYLSLICLNSDLQPASLGLVHTNACHECLRELCLETREFAKLLGDIRGDGTRIPGAIEIRAKLIKLDNREEFLRSITSQSAAVADQRGQIADAVLLYHLCEDYDNVVSVLNRALADAVTLDLGETPMQLQPLRPRRGDGQNESAASSQTGGPQSSLSLTESTTSPVELARNMISLYNSNAAYYNVISVTNREVCGALLRLLSVRSHLEASPPQYMAALEELNDLNILPLRANGSIPVIRAAATTFGSLPQILARCAGVSVVWAVRAIGGERDNLVRNGRWEAGYGDDTGPMKDQLSEMAKDLMVFAGLVKYKLPSRVYDMLTRAGGEVGAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.15
12 0.17
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.21
17 0.24
18 0.27
19 0.35
20 0.37
21 0.37
22 0.42
23 0.44
24 0.47
25 0.5
26 0.5
27 0.49
28 0.49
29 0.56
30 0.53
31 0.49
32 0.41
33 0.35
34 0.33
35 0.27
36 0.26
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.22
41 0.24
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.2
46 0.22
47 0.22
48 0.16
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.18
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.17
92 0.21
93 0.19
94 0.2
95 0.19
96 0.21
97 0.21
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.2
102 0.21
103 0.23
104 0.21
105 0.23
106 0.28
107 0.3
108 0.28
109 0.27
110 0.27
111 0.28
112 0.28
113 0.27
114 0.25
115 0.23
116 0.25
117 0.24
118 0.21
119 0.18
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.15
144 0.18
145 0.2
146 0.26
147 0.33
148 0.37
149 0.45
150 0.55
151 0.64
152 0.69
153 0.76
154 0.81
155 0.83
156 0.88
157 0.9
158 0.9
159 0.91
160 0.86
161 0.82
162 0.75
163 0.7
164 0.61
165 0.52
166 0.43
167 0.33
168 0.27
169 0.23
170 0.18
171 0.11
172 0.1
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.19
183 0.27
184 0.33
185 0.42
186 0.44
187 0.49
188 0.55
189 0.58
190 0.56
191 0.56
192 0.59
193 0.56
194 0.57
195 0.55
196 0.54
197 0.48
198 0.5
199 0.44
200 0.34
201 0.29
202 0.26
203 0.23
204 0.17
205 0.16
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.18
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.19
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.14
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.15
247 0.18
248 0.23
249 0.28
250 0.31
251 0.34
252 0.38
253 0.42
254 0.39
255 0.44
256 0.44
257 0.4
258 0.36
259 0.34
260 0.3
261 0.28
262 0.25
263 0.19
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.17
288 0.16
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.07
299 0.08
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.08
309 0.1
310 0.15
311 0.18
312 0.26
313 0.31
314 0.37
315 0.38
316 0.39
317 0.45
318 0.47
319 0.51
320 0.47
321 0.45
322 0.41
323 0.45
324 0.43
325 0.35
326 0.28
327 0.22
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.15
332 0.18
333 0.18
334 0.2
335 0.19
336 0.18
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.14
341 0.12
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.07
347 0.06
348 0.05
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.1
356 0.12
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.19
361 0.22
362 0.24
363 0.21
364 0.2
365 0.23
366 0.24
367 0.26
368 0.27
369 0.28
370 0.33
371 0.41
372 0.43
373 0.4
374 0.43
375 0.44
376 0.43
377 0.46
378 0.41
379 0.37
380 0.36
381 0.33
382 0.3
383 0.29
384 0.29
385 0.28
386 0.27
387 0.27
388 0.24
389 0.24
390 0.21
391 0.23
392 0.23
393 0.22
394 0.24
