Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6C4K3

Protein Details
Accession H6C4K3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
539-558HLSKAAKKNAKKREAKKAAAHydrophilic
611-640LEPPTGPKKERSRSNSRRQRRDSTHNHANGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
542-560KAAKKNAKKREAKKAAAAA
589-631RSPDGRGHQRSRSRNYVPPPPGLEPPTGPKKERSRSNSRRQRR
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MSVRTQFAFRTLKGIGVVNGAPSYEPLPGFEKPQGNLRCCVYSPCGRYFAWAAPESVSIINADTGAIISTLPAENVFELGFSPLGTYVITWQRPSKDENGDAVKNLKVWLVNDEKAAAEGVDKEPVARFVQKSQTGWNLQYTYDEAFCARVVTNEVQIYESHDLTNVWNKIRVEGVADFAVSPGKNHAIAVFVPERKGQPAAVRVYSVPNFTNPVSQKNFFKGDKVQLKWNDNGTSLIVLAQTEVDKTGKSYYGETTLYLLSANGGFDSRIDLDKEGPIHDVAWSPKSNSFAVVYGYMPAKTVIFNAKAQPVHSFPLAPRNTVLFSPHGRFVLVAGFGNLAGQMDIYDLEKDMAKICTIEASNASVCEWSPDGLHILTATTSPRLRVDNGIRIWHAGGPLMYNEDMNELYHVCWRPQPASQHPLPANPFSPMPVPHPSAVEYMAARKTPSKPAGAYRPPGARGQVTPLAFKREDEGGAAYVRGEGVSSFSNSVNGFGKPRQRIVPGAEPVEGKAPLPPGAAPGGGVSLTGTGEGADDEHLSKAAKKNAKKREAKKAAAAAAAAKGESGTGTTGTANLAAPEHRGKSESRSPDGRGHQRSRSRNYVPPPPGLEPPTGPKKERSRSNSRRQRRDSTHNHANGTPKGPAAQSKQPRNGAPTNINTTAPTNAASQAQQAPPELEVTSPVTPGGSSQDKKVRGLLKKIRAIEDLKMRFAGGEKLEDTQMRKISTEDAVRKELAGLGYNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.25
3 0.23
4 0.23
5 0.19
6 0.19
7 0.17
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.18
15 0.19
16 0.23
17 0.29
18 0.32
19 0.31
20 0.41
21 0.46
22 0.45
23 0.48
24 0.48
25 0.45
26 0.41
27 0.44
28 0.41
29 0.42
30 0.44
31 0.44
32 0.45
33 0.41
34 0.43
35 0.42
36 0.4
37 0.39
38 0.35
39 0.31
40 0.29
41 0.29
42 0.27
43 0.24
44 0.19
45 0.13
46 0.12
47 0.11
48 0.09
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.05
55 0.04
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.12
75 0.19
76 0.21
77 0.24
78 0.28
79 0.32
80 0.34
81 0.39
82 0.4
83 0.4
84 0.42
85 0.46
86 0.48
87 0.46
88 0.45
89 0.43
90 0.37
91 0.3
92 0.27
93 0.22
94 0.17
95 0.17
96 0.22
97 0.25
98 0.25
99 0.25
100 0.26
101 0.24
102 0.22
103 0.21
104 0.15
105 0.09
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.16
113 0.18
114 0.2
115 0.21
116 0.24
117 0.33
118 0.37
119 0.38
120 0.4
121 0.45
122 0.44
123 0.44
124 0.43
125 0.36
126 0.31
127 0.32
128 0.28
129 0.23
130 0.19
131 0.18
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.13
139 0.14
140 0.18
141 0.18
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.22
146 0.21
147 0.2
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.24
153 0.22
154 0.21
155 0.26
156 0.26
157 0.26
158 0.27
159 0.25
160 0.21
161 0.18
162 0.2
163 0.15
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.15
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.17
178 0.2
179 0.19
180 0.2
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.24
185 0.2
186 0.19
187 0.25
188 0.28
189 0.27
190 0.27
191 0.26
192 0.3
193 0.29
194 0.27
195 0.21
196 0.18
197 0.2
198 0.19
199 0.26
200 0.22
201 0.28
202 0.31
203 0.33
204 0.35
205 0.37
206 0.43
207 0.36
208 0.38
209 0.37
210 0.41
211 0.46
212 0.46
213 0.49
214 0.5
215 0.54
216 0.53
217 0.53
218 0.45
219 0.37
220 0.36
221 0.28
222 0.21
223 0.17
224 0.14
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.18
241 0.18
242 0.17
243 0.17
244 0.15
245 0.14
246 0.12
247 0.1
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.15
271 0.15
272 0.16
273 0.18
274 0.2
275 0.2
276 0.18
277 0.18
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.14
293 0.16
294 0.2
