Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C5T4

Protein Details
Accession H6C5T4    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-42EDPFKDKSTRKARDDKTTLSHydrophilic
96-115AMSGKFSKKLRLKGKGHEFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-77AKKRKPIAK
99-110GKFSKKLRLKGK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MATDPLTAATVDDLFNFDSTDDEDPFKDKSTRKARDDKTTLSPRPAKRKAGDNNDLGADLGLDEEVKIAKKRKPIAKLDEARLLSAEGIPKLRALAMSGKFSKKLRLKGKGHEFSDVARLLNYYQLWLDNLYPRAKFADGLQLIEKVGHSKRMQTMRKEWIDEGKPGYVKEKASRPQDGEKGKKTDELYGGDEPAAEPTSNELAPGDDSLFIPDTRASDDVPNFNDEMPEDDELDALLAEQETAGSARPAPPPTRSKRTIDDDSEGEDDPDALLAEQDTRRVPQTATATPPVQSKSTSRPKTSPFEDDDDDEEDMDDLDALLAEQEARATLTTTQPRTELAPRSTNNESSPRRTEEKEEATKAVADNDDLGDLDLDLDEDDDLDALLAEQELRQTEAAMQRPSQTSTTNTGISSPRPSAHAEQPDLDVADGDDMFSSSPVRTNPNTKDFQASYETSVFVASSTTKALDDMQQGSEYAQGAGPKTTPEQEYAGGLEAANPSAEVELEAELDSKETEEPQQEHEQEQEQNTSSGQDRNEGLERLDDDNGDEEVEAPQETTAQEGRRGGAEKQGAAEVGPEAEVGLEDGDNEELEAEDMFSSSPVQNDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.12
4 0.1
5 0.1
6 0.12
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.19
12 0.21
13 0.24
14 0.29
15 0.29
16 0.37
17 0.47
18 0.55
19 0.62
20 0.71
21 0.74
22 0.78
23 0.81
24 0.76
25 0.76
26 0.77
27 0.72
28 0.71
29 0.73
30 0.71
31 0.75
32 0.77
33 0.76
34 0.7
35 0.76
36 0.77
37 0.78
38 0.78
39 0.71
40 0.65
41 0.57
42 0.52
43 0.42
44 0.32
45 0.21
46 0.13
47 0.09
48 0.06
49 0.05
50 0.04
51 0.05
52 0.07
53 0.09
54 0.15
55 0.21
56 0.26
57 0.34
58 0.43
59 0.51
60 0.59
61 0.66
62 0.7
63 0.75
64 0.79
65 0.76
66 0.75
67 0.67
68 0.59
69 0.49
70 0.4
71 0.3
72 0.24
73 0.22
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.13
82 0.19
83 0.2
84 0.27
85 0.32
86 0.34
87 0.37
88 0.39
89 0.46
90 0.45
91 0.52
92 0.55
93 0.6
94 0.64
95 0.7
96 0.8
97 0.79
98 0.74
99 0.68
100 0.59
101 0.5
102 0.51
103 0.41
104 0.31
105 0.22
106 0.21
107 0.17
108 0.2
109 0.18
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.15
116 0.17
117 0.21
118 0.23
119 0.22
120 0.23
121 0.24
122 0.23
123 0.22
124 0.18
125 0.24
126 0.22
127 0.24
128 0.24
129 0.22
130 0.22
131 0.22
132 0.2
133 0.15
134 0.15
135 0.2
136 0.2
137 0.24
138 0.31
139 0.41
140 0.48
141 0.5
142 0.57
143 0.59
144 0.63
145 0.61
146 0.55
147 0.54
148 0.5
149 0.47
150 0.41
151 0.36
152 0.33
153 0.3
154 0.31
155 0.26
156 0.26
157 0.28
158 0.34
159 0.37
160 0.42
161 0.46
162 0.48
163 0.51
164 0.56
165 0.6
166 0.59
167 0.59
168 0.58
169 0.54
170 0.54
171 0.48
172 0.46
173 0.41
174 0.36
175 0.34
176 0.3
177 0.29
178 0.24
179 0.23
180 0.17
181 0.15
182 0.13
183 0.08
184 0.07
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.14
206 0.16
207 0.18
208 0.19
209 0.2
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.07
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.07
235 0.11
236 0.14
237 0.16