395 0.23
396 0.22
397 0.23
398 0.23
399 0.2
400 0.17
401 0.12
402 0.1
403 0.07
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.11
428 0.11
429 0.13
430 0.13
431 0.15
432 0.18
433 0.19
434 0.22
435 0.28
436 0.31
437 0.34
438 0.34
439 0.35
440 0.37
441 0.36
442 0.34
443 0.28
444 0.24
445 0.2
446 0.2
447 0.16
448 0.12
449 0.11
450 0.1
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.17
461 0.19
462 0.21
463 0.21
464 0.2
465 0.21
466 0.22
467 0.22
468 0.18
469 0.16
470 0.14
471 0.16
472 0.17
473 0.17
474 0.19
475 0.19
476 0.18
477 0.21
478 0.25
479 0.23
480 0.23
481 0.27
482 0.24
483 0.26
484 0.28
485 0.22
486 0.17
487 0.17
488 0.16
489 0.14
490 0.14
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.09
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.1
504 0.13
505 0.17
506 0.19
507 0.22
508 0.25
509 0.28
510 0.28
511 0.29
512 0.27
513 0.25
514 0.24
515 0.2
516 0.18
517 0.15
518 0.15
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.08
538 0.08
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.07
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.1
556 0.09
557 0.1
558 0.19
559 0.17
560 0.22
561 0.22
562 0.23
563 0.21
564 0.21
565 0.22
566 0.14
567 0.14
568 0.1
569 0.11
570 0.1
571 0.1
572 0.12
573 0.1
574 0.11
575 0.14
576 0.14
577 0.15
578 0.21
579 0.29
580 0.36
581 0.42
582 0.44
583 0.42
584 0.47
585 0.48
586 0.46
587 0.42
588 0.33
589 0.27
590 0.25
591 0.22
592 0.15
593 0.14
594 0.11
595 0.13
596 0.15
597 0.16
598 0.19
599 0.2
600 0.22
601 0.3
602 0.32
603 0.26
604 0.25
605 0.24
606 0.28
607 0.28
608 0.26
609 0.18
610 0.17
611 0.23
612 0.28
613 0.3
614 0.24
615 0.24
616 0.25
617 0.31
618 0.3
619 0.27
620 0.23
621 0.21
622 0.2
623 0.19
624 0.17
625 0.12
626 0.1
627 0.07
628 0.07
629 0.05
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.05
639 0.07
640 0.1
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.13
645 0.14
646 0.13
647 0.13
648 0.1
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.08
653 0.06
654 0.05
655 0.04
656 0.04
657 0.05
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.05
662 0.05
663 0.06
664 0.07
665 0.07
666 0.09
667 0.1
668 0.11
669 0.18
670 0.18
671 0.19
672 0.21
673 0.23
674 0.21
675 0.23
676 0.27
677 0.26
678 0.27
679 0.26
680 0.25
681 0.27
682 0.26
683 0.24
684 0.18
685 0.12
686 0.11
687 0.1
688 0.08
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.03
698 0.03
699 0.03
700 0.03
701 0.04
702 0.05
703 0.07
704 0.08
705 0.11
706 0.11
707 0.11
708 0.12
709 0.11
710 0.14
711 0.11
712 0.12
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.08
717 0.08
718 0.04
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.03
724 0.03
725 0.03
726 0.04
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.06
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.06
739 0.05
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.09
744 0.1
745 0.1
746 0.13
747 0.13
748 0.12
749 0.1
750 0.1
751 0.1
752 0.08
753 0.13
754 0.11
755 0.1
756 0.1
757 0.12
758 0.12
759 0.13
760 0.14
761 0.1
762 0.11
763 0.11
764 0.11
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.09
769 0.08
770 0.06