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.2
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.13
303 0.22
304 0.22
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.14
312 0.16
313 0.18
314 0.19
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.14
319 0.13
320 0.11
321 0.09
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.17
374 0.2
375 0.25
376 0.27
377 0.28
378 0.26
379 0.25
380 0.25
381 0.2
382 0.16
383 0.1
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.11
398 0.12
399 0.11
400 0.13
401 0.15
402 0.16
403 0.2
404 0.26
405 0.27
406 0.33
407 0.33
408 0.38
409 0.37
410 0.39
411 0.37
412 0.33
413 0.28
414 0.23
415 0.22
416 0.16
417 0.18
418 0.15
419 0.17
420 0.19
421 0.2
422 0.19
423 0.2
424 0.21
425 0.2
426 0.19
427 0.16
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.14
432 0.13
433 0.15
434 0.17
435 0.24
436 0.26
437 0.26
438 0.27
439 0.32
440 0.41
441 0.43
442 0.42
443 0.4
444 0.4
445 0.39
446 0.38
447 0.34
448 0.27
449 0.22
450 0.25
451 0.25
452 0.23
453 0.24
454 0.24
455 0.28
456 0.26
457 0.26
458 0.23
459 0.19
460 0.19
461 0.16
462 0.16
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.06
470 0.05
471 0.04
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.09
476 0.09
477 0.11
478 0.11
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.15
483 0.17
484 0.25
485 0.26
486 0.29
487 0.31
488 0.32
489 0.34
490 0.37
491 0.42
492 0.38
493 0.37
494 0.35
495 0.32
496 0.3
497 0.29
498 0.23
499 0.15
500 0.13
501 0.13
502 0.12
503 0.13
504 0.12
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.1
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.05
514 0.04
515 0.05
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.11
529 0.16
530 0.24
531 0.3
532 0.37
533 0.47
534 0.57
535 0.67
536 0.73
537 0.76
538 0.8
539 0.82
540 0.79
541 0.76
542 0.72
543 0.65
544 0.56
545 0.48
546 0.37
547 0.29
548 0.25
549 0.18
550 0.12
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.07
566 0.11
567 0.14
568 0.15
569 0.15
570 0.17
571 0.18
572 0.25
573 0.33
574 0.36
575 0.39
576 0.41
577 0.45
578 0.51
579 0.59
580 0.61
581 0.62
582 0.62
583 0.65
584 0.7
585 0.75
586 0.75
587 0.75
588 0.71
589 0.69
590 0.69
591 0.71
592 0.65
593 0.62
594 0.6
595 0.53
596 0.53
597 0.48
598 0.44
599 0.36
600 0.4
601 0.44
602 0.43
603 0.42
604 0.46
605 0.53
606 0.6
607 0.67
608 0.68
609 0.69
610 0.75
611 0.85
612 0.87
613 0.87
614 0.9
615 0.88
616 0.9
617 0.87
618 0.87
619 0.86
620 0.85
621 0.85
622 0.79
623 0.74
624 0.67
625 0.65
626 0.59
627 0.52
628 0.44
629 0.34
630 0.31
631 0.29
632 0.32
633 0.32
634 0.37
635 0.44
636 0.52
637 0.59
638 0.63
639 0.64
640 0.65
641 0.64
642 0.62
643 0.59
644 0.56
645 0.55
646 0.52
647 0.49
648 0.44
649 0.4
650 0.35
651 0.28
652 0.23
653 0.17
654 0.17
655 0.18
656 0.17
657 0.19
658 0.23
659 0.24
660 0.24
661 0.24
662 0.24
663 0.22
664 0.23
665 0.19
666 0.13
667 0.14
668 0.17
669 0.16
670 0.15
671 0.15
672 0.13
673 0.13
674 0.13
675 0.17
676 0.22
677 0.22
678 0.3
679 0.38
680 0.4
681 0.42
682 0.49
683 0.51
684 0.5
685 0.6
686 0.62
687 0.64
688 0.69
689 0.72
690 0.69
691 0.66
692 0.61
693 0.58
694 0.58
695 0.52
696 0.47
697 0.43
698 0.38
699 0.34
700 0.32
701 0.31
702 0.23
703 0.24
704 0.22
705 0.24
706 0.27
707 0.3
708 0.32
709 0.32
710 0.35
711 0.32
712 0.32
713 0.31
714 0.31
715 0.35
716 0.41
717 0.41
718 0.41
719 0.44
720 0.44
721 0.43
722 0.4
723 0.36
724 0.29