238 0.21
239 0.3
240 0.37
241 0.44
242 0.46
243 0.47
244 0.51
245 0.56
246 0.57
247 0.51
248 0.47
249 0.4
250 0.38
251 0.36
252 0.29
253 0.22
254 0.16
255 0.12
256 0.09
257 0.08
258 0.05
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.14
271 0.19
272 0.2
273 0.22
274 0.24
275 0.24
276 0.24
277 0.26
278 0.23
279 0.19
280 0.18
281 0.17
282 0.23
283 0.33
284 0.37
285 0.38
286 0.4
287 0.45
288 0.49
289 0.5
290 0.46
291 0.38
292 0.38
293 0.36
294 0.33
295 0.29
296 0.25
297 0.22
298 0.17
299 0.14
300 0.1
301 0.08
302 0.07
303 0.05
304 0.03
305 0.02
306 0.02
307 0.02
308 0.02
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.05
318 0.11
319 0.16
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.19
324 0.21
325 0.25
326 0.25
327 0.24
328 0.3
329 0.3
330 0.35
331 0.37
332 0.36
333 0.33
334 0.37
335 0.36
336 0.35
337 0.38
338 0.38
339 0.39
340 0.39
341 0.41
342 0.4
343 0.45
344 0.45
345 0.43
346 0.39
347 0.36
348 0.35
349 0.31
350 0.25
351 0.16
352 0.11
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.02
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.1
383 0.15
384 0.19
385 0.2
386 0.2
387 0.23
388 0.24
389 0.26
390 0.24
391 0.21
392 0.2
393 0.23
394 0.26
395 0.24
396 0.22
397 0.23
398 0.23
399 0.23
400 0.24
401 0.21
402 0.18
403 0.19
404 0.23
405 0.25
406 0.3
407 0.34
408 0.32
409 0.32
410 0.32
411 0.31
412 0.28
413 0.23
414 0.16
415 0.09
416 0.09
417 0.07
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.05
425 0.08
426 0.1
427 0.15
428 0.18
429 0.26
430 0.32
431 0.38
432 0.42
433 0.41
434 0.46
435 0.41
436 0.41
437 0.39
438 0.33
439 0.3
440 0.28
441 0.27
442 0.2
443 0.2
444 0.16
445 0.11
446 0.11
447 0.08
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.09
453 0.11
454 0.14
455 0.17
456 0.18
457 0.19
458 0.18
459 0.18
460 0.18
461 0.19
462 0.15
463 0.12
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.14
471 0.17
472 0.17
473 0.18
474 0.19
475 0.19
476 0.2
477 0.19
478 0.19
479 0.15
480 0.14
481 0.13
482 0.11
483 0.11
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.12
502 0.17
503 0.19
504 0.24
505 0.32
506 0.33
507 0.34
508 0.35
509 0.36
510 0.34
511 0.35
512 0.33
513 0.27
514 0.26
515 0.25
516 0.24
517 0.23
518 0.23
519 0.21
520 0.21
521 0.21
522 0.25
523 0.29
524 0.27
525 0.25
526 0.25
527 0.27
528 0.26
529 0.26
530 0.21
531 0.18
532 0.19
533 0.19
534 0.15
535 0.12
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.09
540 0.08
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.11
545 0.15
546 0.16
547 0.2
548 0.21
549 0.23
550 0.26
551 0.29
552 0.26
553 0.3
554 0.32
555 0.29
556 0.29
557 0.29
558 0.25
559 0.22
560 0.22
561 0.14
562 0.11
563 0.1
564 0.08
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.07
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.09
586 0.1