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.05
775 0.05
776 0.04
777 0.04
778 0.05
779 0.06
780 0.08
781 0.08
782 0.08
783 0.09
784 0.09
785 0.09
786 0.1
787 0.08
788 0.07
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.11
793 0.1
794 0.12
795 0.12
796 0.13
797 0.13
798 0.13
799 0.16
800 0.16
801 0.17
802 0.18
803 0.21
804 0.21
805 0.2
806 0.21
807 0.19
808 0.18
809 0.16
810 0.14
811 0.12
812 0.13
813 0.15
814 0.13
815 0.12
816 0.14
817 0.14
818 0.14
819 0.12
820 0.13
821 0.1
822 0.1
823 0.1
824 0.11
825 0.11
826 0.14
827 0.16
828 0.14
829 0.17
830 0.18
831 0.17
832 0.17
833 0.22
834 0.23
835 0.27
836 0.34
837 0.33
838 0.36
839 0.38
840 0.38
841 0.32
842 0.3
843 0.27
844 0.2
845 0.2
846 0.17
847 0.17
848 0.15
849 0.14
850 0.14
851 0.11
852 0.12
853 0.12
854 0.11
855 0.12
856 0.13
857 0.12
858 0.12
859 0.11
860 0.1
861 0.09
862 0.08
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.05
867 0.06
868 0.05
869 0.05
870 0.05
871 0.06
872 0.08
873 0.1
874 0.1
875 0.1
876 0.11
877 0.11
878 0.12
879 0.12
880 0.11
881 0.09
882 0.09
883 0.09
884 0.08
885 0.08
886 0.07
887 0.07
888 0.05
889 0.05
890 0.05
891 0.05
892 0.05
893 0.05
894 0.05
895 0.06
896 0.07
897 0.09
898 0.09
899 0.12
900 0.22
901 0.32
902 0.38
903 0.38
904 0.41
905 0.46
906 0.56
907 0.61
908 0.58
909 0.56
910 0.55
911 0.55
912 0.53
913 0.46
914 0.37
915 0.28
916 0.23
917 0.16
918 0.15
919 0.16
920 0.15
921 0.15
922 0.15
923 0.15
924 0.15
925 0.15
926 0.13
927 0.11
928 0.11
929 0.12
930 0.12
931 0.14
932 0.13
933 0.12
934 0.11
935 0.12
936 0.13
937 0.12
938 0.14
939 0.13
940 0.13
941 0.13
942 0.14
943 0.14
944 0.14
945 0.17
946 0.18
947 0.17
948 0.17
949 0.17
950 0.16
951 0.17
952 0.16
953 0.14
954 0.11
955 0.12
956 0.11
957 0.12
958 0.17
959 0.19
960 0.19
961 0.18
962 0.18
963 0.17
964 0.21
965 0.21
966 0.17
967 0.14
968 0.14
969 0.14
970 0.15
971 0.15
972 0.14
973 0.14
974 0.14
975 0.17
976 0.16
977 0.21
978 0.24
979 0.29
980 0.31
981 0.29
982 0.27
983 0.25
984 0.25
985 0.21
986 0.19
987 0.15
988 0.1
989 0.13
990 0.13
991 0.12
992 0.12
993 0.11
994 0.09
995 0.11
996 0.11
997 0.08
998 0.09
999 0.11
1000 0.12
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.16
1004 0.17
1005 0.18
1006 0.19
1007 0.17
1008 0.16
1009 0.16
1010 0.16
1011 0.13
1012 0.12
1013 0.13
1014 0.11
1015 0.12
1016 0.13
1017 0.13
1018 0.12
1019 0.14
1020 0.15
1021 0.15
1022 0.15
1023 0.15
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.13
1027 0.09
1028 0.08
1029 0.1
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.1
1033 0.1
1034 0.1
1035 0.11
1036 0.12
1037 0.13
1038 0.13
1039 0.14
1040 0.16
1041 0.2
1042 0.22
1043 0.24
1044 0.27
1045 0.25
1046 0.27
1047 0.31
1048 0.32
1049 0.29
1050 0.27
1051 0.26
1052 0.27
1053 0.26
1054 0.26
1055 0.21
1056 0.22
1057 0.22
1058 0.22
1059 0.22
1060 0.18
1061 0.17
1062 0.16
1063 0.15
1064 0.18
1065 0.22
1066 0.23
1067 0.23
1068 0.24
1069 0.24
1070 0.22
1071 0.23
1072 0.16
1073 0.12
1074 0.1
1075 0.09
1076 0.12
1077 0.13
1078 0.13
1079 0.14
1080 0.17
1081 0.2
1082 0.27
1083 0.29
1084 0.27
1085 0.34
1086 0.41
1087 0.45
1088 0.48
1089 0.48
1090 0.46
1091 0.44
1092 0.41
1093 0.34
1094 0.26